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Debarre gandon 2008 biologie Chapitre Épidémiologie évolutive des maladies infectieuses F Débarre ?? a et S Gandon ?? a ? Introduction ?? ? Quelques exemples ?? ? Modélisation de l ? épidémie ?? ? Modélisation de l ? évolution du parasite ?? ? Modélisatio

biologie Chapitre Épidémiologie évolutive des maladies infectieuses F Débarre ?? a et S Gandon ?? a ? Introduction ?? ? Quelques exemples ?? ? Modélisation de l ? épidémie ?? ? Modélisation de l ? évolution du parasite ?? ? Modélisation de la coévolution hôte-parasite ?? ? Perspectives ?? a Centre d ? Écologie Fonctionelle et Évolutive UMR Équipe ECOGEV route de Mende Montpellier cedex France biologie épidémiologie intégrative Introduction Chaque hiver la grippe fait son apparition en France La vaccination contre le virus est recommandée pour les personnes ?? sensibles ?? ? pour limiter le nombre de malades et réduire l ? intensité des infections cf Chapitre Chaque année cependant le vaccin contre la grippe doit être réactualisé selon les recommandations de l ? Organisation mondiale de la Santé OMS Le virus de la grippe évolue en e ?et et le vaccin de l ? année précédente peut ne plus être e ?cace Ceci est dû à la dérive antigénique drift en anglais du virus provoquée par des petits changements génétiques mineurs mais fréquents Parfois des modi ?cations antigéniques plus importantes ont lieu dues à des réarrangements shifts en anglais entre di ?érentes souches infectant un même hôte Ces réarrangements sont à l ? origine des grandes pandémies de grippe Doherty et coll L ? exemple de la grippe illustre particulièrement bien les risques et les craintes associés à la dynamique des maladies infectieuses Il est important de distinguer deux composantes dans cette dynamique La dynamique épidémiologique caractérise la démographie de la maladie le nombre de cas la durée de l ? épidémie etc La dynamique évolutive se concentre elle sur les changements de la maladie suite à l ? apparition de nouvelles souches qui ont des propriétés di ?érentes virulence transmission résistances aux médicaments ou aux vaccins etc L ? épidémiologie s ? intéresse donc plutôt aux conséquences à court terme de l ? épidémie alors que l ? évolution tente de comprendre et de prévoir les changements à plus long terme Cette dichotomie est pourtant assez arti ?cielle puisque ces deux processus interagissent l ? un avec l ? autre L ? exemple de la grippe illustre bien ce chevauchement entre dynamique écologique et dynamique évolutive Pour comprendre l ? épidémiologie il est nécessaire de prendre en compte la dérive antigénique du virus et sa capacité à contourner les défenses immunitaires de l ? hôte cf Chapitre sur la phylodynamique de la grippe Réciproquement les recherches en écologie évolutive ont montré que les processus démographiques ont un impact majeur sur l ? évolution Roughgarden L ? épidémiologie évolutive ou l ? écologie évolutive des maladies infectieuses cf Encadré tente de faire le lien entre ces deux disciplines et s ? intéresse à la dynamique à court et long terme de la maladie Ce Chapitre est une introduction à l ? épidémiologie évolutive théorique La théorie permet de formaliser les problèmes et les questions à l ? aide de modèles mathématiques Ces modèles ont deux intérêts principaux ??