1 1 V.1.0 MAI 2014 SOMMAIRE 1. DETERMINATION DE LA SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUE

1 1 V.1.0 MAI 2014 SOMMAIRE 1. DETERMINATION DE LA SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES 3 1. 1. Préparation des milieux utiles aux méthodes CA-SFM / EUCAST pour la diffusion en milieu gélosé et la détermination des CMI par microdilution en milieu liquide 3 1.1.1. Diffusion en gélose : milieux 3 1.1.2. Détermination des CMI en milieu liquide (microdilution) : milieux 4 1. 2. Conditions techniques générales pour les méthodes de diffusion 6 1. 3. Contrôle de qualité interne 12 1.3.1. Staphylococcus aureus ATCC 29213 (NCTC 12973 ; CIP 103429) 14 1.3.2. Streptococcus pneumoniae ATCC 49619 (NCTC 12977 ; CIP 104340). (Souche de sensibilité intermédiaire à la pénicilline) 15 1.3.3. Enterococcus faecalis ATCC 29212 (NCTC 12697 ; CIP 103214) 16 1.3.4. Haemophilus influenzae NCTC 8468 (CIP 54.94) 17 1.3.5. Campylobacter jejuni ATCC 33560 (NCTC 11351 ; CIP702) 17 1.3.6. Escherichia coli ATCC 25922 (NCTC 12241 ; CIP 76.24) 18 1.3.7. Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 (NCTC 12903 ; CIP 76110) 19 2. RESISTANCES NATURELLES AUX ANTIBIOTIQUES DES PRINCIPALES ESPECES BACTERIENNES D’INTERET MEDICAL 20 2. 1. Bacilles à Gram négatif non exigeants 20 2.1.1. Entérobactéries 20 2.1.2. Aeromonas 20 2.1.3. Bacilles à Gram négatif non fermentaires 20 2. 2. Bacilles à Gram négatif exigeants 21 2. 3. Coques à Gram positif 21 2. 4. Bacilles à Gram positif 21 2. 5. Coques à Gram négatif 21 2. 6. Bactéries anaérobies strictes 21 3. CONCENTRATIONS CRITIQUES PK/PD NON RELIEES A UNE ESPECE 23 4. TABLEAUX DES CONCENTRATIONS CRITIQUES POUR L’INTERPRETATION DES CMI ET DES DIAMÈTRES DES ZONES D’INHIBITION 28 4.1. Enterobacteriaceae 29 4.2. Pseudomonas spp. 37 4.3. Acinetobacter spp. 40 4.4 Stenotrophomonas maltophilia 43 4.5. Staphylococcus spp. 45 4.6. Enterococcus spp. 54 4.7. Streptococcus pneumoniae 60 4.8. Streptocoques des groupes A, B, C ou G 68 4.9. Autres streptocoques 75 4.10. Listeria Monocytogenes 82 4.11. Corynébactéries 84 4.12. Haemophilus influenzae 85 4.13. Moraxella catarrhalis 92 4.14. Pasteurella multocida 96 4.15. Helicobacter pylori 98 4.16. Campylobacter spp. 100 5. ANTIBIOGRAMME VETERINAIRE DU COMITE DE L’ANTIBIOGRAMME DE LA SOCIETE FRANCAISE DE MICROBIOLOGIE 102 © Copyright 2014 - Société Française de Microbiologie Tous droits de traduction, d’adaptation et de reproduction par tous procédés réservés pour tous pays. Toute reproduction ou représentation intégrale ou partielle par quelque procédé que ce soit de ce document, faite sans autorisation expresse et écrite du Comité de l’antibiogramme de la Société Française de Microbiologie (28, rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15) est illicite et constitue une contrefaçon. Seules sont autorisées, d’une part, les reproductions strictement réservées à l’usage du copiste et non-destinées à une utilisation collective, et d’autre part, les courtes citations justifiées par le caractère scientifique ou d’information de l’œuvre dans laquelle elles sont incorporées (art. L. 122-4, L. 122-5 et L. 335-2 du Code de la propriété intellectuelle). 2 2 V.1.0 MAI 2014 AVANT-PROPOS Le CA-SFM / EUCAST (EUropean Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) est heureux de vous proposer les recommandations 2014 (V1.0, janvier 2014) relatives : • aux conditions de détermination de la sensibilité des bactéries aux antibiotiques par diffusion en gélose, • aux valeurs des diamètres et concentrations critiques des antibiotiques. Les nouvelles recommandations 2014 du CA-SFM / EUCAST sont le résultat d’un remaniement complet des méthodes d’étude de la sensibilité aux antibiotiques par diffusion (inoculum bactérien plus lourd, charge de certains disques modifiées, parfois milieu gélosé), de la prise en compte de données récentes de PK/ PD et enfin de l’analyse critique des données cliniques. Cette démarche s’est déroulée dans le cadre de l’harmonisation européenne menée par l’EUCAST dont le CA-SFM est un membre actif depuis de nombreuses années. De nombreuses propositions faites par le CA-SFM / EUCAST ont été prises en compte par l’EUCAST tout au long de la démarche. Chaque genre ou espèce bactérien a fait l’objet d’un examen approfondi par des groupes de travail spécifiques du CA-SFM / EUCAST. Les recommandations ont ensuite été revues en détail par l’ensemble du comité pour approbation finale. Le CA-SFM informe que les recommandations 2013 du CA-SFM et 2014 du CA-SFM / EUCAST sont opposables vis-à-vis de l’accréditation jusqu’au 30 juin 2015. Après cette date, seul le CA-SFM / EUCAST le sera. Cette 1ère version est sujette à évolution. Les modifications seront ajoutées en ligne dans les chapitres concernés et seront signalées dans le tableau « Modifications » situé en début d’ouvrage. Cependant, le document papier ne sera édité qu’une seule fois par an. Pour certains genres ou espèces bactériens, l’EUCAST ne propose pas encore de diamètres et/ou de concentrations critiques. Dans ces cas, le CA-SFM / EUCAST a conservé la méthodologie et les valeurs du communiqué 2013. Il s’agit de Neisseria gonorrhoeae, Neisseria meningitidis et des bactéries anaérobies. Certaines recommandations restent encore provisoires en attente de données complémentaires. Dans un avenir proche, les règles d’interprétation (« experts rules ») de l’EUCAST, ainsi que les recommandations pour la détection des résistances, seront disponibles en français. L’application des recommandations 2014 va entraîner de profondes modifications des pratiques dans nos laboratoires, en particulier pour les utilisateurs de la méthode par diffusion et va imposer de nouveaux paramétrages de nos systèmes de gestion et d’interprétation des données. Dans ce cadre, les Evaluations Externes de la Qualité (EEQ) nationales ou volontaires en matière de tests de sensibilité aux antibiotiques, ainsi que d’autres types d’EEQ, ont un rôle essentiel pour s’assurer que les laboratoires de bactériologie soient en mesure de générer des résultats adéquats pour les situations les plus fréquentes. Les EEQ peuvent être utilement complétées par des tests «éducatifs» visant à mettre les laboratoires dans des situations rares mais pédagogiques. La lettre d’information du CA-SFM / EUCAST concernant la détection de carbapénèmase chez les entérobactéries est accessible à tous sur le site de la SFM (lien direct ici). Les recommandations définitives sur cette détection sont en cours d’élaboration et paraîtront dès que possible sur le site. Mai 2014. Le CA-SFM / EUCAST 3 3 V.1.0 MAI 2014 1. DETERMINATION DE LA SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES 1. 1. Préparation des milieux utiles aux méthodes CA-SFM / EUCAST pour la diffusion en milieu gélosé et la détermination des CMI par microdilution en milieu liquide 1.1.1. Diffusion en gélose : milieux Gélose Mueller-Hinton (MH) et gélose MH au sang de cheval défibriné et additionnée de β-NAD (MH-F). La gélose MH est employée lors de la méthode de diffusion en gélose pour les bactéries autres que celles à croissance lente. La gélose MH-F additionnée de 5% de sang de cheval défibriné mécaniquement et de 20 mg/L de β-NAD, est employée pour Streptococcus spp. dont Streptococcus pneumoniae, Haemophilus spp., Moraxella catarrhalis, Listeria monocytogenes, Campylobacter spp., Pasteurella multocida et autres bactéries à croissance lente. Les géloses peuvent être achetées prêtes à l’emploi dans le commerce ou être préparées localement comme suit: (ce n’est pas à recommander vis-à-vis de l’accréditation) Réactifs 1. Poudre pour gélose MH du commerce. 2. Sang de cheval défibriné mécaniquement. 3. β-nicotinamide adénine dinucléotide (β-NAD), pureté ≥ 98%. Préparation de la solution mère de β-NAD 1. Dissoudre le β-NAD dans de l’eau désionisée stérile afin d’obtenir une concentration de 20 mg/mL. 2. La filtration stérilisante de la solution mère est réalisée à l’aide d’une membrane de 0,2 µm. 3. La solution mère filtrée se conserve en aliquotes à -20°C, décongelées au fur et à mesure des besoins. Ne pas recongeler les solutions inutilisées. Préparation des géloses 1. Préparer et autoclaver la gélose MH en fonction des recommandations du fabricant. 2. Ramener la température à 42-45°C. 3. Pour préparer la gélose MH-F, ajouter stérilement 50 mL de sang de cheval défibriné et 1 mL de la solution mère de β-NAD par litre de milieu. Bien agiter et répartir immédiatement. 4. Répartir le milieu en boîtes de Petri stériles de façon à obtenir une épaisseur de 4 mm ± 0.5 mm (soit environ 25 mL par boîte de Petri de 90 mm de diamètre, 31 mL par boîte de Petri de 100 mm de diamètre, 71 mL par boîte de Petri de 150 mm de diamètre, 40 mL par boîte de Petri carrée de 100 mm) 5. Laisser la gélose prendre avant de déplacer les boîtes. 6. La surface de la boîte doit être sèche avant utilisation. Le séchage des boîtes dépend des conditions de stockage et des moyens de séchage. Ne pas dessécher la gélose. Conservation des géloses 1. Conserver les boîtes de Petri dans des sachets en plastique ventilés à 8-10°C. Si les boîtes de Petri doivent être conservées plus de 7 jours, il existe une alternative qui consiste à les conserver à 4-8°C, en sachet plastique scellé. 2. En cas de fabrication au laboratoire, les conditions de séchage, de conservation des boîtes et de durée de vie à la paillasse devront être déterminées dans le cadre du programme d’assurance qualité. 4 4 V.1.0 MAI 2014 Conservation des géloses 3. Les boîtes achetées dans le commerce seront conservées selon les indications du fabricant et employées avant la limite de péremption. Contrôle de qualité 1. Employer une électrode de contact pour vérifier que le pH se situe entre 7,2 et 7,4. 2. Contrôler l’épaisseur de la uploads/Geographie/ rapport-comite-de-l-x27-antibiogramme-sfm-2014.pdf

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