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HAL Id: tel-00781807 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00781807 Submitted on 28 Jan 2013 HAL is a multi-disciplinary open access archive for the deposit and dissemination of sci- entific research documents, whether they are pub- lished or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers. L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d’enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés. Identification des moisissures et de leurs métabolites secondaires colonisant des supports papiers : évaluation de la toxicité sur des cellules épithéliales respiratoires in vitro Sarah Boudih To cite this version: Sarah Boudih. Identification des moisissures et de leurs métabolites secondaires colonisant des supports papiers : évaluation de la toxicité sur des cellules épithéliales respiratoires in vitro. Sciences agricoles. Université Paris-Est, 2011. Français. NNT : 2011PEST0002. tel-00781807 1 Thèse Présentée pour l’obtention du diplôme de Docteur de l’Université Paris EST Spécialité : Sciences de la Vie et de la Santé Ecole doctorale : Agriculture, Alimentation, Biologie, Environnement et Santé Présentée et soutenue publiquement par Sarah BOUDIH Le 12 décembre 2011 Identification des moisissures et de leurs métabolites secondaires colonisant des supports papiers. Evaluation de la toxicité sur des cellules épithéliales respiratoires in vitro. Jury Monsieur le Professeur Jorge Boczkowski Président Madame Valérie Fessard Rapporteur Monsieur David Garon Rapporteur Monsieur le Professeur Hervé Chéradame Examinateur Monsieur le Professeur Stéphane Bretagne Directeur de thèse Monsieur Marcel Delaforge Co-directeur de thèse 2 A ma famille, pour son soutien, son écoute et sa patience. A la mémoire de mes deux grands pères. A Samy, Marion, Kendys et Laure pour votre présence. 3 REMERCIEMENTS Je tiens à remercier tout particulièrement Monsieur le Professeur Stéphane Bretagne de m’avoir accueillie au sein de son laboratoire. Je le remercie pour ses critiques constructives et avisées qui m’ont permis de mener à bien mon travail. Mes sincères remerciements s’adressent également à Monsieur le docteur Marcel Delaforge pour avoir dirigé mon travail de chimie analytique au sein du CEA. Je le remercie de l’attention qu’il m’a accordée, de son écoute et de ses conseils. Je remercie Madame le docteur Malalanirina Sylvia Rakotonirainy, pour son encadrement sur le thème du foxing. Je la remercie pour son accueil au sein du CRCC, ses conseils et ses encouragements. Mes remerciements vont également aux membres du Jury qui me font l’honneur de juger ce travail. Je tiens à exprimer toute ma gratitude à Madame le Docteur Françoise Botterel pour son encadrement durant ces trois années de thèse, son écoute, ses conseils et sa présence dans les moments difficiles. Je la remercie de m’avoir initiée aux rudiments de la mycologie avec patience et disponibilité, et de m’avoir encadrée pour la rédaction de ce manuscrit. Je voudrais remercier Monsieur le Docteur Olivier Puel de m’avoir fourni les papiers peints ensemencés en espèces fongiques et de m’avoir fait l’honneur de juger mon travail en tant que membre de mon comité de thèse, tout comme je remercie Madame le Docteur Florence 4 Forget. Merci également à Gabriel Reboux de m’avoir fourni les milieux de culture, et d’avoir été disponible avec son équipe pour chacune de mes questions. Je remercie Monsieur le Docteur Christian Bories pour m’avoir initiée aux techniques de cultures cellulaires, Mademoiselle le Docteur Odile Cabaret de m’avoir initiée à la PCR en temps réel, Madame Sylvie Thao pour son aide en HPLC, Mademoiselle Anaïs Roussel et Madame Danièle Rivollet pour leur aide précieuse. Un grand merci à Mesdames les Docteurs Françoise Foulet et Martine Liance pour leur aide et bonne humeur. L’occasion m’est donnée de remercier l’ensemble des membres du laboratoire de Parasitologie de l’hôpital Henri Mondor, de l’équipe LSOD du CEA de Saclay et du CRCC. Je remercie chacun d’entre eux pour m’avoir permis de mener à bien mon travail durant ces trois années. Je remercie les amis, les proches, qui m’ont soutenue et encouragée tout au long de cette thèse. Merci à tous de votre présence : Samy, Kendys, Bruno, Laure, Nicolas, Marion, Fanny, Yoshié, Claire, Laetitia. Enfin, je remercie ceux sans qui rien de tout cela n’aurait été possible : mes parents et mon frère, pour leur aide et leurs encouragements. 5 PREAMBULE Ce travail a bénéficié du soutien financier de l’Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail (ANSES ex AFSSET), avec le projet AFSSET 2008-EST0827, et du Ministère de la Culture et de la Communication avec le projet PNRCC 2008 (Programme National de Recherche sur la Connaissance et la Conservation des matériaux du patrimoine). Il a été réalisé au sein des trois unités suivantes : • le laboratoire de Parasitologie-Mycologie de la Faculté de Médecine de Créteil sous la direction du Professeur Stéphane Bretagne (PUPH), • le CEA de Saclay au sein de l’unité iBiTec-S, SB2SM sous la direction de Monsieur Marcel Delaforge (directeur de recherches CNRS), • le Centre de Recherche sur la Conservation des Collections (CRCC) sous l’encadrement de Madame Malalanirina Sylvia Rakotonirainy (ingénieur de recherches). La réalisation de ce travail a également donné lieu à une collaboration avec Messieurs Olivier Puel de l’Unité TOXALIM INRA/INP/UPS de Toulouse et Gabriel Reboux du laboratoire de Parasitologie-Mycologie du CHU de Besançon, UMR Chrono-Environnement de Franche- Comté. 6 COMMUNICATIONS Communications affichées Boudih S., Rakotonirainy M., Puel O., Delaforge M., Bretagne S. Viabilité fongique et analyse par HPLC-UV-MS de papiers détériorés par le foxing. Journées ABIES. Paris 1-2 avril 2010. Boudih S., Rakotonirainy M., Puel O., Delaforge M., Bretagne S. Viabilité fongique et analyse par HPLC-UV-MS de papiers détériorés par le foxing. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale. Angers 19 mai 2010. Boudih S., Rakotonirainy M., Puel O., Delaforge M., Bretagne S. Le foxing est-il d’origine fongique? Congrès de la Société Française de Microbiologie. Marseille 2-4 juin 2010. Communications orales Boudih S., Rakotonirainy M., Puel O., Delaforge M., Bretagne S. Viabilité fongique et analyse par HPLC-UV-MS de papiers détériorés par le foxing. Programme National de Recherche sur la Connaissance et la Conservation des matériaux du patrimoine culturel 2008. Archives Nationales de France Paris 29 septembre 2009. Boudih S., Reboux G., Scherer E., Puel O., Roussel A., Delaforge M., Bretagne S. Moisissures et métabolites secondaires issus de papiers peints de logements insalubres. Evaluation du risque mycotoxicologique sur des cellules respiratoires in vitro. Besançon 6 juin 2011. AFSSET 2008-EST0827. Boudih S., Reboux G., Scherer E., Puel O., Roussel A., Delaforge M., Bretagne S. Moisissures et métabolites secondaires issus de papiers peints de logements insalubres. Evaluation du risque mycotoxicologique sur des cellules respiratoires in vitro. Journée des mycotoxines. Toulouse 18 janvier 2011. 7 Roussel S., Reboux G., Million L., Parchas M-D, Vacheyrou M., Boudih S., Skana F., Delaforge M., Rakotonirainy M.S. Evaluation de la contamination fongique des archives et des symptômes ressentis par le personnel. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale. Paris 18-19 novembre 2011. Communications écrites Boudih S., Rakotonirainy M.S., Roussel A., Cabaret O., Puel O., Reboux G., Botterel F., Delaforge M., Bretagne S. Biotic foxing from a nineteenth century book studied using ATP bioluminescence, culture, and HPLC-UV-MS: evaluation of mycotoxins as biomarkers for fungal presence. Soumis à Analytical and Bioanalytical Chemistry. Roussel S., Reboux G., Million L., Parchas M.D., Boudih S., Skana F., Delaforge M., Rakotonirainy M.S. Microbiological evaluation of ten French archives and link to occupational symptoms. En révision dans Indoor Air. 8 LISTE DES ABREVIATIONS ACN Acétonitrile ADN Acide désoxyribonucléique AIA Milieu agar pour actinomycètes (Actinomycetes Isolation Agar) ARNm Acide ribonucléique messager ATP Adénosine triphosphate aw Activité en eau (water activity) t Béta tubuline CIE Commission Internationale de l’Eclairage COV Composés Organiques Volatils CRCC Centre de Recherche sur la Conservation des Collections Ct Cycle seuil (Cycle threshold) CYP Cytochrome P450 DMSO Diméthylsulfoxide D.O. Densité optique ESI Ionisation par ElectroSpray (electrospray ionisation) eV Electron Volt Fluo Fluorimétrie GM-CSF Granulocyte Macrophage Colony Stimulating Factor HPLC Chromatographie Liquide à Haute Performance (High Perfomance Liquid Chromatography) Ig Immunoglobuline IL-8 Interleukine 8 ITS Internal Transcribed Spacers MS Spectrométrie de Masse (Mass Spectrometry) m/z Masse par unité de charge MEB-EDX Microscopie Electronique à Balayage-Détecteur de rayons X à Dispersion d’Energie MeOH Méthanol MIP Polymère à Empreintes Moléculaires (Molecularly Imprinted Polymer) 9 MTT Bromure de 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl tetrazolium NCPT Nouvelle Collection du laboratoire de Pharmacologie-Toxicologie de l’INRA de Toulouse NRRL Northern Regional Research Laboratory OTA Ochratoxine A PVDF Polyfluorure de Vinylidène qPCR PCR quantitative en temps réel RLU Unités relatives de lumière (Relative Light Units) RMN Résonance Magnétique Nucléaire rpm Rotations par minute SBS Syndrome des Bâtiments Malsains SDS Sodium dodécylsulfate SPE Extraction sur Phase Solide (Solid Phase Extraction) TNF- Tumor Necrosis Factor alpha Tris EDTA Trishydroxyméthylaminométhane acide éthylène diamine tétracétique UE Union Européenne UV Ultra Violet 10 TABLE DES MATIERES REMERCIEMENTS ________________________________________________________ 3 PREAMBULE _____________________________________________________________ 5 COMMUNICATIONS _______________________________________________________ 6 LISTE DES ABREVIATIONS ________________________________________________ 8 TABLE DES MATIERES ___________________________________________________ 10 INTRODUCTION _________________________________________________________ 12 REVUE BIBLIOGRAPHIQUE_______________________________________________ 14 I) Généralités _________________________________________________________________ 15 I-1) Les champignons __________________________________________________________ 15 I-2) Métabolites secondaires et mycotoxines _________________________________________ 21 II) Le papier__________________________________________________________________ 30 II-1) Généralités ______________________________________________________________ 30 II-2) Historique ______________________________________________________________ 31 uploads/Geographie/ th2011pest0002-complete-archivage.pdf