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Etude documentaire MathSpé PC 2014-2015 C. Saury PC Page 1 sur 10 La synthèse p

Etude documentaire MathSpé PC 2014-2015 C. Saury PC Page 1 sur 10 La synthèse peptidique des peptides Les peptides sont les longues chaînes moléculaires qui composent les protéines. Les peptides synthétiques sont utilisés soit en tant que médicaments (tels qu'ils sont biologiquement actifs) ou dans le diagnostic de la maladie. Les peptides sont difficiles à synthétiser car le chimiste de synthèse doit s’assurer que les acides aminés qui composent la chaîne sont ajoutés dans le bon ordre et qu'ils ne subissent pas d'autres réactions. Ceci implique l'ajout d'un acide aminé, l’élimination de tout acide n’ayant pas réagi puis l’ajout du suivante et ainsi de suite. Comme on peut l'imaginer, cela prend beaucoup de temps et ne donne très faible les rendements. Une technique qui a été récemment mis au point consiste à fixer une extrémité du peptide à un polymère solide, ce qui signifie que le peptide ne sera pas éliminé avec l'excès d'acide lors du lavage. C’est beaucoup plus rapide que la synthèse classique, et conduit à des rendements considérablement améliorés. Le procédé comprend cinq étapes réalisées de manière cyclique. Étape 1 - Installation d'un acide aminé au polymère L' amino-acide est mis à réagir avec une molécule connue comme un "agent de liaison " qui lui permet de se fixer à un polymère solide, et l'autre extrémité de l'agent de liaison est mis à réagir avec le support polymère. Étape 2 - Protection Un acide aminé est un acide avec un groupe amino à une extrémité et un groupe acide à l'autre. Pour empêcher un acide aminé de réagir avec lui-même, l'un de ces groupes est mis à réagir afin de le rendre non réactif . Étape 3 - Couplage L'acide aminé protégé est ensuite mis à réagir avec l'acide aminé attaché au polymère pour commencer à construire la chaîne peptidique . Étape 4 - Déprotection Le groupe de protection est maintenant retiré de l'acide en bout de chaîne de sorte qu'il peut réagir avec un nouvel acide à ajouter. Le nouvel acide est ensuite protégé (étape 2) et le cycle D’allongement de la chaîne continue jusqu'à ce que la longueur requise ait été synthétisé. Étape 5 - Retrait du polymère Une fois le peptide souhaité synthétisé, la liaison entre le premier acide aminé et l’agent de liaison est brisé pour donner le peptide libre. Etude documentaire MathSpé PC 2014-2015 C. Saury PC Page 2 sur 10 INTRODUCTION Un peptide est une chaîne d'acides appelées acides aminés liés entre eux par des liaisons appelés des liaisons peptidique . Une protéine se compose d'un peptide plié d'une manière particulière, ou plusieurs peptides pliées ensemble. Ces peptides sont synthétisés très rapidement dans les cellules vivantes, mais jusqu'à récemment, ne pouvait être synthétisé artificiellement pour de longues chaines, des processus lents, de faibles rendements et qui donnaient des produits impurs étaient mis en jeu. Récemment, une nouvelle technique connue sous le nom de synthèse peptidique en phase solide (SPPS) a été développé. SPPS donne des rendements élevés de produits purs et fonctionne plus rapidement que la synthèse classique, bien que toujours beaucoup plus lentement dans les cellules. Cette technique est décrite ci-dessous. Utilisation de peptides synthétiques Les peptides synthétiques ont deux utilisations principales : les médicaments comportant des peptides et les peptides appliqués pour diagnostic. Médicaments peptidiques Les médicaments peptidiques sont soit peptides naturels soit des peptides naturels modifiés. il y a de nombreux peptides qui sont biologiquement active naturellement. Si un patient ne peut naturellement produire un peptide dont il a besoin, ce peptide peut être synthétisé et ingéré. De plus, les acides aminés dans un peptide actif peuvent être modifiés pour obtenir des analogues du peptide d'origine. Si l'analogue est biochimiquement plus actif que le peptide original, il est appelé agoniste et si il a l'effet inverse, il est appelé antagoniste. Les contraceptifs ont été faits par la synthèse des peptides antagonistes de la fertilité. peptides de diagnostic Des peptides ont été conçus pour changer de couleur sous certaines conditions, et peuvent être utilisées à des fins de diagnostic. Par exemple, un substrat de peptide chromogène peut facilement détecter la présence, l'absence et la variation des taux d'enzymes qui contrôlent la tension artérielle et le flux sanguin, indiquant la capacité de coagulation. Introduction à la chimie des protéines Les peptides sont des polymères d'acides aminés faits en utilisant de deux à plusieurs centaines de amino-acides. Elles sont toutes basées sur la structure de l'acide α –aminoacides : Il y a vingt acides aminés qui se produisent couramment dans la nature (tableau 1 ) et de nombreux autres ont été synthétisés. Etude documentaire MathSpé PC 2014-2015 C. Saury PC Page 3 sur 10 Etude documentaire MathSpé PC 2014-2015 C. Saury PC Page 4 sur 10 Ces peptides (ou des combinaisons d'entre eux) se replient de façon caractéristiques pour donner des protéines. Dans tous les mammifères, tous les acides aminés optiquement actifs sont sous la forme (L), donc un changement qui peut être faite est de substituer un acides aminé (L) pour un des acides aminés (D) dans la chaîne. 1 La structure complète de la proline (plutôt que seulement le substituant) est donnée parce proline est cyclique et ne présente pas de chaîne latérale en tant que tel . 2 Quand une molécule est exposée à une lumière polarisée rectilignement, certaines molécules font tourner le plan de polarisation de la lumière. Ces molécules sont appelés optiquement active. Chaque molécule optiquement active présente une image dans un miroir qui ne peut pas être superposée sur l'original et qui fait tourner la plan de polarisation de la lumière de la même quantité dans la direction opposée . Dans glycéraldéhyde (une molécule optiquement actif) , la forme qui fait tourner le plan de polarisation de la lumière vers la gauche est appelé L-glycéraldéhyde ( du grec laevo, ce qui signifie à gauche) et l'autre forme est appelé D-glycéraldéhyde ( du latin dexter , ce qui signifie à droite) . Pour les acides aminés , la forme qui ressemble à L-glycéraldéhyde est le 'L’ Forme de l'acide aminé et la forme qui ressemble à R-glycéraldéhyde est connu comme le ‘D' forme, quelle que soit la façon dont ils font tourner le plan de la lumière polarisée . Tous les acides aminés d'origine naturelle , à l'exception de la glycine sont optiquement actifs. Etude documentaire MathSpé PC 2014-2015 C. Saury PC Page 5 sur 10 Les liens entre les acides aminés sont appelés liaison peptidique . Ce sont des liens forts mais ils peuvent être hydrolysée soit par un acide fort ou une base forte, ce qui signifie que seules les substances neutres et acides ou bases faibles peuvent être utilisées dans la synthèse des peptides. Synthèse peptidique en PHASE SOLIDE La synthèse des peptides est beaucoup plus compliqué que de former des liaisons amide simplement en mélangeant le acides aminés souhaitée ensemble dans un tube à essai. Avec vingt acides aminés naturels et un certain nombre d’entre eux non naturels sont mis en jeu, les combinaisons possibles sont nombreuses. Cette complexité rend la synthèse de peptides à la fois fascinante et stimulante. Si deux solutions contenant des acides aminés sont mélangées ensemble, quatre dipeptides différents ( ainsi que d'autres peptides plus longs ) sera formé . (par exemple, pour un mélange de glycine et d'alanine quatre dipeptides seraient glygly , glyala , alagly , alaala . Dans cette représentation, le groupe amino libre ou groupe N-terminal se trouve sur la gauche de l'acide aminé et le groupe acide carboxylique libre ou C-terminal est à l'extrémité de droite. ). Afin de s’assurer que seul le dipeptide désiré est formé le groupe de base d'un acide aminé et le groupe acide de l'autre doit à la fois être incapable à réagir. Cette « désactivation » est appelé protection de groupes réactifs, et un groupe qui est incapable de réagir est appelé groupe protégé . Dans la synthèse organique classique, les acides sont protégés , puis mis à réagir et déprotégé , puis une extrémité du dipeptide est protégé et mis à réagir avec un nouvel acide protégé et ainsi de suite . Dans SPPS l'acide aminé qui sera à une extrémité du peptide est attaché à un polymère insoluble dans l'eau et restera protégé tout au long de la synthèse du peptide , ce qui signifie à la fois que moins d’étapes de protection / déprotection sont nécessaires et que les réactifs peuvent facilement être rincés sans perdre du peptide . Étape 1 - fixation d'un acide aminé au polymère Les chaînes peptidiques ont deux extrémités, connus respectivement comme le N-terminal et C-terminal 3et pour savoir laquelle des extrémités est fixée au polymère cela dépend du polymère utilisé . Cet article suppose que les billes de polyamide sont utilisées et par conséquent que le C-terminal du peptide est attaché au polymère . La fixation est réalisée en faisant réagir l'acide aminé avec un agent de liaison et puis en faisant réagir l'autre extrémité de l'agent de liaison avec le polymère. Cela signifie qu'une liaison polyamide peut uploads/Finance/ ad-la-synthese-peptidique-des-peptides.pdf