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1 MANUEL DE FORMATION AU LOGICIEL EPI INFO™ 7 Version du document 3.4 Aout 2016

1 MANUEL DE FORMATION AU LOGICIEL EPI INFO™ 7 Version du document 3.4 Aout 2016 Introduction à Epi Info 7 Page 2 TABLE DES MATIERES Bienvenu dans Epi Info 7 ™ pour Windows EXERCICE 1 TÉLÉCHARGEMENT ET INSTALLATION Étape 1: Extraction de l'archive Étape 2: Installation du logiciel Epi Info™ 7 Exercice 2 Créer un Questionnaire Étape 1: Créer un Nouveau Projet Étape 2: Ajouter des champs dans le questionnaire Étape 3: Déplacer des champs Étape 4: Renommer la page courante Étape 5: Ajouter une nouvelle page au questionnaire Étape 6: Créer un groupe Étape 7: Modifier un champ et créer une liste "Valeur Légales" (Valeurs autorisées) Étape 8: Modifier un champ et créer une liste "Commentaire Légal " Étape 9: Éditer un champ et créer une liste de codes Étape 10: Supprimer la grille d'arrière-plan Étape 11: Changer l'ordre de tabulation Étape 12: Aligner les champs Étape 13: Créer la table de données dans la base de données Exercice 3 Check code (Le code de contrôle) Étape 1: Ouvrir le formulaire Access et Check Code Introduction à Epi Info 7 Page 3 Étape 2: Calculer l'âge (Commande ASSIGN) Étape 3: Effectuer la vérification de la date (commandes DIALOG, CLEAR, GOTO) Étape 4: Calculer la période d'incubation Exercice 4 La théorie de la création de bases de données Vue d'ensemble Un peu de terminologie Les bases de données dans Epi Info™ 7 Les variables communes Exercice 5 La saisie des données Étape 1: Ajouter des données à la base de données Étape 2: Passer d'un enregistrement à l'autre Étape 3: Trouver des enregistrements répondant à certains critères Exercice 6 Analyse avec Tableau De Bord Visuel Étape 1: Ouvrir Tableau De Bord Visuel Étape 2: Ouvrir une base de données existante Étape 3: Obtenir un listage Étape 4: Trier la liste Étape 5: Annuler l'ordre de la liste Étape 6: Obtenir une distribution statistique Étape 7: Comparer les moyennes Étape 8: Stratifier des données Étape 9: Faire des graphiques Introduction à Epi Info 7 Page 4 Étape 10: Recoder des variables dans ma base de données Étape 11: Travailler avec une partie de la base de données Étape 12: Enregistrer dans un fichier les résultats de votre session Étape 12: Ouvrir le canevas de fichier Étape 13: Enregistrer les résultats sous forme de fichier HTML Exercice 7 Introduction au module d'Analyse classique Étape 1: Ouvrir Analyses Classique Étape 2: Ouvrir un projet à partir des projets Epi Info 7 existants Étape 3: Obtenir un listage Étape 4: Trier la liste Étape 5: Travailler avec une partie de la base de données Étape 6: Annuler l'ordre et la sélection Étape 7: Obtenir une distribution statistique Étape 8: Comparer les moyennes Étape 9: Stratifier des données Étape 10: Faire des graphiques Exercice 8 Lire et écrire des fichiers sous différents formats Étape 1: Ouvrir/Importer et mettre à jour une feuille de calcul Excel Étape 2: Enregistrer les données du fichier .XLS dans une table Étape 3: Ouvrir un fichier au format ASCII Exercice 9 EpiMap Étape 1: Obtenir un fichier .SHP sur Internet Introduction à Epi Info 7 Page 5 Étape 2: Ouvrir le module EpiMap à partir de Enter Data Étape 3: Filtrer des données sur la carte Étape 4: Créer des signets, des zones et des titres / des étiquettes. Étape 5: Enregistrer la carte sous forme de fichier image Étape 6: Sauvegarder sous forme de carte interactive (.Map) Étape 7: Créer une carte choroplèthe Étape 8: Enregistrer la carte sous forme de fichier image Étape 9: Enregistrer sous forme de carte interactive (.Map) REMERCIEMENTS L'équipe de développement du logiciel Epi Info™ : Conseillers techniques d’Epi Info™ : Erik Knudsen, Tiffany Winston, José Aponte Conception pédagogique: Gerald Jones Division of Health Informatics and Surveillance (DHIS) Informations sur le droit d'auteur Epi Info est une marque déposée du CDC. Les programmes d'Epi Info™ sont offerts au domaine public afin de promouvoir la santé publique. Les programmes peuvent être traduits, copiés ou distribués gratuitement. Aucune garantie n'est donnée ou implicite quant à l'utilisation du logiciel dans un but particulier. Avis de non-responsabilité Le scénario suivant ainsi que toutes les données relatives au dit scénario et au présent document de formation sont purement fictifs. Le scénario n'est pas lié à un événement de la vie réelle et a été conçu uniquement à des fins de formation au logiciel. Les résultats et les conclusions du présent rapport sont ceux des auteurs et ne reflètent pas nécessairement la position officielle du Center for Disease Control and Prevention. A EPI INFO™ 7 Introduction à Epi Info 7 Page 6 Epi Info™ 7 est un ensemble de programmes appartenant au domaine public conçus par le Center for Disease Control and Prevention (CDC) et fonctionnant sous le système d'exploitation Microsoft Windows. Epi Info™ 7 est utilisé par les professionnels de la santé publique pour l'étude des épidémies, la gestion de bases de données pour la surveillance de la santé publique ainsi que d'autres tâches et, de façon générale, les applications statistiques et les bases de données. La dernière version du logiciel Epi Info™ 7 au moment de l'élaboration du présent manuel est la V7.2.0.1 datant de l’Aout 2016. Avec Epi Info™ 7 et un ordinateur, les médecins, les épidémiologistes ainsi que d'autres professionnels de la santé peuvent rapidement concevoir un questionnaire, personnaliser la saisie et l'enregistrement des données et analyser les données. Introduction à Epi Info 7 Page 7 Les statistiques épidémiologiques, les tableaux, les graphiques et les cartes peuvent être produits avec des commandes simples comme LIRE, FREQ, LISTE, TABLEAUX et GRAPHIQUE. EpiMap affiche des cartes géographiques avec des données de différents formats. AVANTAGES D’EPI INFO Compatibilité maximale avec les normes de l'industrie, y compris: Soit Microsoft Access, SQL Server, en plus des bases de données ODBC et autres. Soit Microsoft. NET ou des navigateurs Web et HTML Extensibilité, des organismes extérieurs au CDC peuvent produire des modules supplémentaires Compatibilité de EpiMap, et ArcView® - avec le GIS La régression logistique et l'analyse de survie de Kaplan-Meier Tutoriels CONFIGURATION REQUISE ✓ Infrastructure Microsoft. NET 3.5 ou supérieur ✓ Windows XP, Windows Vista, Windows 7 ✓ 32 Mo de mémoire vive Augmentation de la RAM: 64 Mo pour Windows 4.0 et 2000, 128 Mo pour Windows XP ✓ Un microprocesseur de 1 GHz ✓ Au moins 256 mégaoctets d'espace libre sur le disque dur (lecteur C) pour l'installation, et 130 mégaoctets après l'installation. La dernière version peut être obtenue à l'adresse : www.cdc.gov/epiinfo/html/downloads.htm. Introduction à Epi Info 7 Page 8 RESSOURCES EPI INFO™ De la documentation pour la formation, des traductions, des informations techniques et d'autres ressources sont disponibles sur le site web Epi Info™ à l'adresse : http://www.cdc.gov/epiinfo. Si vous avez des questions ou des problèmes avec le logiciel, ou si vous voulez avoir plus d'informations, vous pouvez envoyer un courriel au centre d'assistance d'Epi Info™ à epiinfo@cdc.gov ou composer le 404.498.6190. Un forum Internet consacré à Epi Info™ a été récemment mis en place à l'adresse : https://epiinfo.atlassian.net/wiki/questions les utilisateurs du monde entier peuvent se poser des questions et demander des conseils. Introduction à Epi Info 7 Page 9 EXERCICE 1 TÉLÉCHARGEMENT ET INSTALLATION Epi Info™ 7 peut être téléchargé à partir de http://epiinfo.codeplex.com. Jusqu'à ce qu'il soit accessible au grand public, il est recommandé que vous contactiez epiinfo@cdc.gov pour obtenir des instructions sur la façon d'obtenir la dernière version. Le fichier que vous allez télécharger est connu sous le nom de fichier "ZIP", également appelé fichier d'archive ou fichier compressé. Ces fichiers d'archive devraient s'ouvrir sur n'importe quel ordinateur Windows, bien que différentes applications puissent être utilisées pour les ouvrir en fonction de la configuration système de l'ordinateur. Le présent guide montrera au lecteur comment utiliser la visionneuse de fichiers d'archive de Windows 7 pour extraire les fichiers. EXTRACTION DE L'ARCHIVE 1. Télécharger la dernière version du logiciel Epi Info™ 7 et la placer sur le bureau de votre ordinateur. Le fichier aura généralement un nom similaire à Epi Info 7.zip. Figure 1.1: Vue du bureau de Windows 7 avec le fichier ZIP du logiciel Epi Info™ téléchargé. Dans cet exercice: Vue d'ensemble de la formation Public cible et prérequis Objectifs de la formation Ressources & temps requis Installation du logiciel Epi Info 7 Introduction à Epi Info 7 Page 10 2. Double-cliquer sur le fichier téléchargé (dans la figure 1.1, ce fichier aurait pour nom Epi Info 7). Windows 7 ouvrira le fichier d'archive comme s'il s'agissait d'un dossier normal et affichera le contenu. Figure 1.2: L'écran qui s'affiche après avoir double-cliqué sur le téléchargement d’Epi Info ™ 7. 3. Sélectionner les éléments contenus dans l'archive et les faire glisser pour les déposer sur le bureau. Cette action permet de copier les fichiers programme d'Epi Info™ 7 sur le bureau. Figure 1.3: Le bureau à l'issue de l'étape 3. 4. Double-cliquer sur l'icône de Lancement d'Epi Info qui apparaît après l'étape 3. Epi Info™ 7 est lancé. Figure 1.3 Note: Un fichier d'archive est uploads/Geographie/ epi-info-workbook-francais-9-6-2016.pdf