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Modelisation mathematique de la dynamique de diffusion de bacteries resistantes aux antibiotiques

Mod ?elisation math ?ematique de la dynamique de di ?usion de bact ?eries r ?esistantes aux antibiotiques application au pneumocoque Lulla Opatowski To cite this version Lulla Opatowski Mod ?elisation math ?ematique de la dynamique de di ?usion de bact ?eries r ?esistantes aux antibiotiques application au pneumocoque Biotechnology Universit ?e Pierre et Marie Curie - Paris VI French HAL Id tel- https tel archives- ouvertes fr tel- Submitted on Apr HAL is a multi-disciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scienti ?c research documents whether they are published or not The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad or from public or private research centers L ? archive ouverte pluridisciplinaire HAL est destin ?ee au d ?ep ot et a la di ?usion de documents scienti ?ques de niveau recherche publi ?es ou non ?emanant des ?etablissements d ? enseignement et de recherche fran cais ou ?etrangers des laboratoires publics ou priv ?es CTHESE DE DOCTORAT DE L ? UNIVERSITE PIERRE ET MARIE CURIE École doctorale Santé Publique et Sciences de l ? Information Biomédicale Spécialité Biostatistiques Biomathématiques Présentée par Mme Lulla OPATOWSKI MEZRAHI Pour obtenir le grade de DOCTEUR de l ? UNIVERSITÉ PIERRE ET MARIE CURIE Sujet de la thèse Modélisation mathématique de la dynamique de di ?usion de bactéries résistantes aux antibiotiques Application au pneumocoque Directeurs de thèse Messieurs Didier GUILLEMOT et Pierre-Yves BO? LLE soutenue le mars devant le jury composé de M GUILLEMOT Didier M BO? LLE Pierre-Yves M ABDELKADER Mokkadem M GAILLARD Jean-Louis M PAKDAMAN Khashayar M ASTAGNEAU Pascal Directeur de thèse Directeur de thèse Rapporteur Rapporteur Examinateur Examinateur Thèse réalisée dans l ? unité de Pharmaco-Epidémiologie des Maladies Infectieuses PhEMI Institut Pasteur INSERM U PhEMI Institut Pasteur rue du docteur Roux PARIS C CTitre de la thèse Modélisation mathématique de la dynamique de di ?usion de bactéries résistantes aux antibiotiques Application au pneumocoque Résumé de la thèse L ? objectif de cette thèse est de développer des outils de modélisation mathématique a ?n d ? étudier la dynamique de transmission des souches de pneumocoque dans la communauté La dynamique d ? émergence et de di ?usion de bactéries résistantes dans la population est di ?cile à anticiper les phénomènes se produisent à di ?érentes échelles bactérie hôte et population et les bactéries circulent dans des environnements humains complexes nombreux antibiotiques et vaccins Dans ce cadre la formalisation mathématique et la simulation peuvent contribuer à mieux comprendre et anticiper les phénomènes en jeu Trois questions principales sont posées dans ce travail Elles portent sur l ? e ?et d ? une modi ?cation de l ? exposition antibiotique sur la distribution des résistances du pneumocoque les conséquences de l ? usage de vaccins conjugués sur les distributions de souches et l ? étude de la dynamique d ? incidence des méningites à pneumocoque Pour y répondre modèles mathématiques compartimentaux spéci ?ques sont construits Les résultats des simulations renforcent l ? idée que l ? exposition