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1 Le 28 janvier 2021 Le variant Omicron concerne actuellement la majorité des d

1 Le 28 janvier 2021 Le variant Omicron concerne actuellement la majorité des décès hospitaliers avec Covid-19 Appariements entre les bases SI-VIC, SI-DEP et VAC-SI L’actualisation des statistiques de tests et d’entrées hospitalières selon le statut vaccinal et le variant, publiées chaque semaine par la Drees, confirme la sur-représentation des personnes non vaccinées dans les évènements liés au Covid-19 par rapport à leur part dans la population générale. L’estimation de la protection conférée par le vaccin et son rappel contre les formes graves selon le variant est également actualisée, via une modélisation améliorée qui distingue l’efficacité vaccinale par âge. Par ailleurs, cette publication présente pour la première fois les statistiques et estimations de protection vaccinale contre les décès en distinguant les personnes affectées par le variant Omicron et celles affectées par le variant Delta. Les résultats obtenus sont susceptibles d’évoluer encore avec de futures observations, notamment parce que le variant Omicron ne circule que depuis fin 2021 sur le territoire. Néanmoins, il ressort des analyses actuelles les conclusions suivantes : - depuis la mi-décembre 2021, la hausse fulgurante des tests positifs a été portée par le variant Omicron qui s’est développé extrêmement rapidement et représente désormais la quasi- totalité du nombre de tests RT-PCR positifs, soit 99 % des nouveaux cas détectés du 17 au 23 janvier 2022. Durant cette même semaine, il représente plus de 88 % des admissions hospitalières conventionnelles et plus de 79 % des entrées en soins critiques : ces différences de proportion, qui demeurent bien qu’elles se réduisent semaine après semaine, s’expliquent, d’une part, par une différence chronologique, les hospitalisations étant décalées d’environ une semaine par rapport aux infections, et, d’autre part, par une augmentation plus mesurée de la proportion des patients touchés par Omicron dans les hospitalisations que dans les tests positifs ; - entre le 17 et le 23 janvier 2022, le variant Omicron est majoritaire (57 %) parmi les décès survenus à l’hôpital pour lesquels un test RT-PCR positif a été identifié auparavant ; - le vaccin, et plus particulièrement la dose de rappel reste efficace contre les formes graves d’Omicron (plus de 75 % d’efficacité vaccinale pour les 20 ans ou plus) et particulièrement contre les décès (90 % d’efficacité vaccinale pour les 40 ans ou plus), même si l’efficacité est réduite par rapport au variant Delta. En revanche, l’efficacité contre l’infection symptomatique diminue nettement pour le variant Omicron par rapport au variant Delta. Enfin, les durées d’hospitalisation apparaissent, à ce stade, un peu plus courtes pour le variant Omicron par rapport au variant Delta, mais ces estimations peuvent encore être revues dans les prochaines semaines, à mesure que davantage de séjours complets auront pu être observés. 2 Ces résultats sont issus du rapprochement des informations issues de SI-VIC, SI-DEP et VAC-SI, les systèmes d’information portant respectivement sur les hospitalisations, les tests et la vaccination Covid-19. Les résultats nationaux ainsi que des déclinaisons régionales et par classe d’âge sont mis à disposition sous forme de graphiques en format pdf et de fichiers csv permettant d’exploiter plus finement les résultats présentés. Ces fichiers sont disponibles sur le site de données ouvertes de la DREES. Le fichier par âge contient les variables de proportion d’Omicron parmi les tests et les événements hospitaliers. https://data.drees.solidarites-sante.gouv.fr/pages/accueil/ 3 Table des matières Tests et entrées hospitalières distingués entre variant Omicron et Delta .......... 4 La quasi-totalité des nouveaux tests RT-PCR positifs relève désormais du variant Omicron ............. 4 La proportion d’entrées hospitalières de patients infectés par le variant Omicron se rapproche désormais de celle des test RT-PCR positifs Omicron ......................................................................... 5 Le variant Omicron est aussi largement majoritaire parmi les patients entrant en soins critiques ... 6 La proportion de personnes décédées lors d’un séjour hospitalier porteuses du variant Omicron est plus faible que la proportion des personnes hospitalisées porteuses d’Omicron. ............................. 7 Estimation de protection vaccinale par âge ...................................................... 13 À âge donné et à intensité de circulation épidémique donnée, les doses de rappel à plus 6 mois réduisent fortement le risque d’hospitalisation avec Covid-19 ........................................................ 13 Durées de séjour par variant ............................................................................ 19 En première analyse, les durées de séjours des patients atteints par Omicron apparaissent plus courtes qu’avec le variant Delta ........................................................................................................ 19 Répartition des tests et des hospitalisations selon le statut vaccinal ............... 20 Évolution des tests et entrées hospitalières à taille de population comparable selon le statut vaccinal ..................................................................................... 24 Annexe – Décès par âge et statut vaccinal ....................................................... 26 Annexe – Définitions et méthodes ................................................................... 28 Annexe – Description détaillée du modèle de risques ...................................... 32 Description mathématique du modèle (exemple : estimation du risque d’hospitalisation avec covid- 19) ...................................................................................................................................................... 32 Précisions opérationnelles ................................................................................................................ 33 4 Tests et entrées hospitalières distingués entre variant Omicron et Delta La quasi-totalité des nouveaux tests RT-PCR positifs relève désormais du variant Omicron Une part, qui demeure importante, des tests RT-PCR positifs font l’objet d’un criblage1. Cela permet d’identifier rapidement, avec une certaine fiabilité, le variant dont il est question, même si cette méthode reste moins précise que le séquençage complet du génome du virus. Il est donc possible, à partir de l’information de criblage, de décomposer le nombre de tests positifs entre ceux qui relèvent du variant Omicron (« proxy Omicron » dans les graphiques) et les autres, qui sont attribués au variant Delta (« proxy Delta », voir annexe Définitions et méthodes pour plus de précisions). Depuis la mi-décembre, la hausse fulgurante des tests positifs a été portée par le variant Omicron qui s’est développé extrêmement rapidement. Le variant Omicron représente désormais 99 % des nouveaux cas détectés du 17 au 23 janvier 2022 (graphique 1). Les autres cas (soit 1 % des tests RT- PCR positifs) relèvent essentiellement du variant Delta. 1 Alors que tous les tests RT-PCR positifs devaient être criblés jusqu’à fin 2021, seule une fraction d’au moins un quart de ces tests doit désormais faire l’objet d’un criblage. Cette mesure a été mise en place dans le but de limiter la charge pesant actuellement sur les laboratoires qui font face à un volume exceptionnellement élevé de tests positifs. Un peu plus de 45 % des RT-PCR ont fait l’objet d’un criblage entre le 17 et le 23 janvier 2022. Néanmoins, compte tenu du nombre très important de tests RT-PCR positifs effectués, la part des tests criblés demeure largement suffisante pour fournir une estimation fiable de la part respective des variants Omicron et Delta. 5 Graphique 1 : nombre quotidien de tests RT-PCR positifs selon l’indication de variant Source : SI-DEP. Calculs DREES. Données extraites le 25 janvier 2022 pour la période du 31 mai 2021 au 23 janvier 2022. Notes : la proportion de tests RT-PCR positifs indiquant le variant Omicron est supposée la même dans l’ensemble des tests RT-PCR naso-pharyngés qu’au sein des tests positifs criblés. Données en moyenne quotidienne sur 7 jours glissants. Jusqu’à fin juillet 2021 d’autres variants coexistaient dans des proportions non négligeables avec le variant Delta, notamment, les variants dits britannique, sud-africain et brésilien qui sont ici agrégés avec le proxy Delta. Lecture : durant la semaine du 17 au 23 janvier 2022, 135 900 tests RT-PCR positifs quotidiens ont été prélevés, dont 99 % sont estimés relever du variant Omicron, soit 134 000. La proportion d’entrées hospitalières de patients infectés par le variant Omicron se rapproche désormais de celle des test RT-PCR positifs Omicron Une décomposition similaire à la précédente, non plus réalisée sur les tests RT-PCR positifs, mais sur les entrées en hospitalisation conventionnelle, fait apparaître un accroissement beaucoup moins rapide de la part des entrées attribuables au variant Omicron (graphique 2). Cependant, les personnes hospitalisées qui relèvent du variant Omicron sont maintenant largement majoritaires : du 17 au 23 janvier 2022, le variant Omicron représente 88 % des entrées en hospitalisation conventionnelle (alors qu’il concerne 99 % des tests RT-PCR positifs). 6 Graphique 2 : nombre quotidien d’entrées en hospitalisation conventionnelle pour lesquelles un test RT-PCR positif a été identifié, selon l’indication de variant Source : appariement SI-VIC, SI-DEP. Calculs DREES. Données extraites le 25 janvier 2022 pour la période du 31 mai 2021 au 23 janvier 2022, données provisoires - sous-estimées - après le 17 janvier (à droite du trait pointillé vertical). Note : l’ensemble des entrées en hospitalisation conventionnelle pour lesquelles un test RT-PCR positif a été identifié est réparti selon la proportion d’entrées en hospitalisation conventionnelle pour lesquelles le criblage associé est indicateur du variant Omicron parmi les entrées en hospitalisation conventionnelle avec un test RT-PCR criblé. Données en moyenne quotidienne sur 7 jours glissants. Jusqu’à fin juillet, d’autres variants coexistaient dans des proportions non négligeables avec le variant Delta, notamment, les variants dits britannique, sud-africain et brésilien ; ils sont ici agrégés avec le variant Delta. Lecture : parmi les 1 425 entrées quotidiennes moyennes en hospitalisation conventionnelle pour lesquelles un test RT-PCR positif a été identifié, 88 % relevaient du variant Omicron, soit 1 257, durant la semaine du 17 au 23 janvier 2022. Le variant Omicron est aussi largement majoritaire parmi les patients entrant en soins critiques uploads/Sante/ 2022-01-28-appariements-sivic-sidep-vacsi-drees.pdf