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Cm4 microbiologie amd ct cours 2014 2015

ère année ?? AM Davila M Na? tali et C Tinsley ÉCOLOGIE MICROBIENNE MICRO -ORGANISMES ET ACTIVITÉS HUMAINES CPrésentation CEcologie essai de dé ?nition Du grec o? kos demeure et logos discours science Peut être dé ?nie comme l ? étude des écosystèmes par l ? étude des rapports entre les organismes et le milieu o? ils vivent CReprésentation schématique d ? un écosystème ECOSYSTEME ENVIRONNEMENT ABIOTIQUE COMMUNAUTE INTERACTIONS ENTRE TOUS LES COMPARTIMENTS Population A Individus Population B Population C CInteractions et complexité croissantes Ecosphère Biosphère Biome Ecosystème Biocénose communauté Population Individu ou cellule Environnement Biotique Abiotique Etude des niveaux d ? organisation supérieurs à l ? individu CSommaire E ?ets des paramètres abiotiques sur les populations microbiennes Interactions entre populations microbiennes Développement et évolution des populations et des communautés Les écosystèmes microbiens et les hommes CE ?ets des paramètres abiotiques sur les populations microbiennes In uence sur les capacités de survie et de multiplication CCroissance en culture discontinue et isolée Chez les procaryotes La cinétique de croissance se traduit par une courbe de croissance caractérisée par la succession de di ?érentes phases - Phase de latence Phase de démarrage augmente - Phase exponentielle dX X dt constante max -Phase de ralentissement diminue - Phase stationnaire - Phase de lyse CE ?ets des facteurs abiotiques Taux de croissance d ? un micro-organisme Valeur optimale Valeur minimale Valeur maximale Valeur d ? un paramètre environnemental donné ? Un domaine est dé ?ni par les valeurs cardinales spéci ?ques d ? une population clonale ? Les paramètres ne sont pas indépendants entre eux CPrincipaux facteurs abiotiques Les plus importants vs activités humaines Température pH Activité de l ? eau ou potentiel hydrique Potentiel rédox Présence de substances toxiques Facteurs énergétiques Radiations Composés organiques Composés minéraux lithotrophes Disponibilité des nutriments minéraux CTempérature Microorganisme Psychrophile Psychrotrophe Mésophile Thermophile Thermophile extrême Température C Min Max Generations hr CInteractions entre populations microbiennes Une vision simpli ?ée CInteractions entre populations Population A Neutralisme Commensalisme Synergisme coopération ? ? ? ? Mutualisme symbiose Compétition - Amensalisme antagonisme Prédation Parasitisme Population B - pas d'e ?et e ?et positif - e ?et négatif CNeutralisme Pas d ? interactions Populations ayant des fonctions et des capacités métaboliques très di ?érentes Favorisé par les faibles densités de population éloignement spatial les populations ne se sentent pas ? Favorisé lorsque les populations sont sorties de leur habitat naturel C Commensalisme Gélose profonde satellitisme Les commensaux mangent à la même table Association fréquente mais non obligatoire La population non a ?ectée modi ?e son environnement Consommation d ? oxygène détoxi ?cation Excrétion de facteurs de croissance Modi ?cation d ? état des nutriments insolubles vers solubles vers gazeux Libération de composés à partir des matrices ex environnement acide Conversion d ? une molécule organique par une population en un substrat pour une autre population Cométabolisme CSynergisme Association non obligatoire basée sur la complémentarité des métabolismes Un exemple Syntrophisme cas particulier connu essentiellement pour le transfert inter-espèce d ? hydrogène thermodynamique CMutualisme Synergisme ou