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introduction fr 6ppf pdf

BI U ?? Bioinformatique appliquée http pedagogix-tagc univ-mrs fr courses bioinfo intro Introduction Matériel de cours ? Diapos énoncés des TP ? http pedagogix-tagc univ- mrs fr courses bioinfo intro ? Dépôt des rapports de TP ? http ametice univ-amu fr course view php id Jacques van Helden Jacques van-Helden univ-amu fr Aix-Marseille Université France Technological Advances for Genomics and Clinics TAGC INSERM Unit U http jacques van-helden perso luminy univ-amu fr Objectifs pédagogiques ? Ce cours est destiné à des étudiants en sciences de la vie biologie biochimie sciences biomédicales ? Théorie h CM ? Introduction aux concepts et méthodes de base en bioinformatique ? Illustrations sur base d'exemple concrets ? Pratique x h TP ? Utilisation des outils bioinformatiques pour analyser des séquences biologiques ? Interprétation biologique des résultats ? Evaluation de la ?abilité statistique des alignements de séquences Bioinformatics Qu'est-ce que la bioinformatique ? http pedagogix-tagc univ-mrs fr courses bioinfo intro Quelques dé ?nitions de la bioinformatique ? Les bioinformaticiens dé ?nissent leur propre domaine de diverses manières ? Georgia Inst of Tech USA ? ??Bioinformatics is an integration of mathematical statistical and computer methods to analyse biological biochemical and biophysical data ? ? Intégration des méthodes mathématiques statistiques et informatiques pour analyser les données biologiques biochimiques et biophysiques ? Cette dé ?nition me semble assez pertinente mais présente la faiblesse d'être motivée par les données plutôt que par les questions Quelques dé ?nitions de la bioinformatique ? Les bioinformaticiens dé ?nissent leur propre domaine de diverses manières ? Stanford University USA ? ??Bioinformatics is the study of biological information as is passes from its storage site in the genome to the various gene products in the cell ? it involves the creating and development of advanced information and computational technologies for problems in molecular biology ? ? ? La bioinformatique est l'étude de l'information biologique quand elle passe de son site de stockage dans le génome aux di ?érents produits des gènes dans la cellule ? Elle inclut la création et le développement de technologies informatiques avancées pour les problèmes de la biologie moléculaire ? Cette dé ?nition me semble trop restrictive En particulier les produits des gènes réduit le domaine à l'analyse des protéines La bioinformatique inclut d'autres champs d'application comme l'étude du métabolisme des séquences nucléiques de l'évolution etc ? ??Bioinformatics speci ?cally refers to the search and use of patterns and structure in biological data and the development of new methods for database access ? ? ? Virginia Inst Tech USA ? ? No doubt that this de ?nition was written by a computer scientist or an informatician but not by a bioinformatician CQuelques dé ?nitions de la bioinformatique ? Les bioinformaticiens dé ?nissent leur propre domaine de diverses manières ? Virginia Inst Tech USA ? ??Bioinformatics speci ?cally refers to the search and use of patterns and structure in biological data and the development of new methods for database access ? ? La bioinformatique se réfère spéci ?quement à la recherche et