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Renvoise 2593035580k th pdf

AIX-MARSEILLE UNIVERSITE FACULTE DE MEDECINE DE MARSEILLE ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE THESE DE DOCTORAT Présentée et publiquement soutenue devant LA FACULTÉ DE MÉDECINE DE MARSEILLE Le lundi juillet par Aurélie RENVOISÉ Née le Décembre à La Seyne sur Mer Applicabilité de la PCR universelle ? S comme outil d ? identi ?cation et de détection bactérienne en laboratoire hospitalier de bactériologie En vue d ? obtention du grade de DOCTORAT d ? AIX-MARSEILLE UNIVERSITÉ Spécialité Maladies Infectieuses Composition du Jury Pr Jean-Louis MEGE Pr Florence DOUCET-POPULAIRE Pr Guillaume ARLET Pr Vincent JARLIER Président du Jury Rapporteur Rapporteur Directeur de thèse Directeur du Laboratoire ER UPRES EA recherche expérimentale épidémiologique et moléculaire sur la résistance aux antibiotiques ? Directeur Pr Vincent Jarlier Faculté de médecine Pitié-Salpêtrière Université Pierre et Marie Curie Paris VI Cette structure est intégrée à l ? IFR immunité ?? cancer - infection ? Faculté de médecine Pitié-Salpêtrière Directeurs Pr Brigitte Autran et Pr David Klatzmann CAvant propos Le format de présentation de cette thèse correspond à une recommandation de la spécialité Maladies Infectieuses et Microbiologie à l ? intérieur du Master des Sciences de la Vie et de la Santé qui dépend de l ? Ecole Doctorale des Sciences de la Vie de Marseille Le candidat est amené à respecter des règles qui lui sont imposées et qui comportent un format de thèse utilisé dans le Nord de l ? Europe et qui permet un meilleur rangement que les thèses traditionnelles Par ailleurs la partie introduction et bibliographie est remplacée par une revue envoyée dans un journal a ?n de permettre une évaluation extérieure de la qualité de la revue et de permettre à l ? étudiant de commencer le plus tôt possible une bibliographie exhaustive sur le domaine de cette thèse Par ailleurs la thèse est présentée sur article publié accepté ou soumis associé d ? un bref commentaire donnant le sens général du travail Cette forme de présentation a paru plus en adéquation avec les exigences de la compétition internationale et permet de se concentrer sur des travaux qui béné ?cieront d ? une di ?usion internationale Professeur Didier RAOULT CSOMMAIRE Résumé Abstract Abréviations Introduction Le ribosome bactérien L ? ARNr S dé ?nition origines et utilisation Dé ?nition d ? une espèce bactérienne Place de la PCR universelle S dans l ? identi ?cation bactérienne Place de la PCR universelle S dans la détection de bactéries à partir de prélèvements Objectifs du travail personnel - Identi ?cation de souches de diagnostic phénotypique impossible ou di ?cile par PCR universelle S ? Gordonia sputi bacteremia Renvoise A Harle J-R Roux V Raoult D Emerg Infect Dis Sep - Commentaire Article ? Wohlfahrtiimonas chitiniclastica bacteremia in homeless woman Rebaudet S Genot S Renvoise A Fournier P-E Stein A Emerg Infect Dis Jun - Commentaire Article - Détection bactérienne dans les prélèvements humains par PCR universelle S ? Kytococcus schroeteri a rare agent of endocarditis Renvoise A Roux V Thuny