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Genet bio info complet Introduction Sommaire Historique et situation française Qu'est-ce que la bioinformatique Les di ?érentes facettes de la bioinformatique La Bioinformatique est la discipline de l'analyse de l'information biologique en majorité sous l

Introduction Sommaire Historique et situation française Qu'est-ce que la bioinformatique Les di ?érentes facettes de la bioinformatique La Bioinformatique est la discipline de l'analyse de l'information biologique en majorité sous la forme de séquences génétiques et de structures de protéines C'est une branche théorique de la Biologie largement antérieure à la récente révolution génomique Malgré son nom la bioinformatique ne doit pas être confondue avec une simple application aux données biologiques des concepts et des outils de l'informatique traditionnelle Historique et situation française Le terme de Bioinformatics n'est apparu dans la littérature scienti ?que qu'au tout début des années Cependant ce domaine de recherche ne vient pas d'émerger Bien avant que cette discipline ne soit mise sous les feux de la rampe par l'essor de la génomique quelques dizaines de laboratoires dans le monde travaillaient depuis longtemps en biomathématique une discipline constituée pour répondre aux besoins précoces dès de la phylogénie moléculaire Le tableau I retrace les grandes étapes de la bioinformatique et montre à quel point cette discipline a accompagné et souvent précédé le développement des concepts biologiques et des outils informatiques sur laquelle elle est fondée Tableau I Étapes-clés dans l'histoire de la bioinformatique Première séquence protéique Insuline Sanger Lien entre séquence structure Globines Perutz Premier Ordinateurs IBM Evolutionary divergence and convergence in Proteins Zuckerkandl Pauling Construction of Phylogenetic Trees Fitch Margoliash Atlas of Protein Sequences M Dayho ? Georgetown mini-ordinateur DEC PDP- A general method applicable to the search for similaries in sequences of two proteins Needleman Wunsch Premier travaux sur le repliement des ARNs J Ninio C Premier microprocesseur Intel Génie Génétique Cohen et al Prediction of Protein Conformation Chou Fasman Intel kit Altair mini-ordinateur DEC-VAX Micro-ordinateurs Apple Commodore Radioshack Séquençage d'ADN Sanger Maxam Gilbert Premier package Bioinformatique Staden Bases de données ACNUC PIR EMBL GenBank Accès téléphonique à la base de données PIR IBM-PC - kb Los Alamos-GenBank séquences nucléotides Programme d'alignement local Smith- Waterman IBM-XT Disque DUR Mbytes MacIntosh interface graphique souris - Programme Fasta Pearson-Lipman INTERNET succède à ARPANET et BITNET Programme Blast Altschul et al Clonage positionnel et séquençage de NF- Grail programme performant pour localiser les gènes Mural et al Étiquettes d'ADNc EST Venter et al Matsubara et al Séquençage complet du chromosome III de levure Première séquence complète d'un micro-organisme Venter et al H in uenza Séquence complète de la levure consortium européen Programme Gapped Blast Alschul et al génomes bactériens disponibles Mbase jour de nouvelles séquences publiques Séquence premier jet complète du génome humain Une partie du retard pris en Europe continentale et en France dans ce domaine la bioinformatique publique ou privée est à anglosaxonne peut être attribué à une méconnaissance de l'origine et de l'histoire déjà longue des biomathématiques et à la confusion associée au nouveau terme de Bioinformatique Les quelques actions en faveur de cette discipline ont été exercées dans un contexte multidisciplinaire Informatique Biologie qui n'a jamais collé à la réalité d'un domaine de recherche déjà bien structuré autour de concepts et techniques spéci ?ques