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These dumont UNIVERSITE MONTPELLIER II SCIENCES ET TECHNIQUES DU LANGUEDOC THESE pour obtenir le grade de DOCTEUR DE L'UNIVERSITE MONTPELLIER II Section Biotechnologie et Microbiologie Ecole Doctorale Sciences des Procédés ?? Sciences des aliments présent

UNIVERSITE MONTPELLIER II SCIENCES ET TECHNIQUES DU LANGUEDOC THESE pour obtenir le grade de DOCTEUR DE L'UNIVERSITE MONTPELLIER II Section Biotechnologie et Microbiologie Ecole Doctorale Sciences des Procédés ?? Sciences des aliments présentée par Maxime Dumont APPORTS DE LA MODELISATION DES INTERACTIONS POUR UNE COMPREHENSION FONCTIONNELLE D ? UN ECOSYSTEME APPLICATION A DES BACTERIES NITRIFIANTES EN CHEMOSTAT soutenue le décembre M Philippe Lemenceau M Jean-Christophe Poggiale M Jean-Jacques Godon M Jérôme Harmand M Antoine Sciandra Mme Tatiana Vallaeys M Denis Dochain JURY directeur de recherche INRA rapporteur professeur UMR CNRS rapporteur directeur de recherche INRA directeur de thèse chargé de recherche INRA directeur de thèse directeur de recherche UMR examinateur professeur UMR Ecolag présidente du jury professeur Université de Louvain examinateur C CUNIVERSITE MONTPELLIER II SCIENCES ET TECHNIQUES DU LANGUEDOC THESE pour obtenir le grade de DOCTEUR DE L'UNIVERSITE MONTPELLIER II Section Biotechnologie et Microbiologie Ecole Doctorale Sciences des Procédés ?? Sciences des aliments présentée par Maxime Dumont APPORTS DE LA MODELISATION DES INTERACTIONS POUR UNE COMPREHENSION FONCTIONNELLE D ? UN ECOSYSTEME APPLICATION A DES BACTERIES NITRIFIANTES EN CHEMOSTAT soutenue le décembre M Philippe Lemenceau M Jean-Christophe Poggiale M Jean-Jacques Godon M Jérôme Harmand M Antoine Sciandra Mme Tatiana Vallaeys M Denis Dochain JURY directeur de recherche INRA rapporteur professeur UMR CNRS rapporteur directeur de recherche INRA directeur de thèse chargé de recherche INRA directeur de thèse directeur de recherche UMR examinateur professeur UMR Ecolag présidente du jury professeur Université de Louvain examinateur C CREMERCIEMENTS Voilà Nous y sommes La thèse achevée la soutenance e ?ectuée ? Une page se tourne l ? aventure narbonnaise touche à sa ?n et avec elle les huit années d ? études qui ont conduit à ce manuscrit ? Puisqu ? on parle d ? études je voudrais tout d ? abord remercier les profs au sens large qui m ? ont tant apporté durant toutes ces années non non cela n ? a rien à voir avec le fait que je sois un ?ls de profs ? Merci à cette prof de bio dont je ne connais ni le nom ni le prénom et que j ? ai détesté durant de nombreuses semaines voir de nombreux mois pour m ? avoir recalé d ? un point au bac Sa clairvoyance m ? étonnera toujours sans elle cette thèse n ? existerait pas ? Merci à Bernard Calvez et à tous les profs de l ? IUT Génie Biologique de Lyon pour leurs enseignements si passionnants même s ? il est vrai que j ? en ai raté quelques ? un Quelle idée aussi de mettre des cours le vendredi matin alors que les soirées étudiantes sont le jeudi soir ? Merci à Jérôme Boissier Olivier Vernaux André Théron Guillaume Mitta Anne Rognon Hélène Moné Richard Galinier Jean-François Allienne et Claude Combes du Centre de Biologie et d ? Ecologie Tropicale et Méditerranéenne de Perpignan Les deux stages de six mois passés à vos côtés ont été extraordinaires Je sais tout ce que je