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Genomique corrige LICENCE BIOLOGIE FONDAMENTALE Section SV PARCOURS BIOTECHNOLOGIES ET AMELIORATION DES PLANTES BAP TRAVAUX DIRIGES GENOMIQUE DES EUCARYOTES M AIT HAMZA Année universitaire CExercice La séquence d ? ADN ci-dessous concerne un fragment de n

LICENCE BIOLOGIE FONDAMENTALE Section SV PARCOURS BIOTECHNOLOGIES ET AMELIORATION DES PLANTES BAP TRAVAUX DIRIGES GENOMIQUE DES EUCARYOTES M AIT HAMZA Année universitaire CExercice La séquence d ? ADN ci-dessous concerne un fragment de nucléotides de la séquence codante du gène spoIIG de Bacillus subtilis 'P GAAAAAACTG AAATTACGGT TGACGCACCT CTGGTATAAG CTGCTGATGA AACTTGGGCT GAAAAGTGAT GAAGTCTATT ACATAGGCGG GAGTGAAGCC CTGCCGCCTC CATTATCTAA 'OH a la protéine codée par le gène entier fait Da Quel pourcentage de la protéine représente la partie codée du fragment Le fragment est constitué de nucléotides et donc de codons nucléotides par codon On aura donc acides aminés à partir de cette séquencé Or on sait que l'on a en moyenne Da par acide aminé On aura donc PM x Da soit kDa On peut donc calculer le pourcentage Pourcentage x b le tableau ci- dessous concerne nucléotides du fragment de nucléotides de la séquence codante du gène spoIIG de bacillus subtilis Compléter le tableau d la façon suivante Indiquez sur chaque ligne au niveau des colonnes A et H s ? il s ? agit d ? une extrémité ? ou bien ? ou bien C-ter ou bien Nter Justi ?ez votre réponse Complétez les nucléotides manquants Justi ?ez ce que vous porterez dans chaque case ADN brin a ADN brin b ARNm Anticodons ARNt Acides aminés Ext A B C D E F G H Ext ? TTT CAT CAG CAG CTT ATA CCA GAG ? ? AAA GTA GTC GTC GAA TAT GGT CTC ? ? AAA UUA GUC GUC GAA UAU GGU CUG ? ? TTT CAT CAG GAG GUG ATA CCA GAG ? Ct Lys Met Leu leuc LYS TYR TRP Leu Ht Exercice Le schéma ci-dessous illustre le principe de la méthode de séquençage de l ? ADN des didésoxynucléotides ou terminateurs de chaines On rappelle que cette méthode est basée sur l ? incorporation aléatoire d ? analogues des désoxynucléosides triphosphates les diésoxynucléotides triphosphates dans les brins néosynthétsés par l ? ADN polymérase La chaine d ? ADN monocaténaire est schématisée dans le sens ? ?? le détail de sa séquence est donnée ans la partie o? est initiée la réaction de polymérisation L ? amorce est schématisée par une ligne noire a Donner la séquence de l ? amorce utilisée en précisant bien les extrémités ? et ? La séquence de l ? amorce utilisée ' TTAGCACGACTACAAGAG ' Cette séquence est le complémentaire du brin matrice CAinsi la lecture de la séquence correspondra à la complémentaire de la matrice L ? électrophorèse est réalisée à PH en présence d ? urée M On supposera que le produit le plus rapide indiqué par une èche sur l ? auto- radiogramme ci-dessous et schématisé sur la partie gauche correspond à l ? amorce additionnée du er nucléotide G b Lire la sequence en precisant les extremites ' et ' En bas du gel correspond les fragments les pluspetits donc il faut lire de bas en haut En regardant dans quelle colonne se trouve le fragment