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FICHE DE TD N°1 : I- EVALUATION DES RESSOURCES 1- Définition des thèmes et expr

FICHE DE TD N°1 : I- EVALUATION DES RESSOURCES 1- Définition des thèmes et expression Nucléotide, nucléoside, ADN, ARN, réplication, plasmide, génome, gène, biologie moléculaire, nucléoïde, traduction ; transcription, épissage ; réplisome, chromosome, codon, réparation de l’ADN, ADN polymérase, 2- Questions à réponses courtes A- Combien de base azotée existe-t-il ? classer les en deux groupes suivant leur configuration de base, faire une représentation de la structure de chacune de ces bases azotées et attribuer une nomenclature chimique à chacune d’elle. B- Comparaison entre nucléotide et nucléoside C- Citer les différents nucléosides et les nucléotides correspondants. D- Comment se fait l’hybridation des nucléotides E- Dans un tableau, établir une comparaison entre l’ADN et l’ARN F- Quel est le type de liaison qui lie les nucléotides d’un brin d’ADN ? et celle qui lie les deux brins d’ADN G- Pourquoi dit-on que la molécule d’ADN est antiparallèle ? H- Expliquer le modèle semi conservatif de la réplication de l’ADN I- À quel moment de la cellule le chromosome est-il visible ? J- Donner la configuration d’un chromosome bactérien K- Citer 3 techniques permettant d’explorer les différentes formes que peuvent prendre les chromosomes bactériens TRAVAUX DIRIGES SPECIAUX DE L’UE BIOS 3086 Année académique 2021/2022 2 L- Donner la formule chimique de l’ATP M- Classifier ces bases en fonction de leur structure de base et donner les structures chimiques des différentes bases azotées. N- Ecrire la structure d'un nucléoside 3' monophosphate 3- Questions à choix multiples QUESTION 1. Parmi les propositions suivantes, choisir celle qui ne correspond pas à des nucléosides de l'ADN- cocher une seule réponse A) Guanosine B) Thymidines C) Adénosine D) Cytosine QUESTION 2. Parmi les propriétés de l'ADN, choisir la proposition fausse : - cocher une seule réponse - A) La forme prépondérante de l'ADN dans les cellules est la double hélice droite B) Dans sa configuration ADN-B, il y a environ 10 paires de bases par tour d'hélice C) L'hélice se forme grâce à un appariement spécifique base purique base pyrimidique D) Les bases puriques et pyrimidiques sont parallèles à l'axe de l'hélice E) L'extrémité 3' d'une chaîne polynucléotidique est terminée par un groupement hydroxyle QUESTION 3. Parmi les propositions suivantes relatives à la structure de l'ADN, laquelle est fausse ? - cocher une seule réponse - A) L'ADN est riche en charges électriques négatives B) L'ADN génomique est constitué de l'assemblage de deux chaînes polynucléotidiques C) L'ADN adopte une structure en double hélice D) Le pas de l'hélice -forme B- est d'environ 34 nanomètres E) L'unité de base d'un brin d'ADN est représentée par un nucléotide 3 QUESTION 4. Parmi les informations suivantes relatives aux purines, indiquer l'information exacte - cocher une seule réponse A) L'hypoxanthine est une base naturelle des acides nucléiques B) La liaison des purines avec le pentose d'un nucléotide s'effectue au niveau de l'atome d'azote 9 du cycle purine C) L'adénine possède un substituant amine secondaire D) Le noyau purine est un hétérocycle à neuf carbones E) Il existe deux bases puriques dans l'ADN et trois bases puriques dans l'ARN QUESTION 5. Choisir l'information fausse relative aux nucléosides cocher une seule réponse - A) Dans le cas de nucléosides dérivés de bases puriques, l’atome 1’ du pentose est lié avec l’atome N9 de la base azotée B) Un nucléoside est une structure formée par l’association entre une base azotée et un sucre C) Dans le cas de nucléosides dérivés de bases pyrimidiques, l’atome 1’ du pentose est lié avec l’atome N1 de la base azotée D) Un nucléoside contient une liaison Béta-N-glycosidique E) L’appellation des nucléosides dérivés des bases pyrimidiques se termine par -osine QUESTION 6. Choisir l'information fausse concernant les bases pyrimidiques et puriques des acides nucléiques - cocher une seule réponse - A) Elles absorbent fortement à la longueur d'onde 260 nm qu'a la longueur 280 nm B) Présentent des dérivés méthylés C) Elles sont dépourvues de liaisons N-H D) Le noyau purine est présent dans l'adénine et la guanine 4 E) Le noyau pyrimidine est présent dans l'uracile, la thymine et la cytosine QUESTION 7 Choisir l'information fausse concernant les nucléosides : cocher une seule réponse A) Les nucléosides avec une base purique sont : l'adénosine et la guanosine B) Possèdent une base purique ou pyrimidique C) Les nucléosides avec une base pyrimidique sont : l'uridine, la cytidine et la thymidine D) La liaison base-ose est généralement alpha N-osidique E) Possèdent un sucre, le ribose ou le 2'-désoxy-ribose QUESTION 8. Choisir l'information fausse concernant les nucléotides cocher une seule réponse - A) Dans l'adénosine 5'-triphosphate, il existe des liaisons esters phosphoriques de type : [=PO-O-PO=] B) Les nucléotides résultent de la formation d'une liaison ester entre l'ose du nucléoside et l'acide phosphorique C) Ils possèdent : une base -purique ou pyrimidique-, un ose et de l'acide phosphorique D) Les nucléosides après phosphorylation -généralement en -5' de l'ose sont transformés en nucléotides correspondants E) A pH neutre -pH = 7-, les groupements phosphates des nucléotides sont ionisés et présentent des charges électriques négatives QUESTION 9. Choisir l'information correcte concernant le sucre des nucléosides : - cocher une seule réponse - A) Le sucre est en conformation alpha B) Le sucre est un cétohexose 5 C) Le sucre des nucléosides est porteur d’au moins une fonction hydroxyle D) Le sucre est le L-ribose pour l’ARN et le L-désoxyribose pour l’ADN E) Les atomes de carbone des sucres sont numérotés de 1’ à 6’ QUESTION 10. Choisir l'information fausse concernant le tétranucléotide (à désoxyribose) suivant : 5' -TCAG- 3' -choisir une seule réponse- : A) L'extrémité -3' est libre -OH B) La séquence tétra nucléotidique complémentaire -à désoxyribose- est : 5' -CTGA- 3' C) Il peut être clivé par des exonucléases D) L'extrémité -5' n'est pas phosphorylée E) Il comporte deux groupements phosphodiesters QUESTION 11. Choisir l'information fausse concernant les polynucléotides : -choisir une réponse- : A) Ils contiennent des liaisons phosphodiesters B) Par convention, leur lecture s'effectue dans le sens 5'à 3' C) Dans un polynucléotide circulaire, l'extrémité -3' du sucre ne présente pas de groupe -OH libre D) L'extrémité 3' comporte un groupement phosphate E) Ils comportent des charges négatives à pH = 7 provenant des groupements ionisés phosphates Exercice Exercice 1 Soient les molécules d’ADN suivantes. Si chacune d’elles est mise en contact avec une ADN polymérase et les quatre désoxynucléotides triphosphates, dites si la synthèse se produit ou non dans chaque cas : 6 Exercice 2 Regardez attentivement les structures des molécules suivantes : 1. A votre avis, que se passerait-il si la didésoxycytidine triphosphate (ddCTP) était ajoutée à la réaction de réplication de l’ADN en large excès par rapport à la concentration de désoxycytidine triphosphate (dCTP) ? 2. Que se passerait-il si ddCTP était ajoutée à 10% de la concentration de dCTP ? 3. A votre avis, que se passerait-il si la didésoxycytidine monophosphate (ddCMP) était ajoutée à la réaction de réplication de l’ADN en large excès ou à 10% de la concentration de dCTP ? EXERCICE 3. a) D'après l'étude de Chargaff sur la composition en bases, lesquelles des propositions qui suivent pourraient-elles caractériser tout échantillon d'ADN non viral ? b) Si la teneur en C d'une préparation d'ADN bicaténaire est de 15%, quelle est la teneur en A ? Justifiez votre réponse. 7 c) Pour quelle raison les 2 brins de la molécule d'ADN restent-ils associés ? Quelle partie de la molécule est impliquée ? Que se passe-t-il quand on augmente la T ? Comment visualise-t-on le phénomène ? Comment l'appelle-t-on ? EXERCICE 5 Parmi les liaisons du groupe A quelles sont celles qui relient dans chacun des cinq cas les éléments du groupe B. Groupe A Groupe B A - ester phosphate 1 - deux désoxyribonucléotides successifs dans un ADN B anhydride d'acide 2 - nucléoside et H3P04 C - liaisons Hydrogène 3 - deux bases dans une même chaîne d'un ADN double brin D - liaison N-glycosidique 4 - deux bases dans une paire de bases E aucune 5 - ribose et adénine 6- deux phosphates d'un nucléotide polyphosphate uploads/Ingenierie_Lourd/ fiche-de-td-n-1-bios-3086-genetique-microbienne.pdf