Gymnase de Burier 2021 L!Antibiorésistance Adrien MASOERO Pourquoi l!antibiorés

Gymnase de Burier 2021 L!Antibiorésistance Adrien MASOERO Pourquoi l!antibiorésistance s!est développée aussi rapidement ces dernières années ? Avec maître répondant Alexandra CONSTANTIN Gymnase de Burier, travail de maturité Adrien Masoero 2 Remerciements : Je tiens à exprimer ma reconnaissance envers Madame Constantin pour avoir accepté de superviser mon travail de maturité, ainsi que pour son implication dans ce travail, de m’avoir guidé et aidé à sa réalisation. À Madame Realini, avec tout mon respect et mon admiration, qui m’a donné l’inspiration par la qualité de ses cours. Un grand merci à ma merveilleuse Maman pour son aide et son soutien régulier lors de ce travail, sans elle ce travail de maturité n'aurait jamais vu le jour. Je remercie mon Papa pour son aide à la correction et à la finalisation de ce travail. Un grand merci à ma sœur Audrey, pour la gentillesse et la joie qu’elle apporte en toute circonstance. Je voudrais remercier la Doctoresse Boillat, pour sa disponibilité et son professionnalisme. Je tiens également à remercier la Doctoresse Senn, de m’avoir accordé de son temps, permis de partager son point de vue sur ce sujet et aussi de m’avoir recommandé auprès du Docteur Prod’Hom. Un grand merci au Docteur Prod’Hom pour m’avoir fait visiter le laboratoire de microbiologie du CHUV. Tous les propos qu’il a tenu m’ont beaucoup inspiré pour ma synthèse et j’en suis reconnaissant. Je remercie Beatrice Restelli, pour l’aide qu’elle m’a apporté durant l’écriture de ce travail, que ce soit pour les petits détails et pour certaines informations importantes. Je remercie Noémie Walti, pour avoir répondu régulièrement à mes interrogations, à mes doutes et de m’avoir aidé pour la mise en forme de ce travail. Gymnase de Burier, travail de maturité Adrien Masoero 3 Table des matières Introduction ...................................................................................................... 5 1. Partie Théorique ........................................................................................... 7 1.1 La découverte des Antibiotiques .......................................................... 7 1.1.1 Pasteur ........................................................................................ 7 1.1.2 Fleming ....................................................................................... 7 1.1.3 De 1928 à aujourd'hui ................................................................. 7 1.2 Notions de base .................................................................................... 9 1.2.1 Les bactéries ............................................................................... 9 1.2.2 Les antibiotiques ....................................................................... 11 1.2.2.1 Les mécanismes des antibiotiques .................................. 11 1.3 Définition de l’antibiorésistance .......................................................... 12 1.3.1 Antibiorésistance naturelle ........................................................ 13 1.3.2 Antibiorésistance acquise ......................................................... 13 1.4 Les mécanismes d’antibiorésistance : ................................................ 13 1.5 Les causes .......................................................................................... 16 1.5.1 Un usage inadapté .................................................................... 16 1.5.2 Durée de traitement .................................................................. 16 1.5.2 Utilisation massive en agriculture de pleine air ......................... 16 1.5.3 Utilisation massive dans l’élevage ............................................ 16 1.5.4 Mondialisation du commerce ................................................... 17 1.6 Les conséquences .............................................................................. 18 1.7 Les chiffres .......................................................................................... 19 1.8 L’antibiogramme ................................................................................. 20 2. Partie Pratique ........................................................................................... 21 2.1 Interviews ............................................................................................ 22 2.1.1 Les causes de l’antibiorésistance ............................................. 22 2.1.2 Les antibiotiques induisant facilement des résistances ........... 23 Gymnase de Burier, travail de maturité Adrien Masoero 4 2.1.3 Consommation et antibiothérapie ............................................ 23 2.1.4 Infections résistantes et gestion des cas de résistance ........... 24 2.1.5 Les conséquences de l’antibiorésistance ................................. 25 2.1.6 Prévention ................................................................................. 25 2.2 Comparaison d’antibiogramme ........................................................... 26 3. Synthèse et réponse à la problématique ................................................... 29 Conclusion ..................................................................................................... 31 Glossaire ........................................................................................................ 33 Bibliographie .................................................................................................. 37 Webographie ................................................................................................. 37 Table des illustrations ................................................................................... 42 Annexes ............................................................................................................. Gymnase de Burier, travail de maturité Adrien Masoero 5 Introduction La découverte des anti-infectieux, et plus particulièrement des antibiotiques, a constitué un extraordinaire progrès qui a permis de prolonger la durée de vie moyenne des êtres humains. Elle a aussi permis à la médecine de progresser et de prendre de l’ampleur, car sans antibiotique, aucune intervention chirurgicale ne serait possible, le risque d’infection étant trop élevé. Malheureusement, cette découverte est aujourd!hui victime de son succès. La résistance des bactéries aux antibiotiques devient progressivement un problème majeur de santé publique dans le monde entier, car elle pourrait devenir, dès 2050, l’une des premières causes de mortalité en provoquant près de 10 millions de décès 1 . Cette résistance risque aussi d’accroître les dépenses de santé, par l’utilisation d’antibiotiques plus coûteux. L’antibiorésistance prend de telles proportions qu’une équipe de chercheurs ont même trouvées des bactéries résistantes sur des oiseaux sauvages de l’Arctique, une région reculée, là où les antibiotiques sont pourtant rares.2 Lors de ce travail de maturité, je compte tout d’abord revenir sur le passé. Comment les antibiotiques ont été découvert et qu’est-ce que cette découverte représentait à l’époque ? Puis, je compte aborder le fonctionnement des antibiotiques. Par la suite, je discuterai des différents mécanismes de résistance qu!ont développées les bactéries au fils des dernières décennies pour parer les effets des antibiotiques. Puis, je me pencherai sur les différentes causes de la résistance des bactéries aux antibiotiques ainsi que sur la façon dont cette résistance influencera nos modes de vie dans un futur peut-être pas si lointain. Finalement, tous ces éléments mèneront à la problématique centrale de mon travail de maturité, pourquoi l!antibiorésistance s!est développée aussi rapidement ces dernières années ? Mes motivations pour ce sujet : Ce sujet me tient particulièrement à cœur puisqu!il s!agit d!une problématique de santé publique dont nous ne sommes pas suffisamment inquiets pour le moment. Pour moi, l!antibiorésistance n!est pas assez médiatisée par rapport aux enjeux vitaux et économiques qu!elle pourrait engendrer dans le futur. De plus, il s!agit d!un sujet passionnant, autant par l!invention de l!antibiotique que par la manière dont ces bactéries développent des résistances. Je dois reconnaître que depuis tout petit, je me demande comment de simples petits cachets peuvent combattre des maladies, de quelle manière ils agissent sur les bactéries ainsi que de la façon à laquelle ils sont produits en si grande quantité sur le marché. Je trouve que consulter l!avis de personnes qualifiées dans le domaine de la bactériologie et comprendre comment sont gérés les cas d’antibiorésistance dans les hôpitaux, mais aussi dans la communauté est d’un grand intérêt. 1 https://solidarites-sante.gouv.fr/prevention-en-sante/les-antibiotiques-des-medicaments- essentiels-a-preserver/des-antibiotiques-a-l-antibioresistance/article/l-antibioresistance- pourquoi-est-ce-si-grave 2 https://cordis.europa.eu/article/id/28978-drug-resistant-bacteria-found-in-arctic-birds/frl Gymnase de Burier, travail de maturité Adrien Masoero 6 Démarche : Ma présentation abordera dans un premier temps la manière dont les antibiotiques ont été découverts et la révolution médicale qu"#$"%& a engendrée. Par la suite, la compréhension des modes d’actions des antibiotiques et des mécanismes d!antibiorésistance des bactéries seront traités. Au niveau économique, j’aimerais étudier l’impact qu’engendrera cette résistance sur le coût des traitements et des hospitalisations. Dans la partie pratique, il sera intéressant de connaître le point de vue de différents spécialistes en infectiologie et en bactériologie, de la façon dont ils restreignent l’utilisation d’antibiotiques. Ils pourront aussi m’expliquer comment sont gérés les cas d’antibiorésistance ainsi que d!entendre leurs inquiétudes sur ce sujet. Finalement, tous ces différents points me permettront de mieux comprendre les défis majeurs de santé publique à l’échelle mondiale qui attendent l!humanité et la sensibilisation collective qu!il faudra mettre en place pour lutter contre cette situation. Gymnase de Burier, travail de maturité Adrien Masoero 7 1. Partie Théorique 1.1 La découverte des Antibiotiques La découverte des antibactériens a permis à la médecine de faire des progrès considérables. S’il est désormais possible de pratiquer des opérations chirurgicales, c’est indirectement grâce aux antibiotiques, qui ont amoindri le risque d’infection lors d’une intervention. 1.1.1 Pasteur La découverte des antibiotiques remonte au 20ème siècle. Cependant, au 19ème siècle déjà, Louis Pasteur mit en évidence, après plusieurs expériences, que certains micro-organismes étaient capable d’influencer le développement d'autres micro-organismes ou encore de les détruire. Ces découvertes furent publiées en 18773. Dans sa publication, Pasteur conclut : « Tous ces faits, autorisent peut-être les plus grandes espérances au point de vue thérapeutique »4. Louis Pasteur fut le premier à prévoir l'importance révolutionnaire que sa découverte allait acquérir dans la médecine de notre époque. 1.1.2 Fleming En septembre 1928, à une période où les infections bactériennes étaient la première cause de décès, le médecin et biologiste Alexandre Fleming s!aperçut, en étudiant les mutations de colonies de staphylocoques*, que#%'()"#de ses plaques de culture avait été contaminées par un micro-organisme provenant de l!air. Il s'agissait d’une espèce de champignon du type Pénicillium notatum*, qui provoqua une altération imprévue de cette culture. En effet, une grande zone autour de ce micro-organisme était devenue transparente. Fleming en conclut que les staphylocoques avaient été attaqués par une substance antibactérienne produite par ce micro-organisme qui s’était répandu dans l!agar. Le biologiste décida d’étudier cette substance aux propriétés antibactériennes remarquables. C’est ainsi qu’il découvrit le premier antibiotique, la pénicilline*, le 3 septembre 1928. Ce n’est pourtant qu’en 1940 qu’elle sera purifiée par Howard Walter Florey et Sir Ernst Boris Chain puis industrialisée à partir de 1943 aux États-Unis.5 1.1.3 De 1928 à nos jours 3 https://www.persee.fr/doc/rhs_0048-7996_1954_num_7_2_3405 4 Toutes les citations qui suivront durant ce travail seront toujours entre guillemet et en italique 5https://www.biusante.parisdescartes.fr/sfhm/hsm/HSMx1991x025x001/HSMx1991x025 x001x0031.pdf *Tous les mots suivient d’une astérix sont définis dans le glossaire à la fin de se travail. Gymnase de Burier, travail de maturité Adrien Masoero 8 Durant la décennie qui suivit la découverte de Fleming, un grand nombre de substances antibactériennes furent mises à jour, comme la citrinine* découverte par Hetherington et Raistrick en 1931, la gliotoxine* d'Emerson et Weindling en 1936, la fumigacine* signalée par Anslow et Raistrick en 1938. Les effets de quelques-uns, seulement, furent testés sur des organismes vivants. uploads/Geographie/ tm-antibiotesistance-v-f.pdf

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