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texte de l x27 article 29189 1 10 20200622 pdf

F PITEL J RIQUET INRA Laboratoire de Génétique Cellulaire BP Castanet-Tolosan cedex e-mail pitel toulouse inra fr - Polymorphismes génétiques Les marqueurs anonymes et la détection de leur polymorphisme Résumé Les marqueurs génétiques les plus utilisés actuellement en génétique animale sont présentés sans que soient développées dans le détail toutes les techniques mises en oeuvre Nous distinguons les marqueurs utilisés avant la PCR Polymerase Chain Reaction et ceux qui sont employés depuis Les marqueurs actuels sont également présentés en deux groupes ceux qui sont utilisés pour une approche globale du génome et ceux que l ? on emploie dans des approches ponctuelles en distinguant la mise en évidence d ? un polymorphisme et son exploitation à grande échelle Nous évoquons en ?n les SNP Single Nucleotide Polymorphism qui seront probablement des marqueurs très utilisés dans l ? avenir gr? ce à la technologie des ? puces à ADN ? Il existe d ? autres types de marqueurs que les marqueurs moléculaires et d ? autres manières de les localiser que la cartographie génétique Nous ne nous intéresserons ici qu ? aux marqueurs les plus utilisés en génétique moléculaire les marqueurs génétiques existant sur l ? ADN Ce sont des fragments d ? ADN correspondant à des locus pour lesquels il existe dans le génome d ? une espèce plusieurs formes plusieurs allèles c ? est le polymorphisme sés dans cet article Des détails concernant ces di ?érentes techniques sont disponibles dans les ouvrages répertoriés dans les références bibliographiques ?gurant à la ?n de ce texte Les utilisations de ces marqueurs élaboration des cartes génétiques recherche de QTL sélection assistée par marqueurs contrôle de ?liation études de diversité génétique sont présentées dans la suite de l ? ouvrage On peut les classer en deux grands types les motifs répétés - pour lesquels le polymorphisme repose sur la variation entre allèles du nombre de répétitions d ? une même séquence courte d ? ADN - et les mutations ponctuelles ou SNP Single Nucleotide Polymorphism - auxquelles on peut adjoindre les insertions délétions - pour lesquelles le polymorphisme repose sur des changements de constitution de la séquence d ? ADN remplacement d ? une base par une autre insertion ou délétion d ? un fragment de quelques paires de bases Les sources de polymorphismes sont présentées en détail dans le texte de L Schibler cet ouvrage En fonction du type d ? analyse que l ? on veut e ?ectuer détection d ? un polymorphisme ponctuel exploitation à grande échelle de ce polymorphisme observation de l ? ensemble du génome l ? un ou l ? autre type de marqueurs est utilisé De plus le même type de marqueur peut être analysé par di ?érentes techniques là encore suivant l ? échelle du programme à mener à bien Par abus de langage on confond ainsi en général le marqueur étudié avec la technique utilisée pour le mettre en évidence c ? est le cas dans la suite de ce texte qui est loin