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Fiche cours medisup Paris UE BIOCHIMIE FICHE DE COURS N STRUCTURE ET PROPRIETES DES PROTEINES Thématique abordée en séance B Notion tombée fois au concours B B Notion tombée fois au concours B B B Notion tombée fois ou plus au concours Nouveauté au progra

Paris UE BIOCHIMIE FICHE DE COURS N STRUCTURE ET PROPRIETES DES PROTEINES Thématique abordée en séance B Notion tombée fois au concours B B Notion tombée fois au concours B B B Notion tombée fois ou plus au concours Nouveauté au programme cette année CI- STRUCTURE PRIMAIRE DES PROTEINES LA LIAISON PEPTIDIQUE DEFINITIONS B Liaison peptidique liaison covalente amide de type CONH qui est constituée à l ? intérieur des cellules lors de la traduction lecture de l ? ARN messager par tout le système complexe de la synthèse des protéines Elle s ? établit entre la fonction carboxylique d ? un AA et la fonction amine d ? un autre AA Peptides polymères d ? acides aminés liés entre eux par une liaison peptidique Oligopeptides ?? de AAs dipeptides AAs tripeptides AAs ? décapeptides AAs Polypeptides jusqu ? à plusieurs B dizaines de milliers d ? AAs taille moyenne ?? Da taille moyenne d ? un AA ?? Da Protéines polypeptides de taille kDa Structure primaire d ? une protéine nombre d ? AAs et ordre séquence dans lequel ils sont associés les uns aux autres La liaison peptidique est plane Les électrons des orbitales ? sont délocalisés entre les cortèges électroniques des atomes N C et O hybridés sp Elle est stabilisée par résonnance délocalisation des électrons entre formes mésomères neutre et chargée PROPRIETES Les atomes C n CONH et C n sont ?gés immobilisés dans le même plan Ceci est dû à la délocalisation d ? électrons entre ces atomes Dans la nature les conditions qui permettraient une rotation de la liaison peptidique B ne se produisent quasiment jamais les atomes N C O ne pouvant bouger qu ? en bloc les probabilités de formation de structures di ?érentes de conformations qu ? une protéine peut adopter dans l ? espace sont restreintes Toutes les liaisons peptidiques mettant en jeu les mêmes atomes elles représentent des modules de longueurs distances inter- atomiques exactement identiques La distance entre deux carbones d ? AAs qui se suivent est toujours de angstr? ms La longueur d ? une cha? ne peptidique B B est donc nombre d ? AAs x ? La structure des protéines est modulaire parce qu ? elles sont constituées de di ?érentes chaines latérales d ? AAs mais elle ne peut pas être réalisée de n ? importe quelle façon car les liaisons peptidiques ont toutes de la même longueur ? la constance des dimensions de la liaison peptidique détermine la structure spatiale des protéines Les groupements autour des atomes C et N de la liaison sont en con ?guration trans Dans cette con ?guration spatiale l ? encombrement stérique est moindre car les forces de répulsion entre les groupements sont moindres moins d ? interactions stériques entre les cha? nes latérales R de carbones adjacents NOMENCLATURE er AA NH du C toujours libre et protonnée NH extrémité amino- terminale N-terminale Dernier AA COOH libre COO - extrémité carboxy-terminale C-terminale sens d ? écriture des protéines