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République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’enseignement sup

République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche scientifique Université Abou Bekr Belkaïd Tlemcen Faculté des Lettres et Sciences Humaines et Sociales Département de Culture Populaire Mémoire de fin d’étude en vue de l’obtention du diplôme de Magister Option « Anthropologie Biologique » Présenté par : Mme OTMANI Salima Devant le jury : Mr Chaif Okkacha. Professeur-université de Tlemcen Président Mme Aouar Metri Amaria. Maître de conférences-université de Tlemcen Promotrice Mme Yadi Baya. Chargée de cours-université de Tlemcen Co-promotrice Mr Saidi Mohamed Professeur-université de Tlemcen Examinateur Mme Dali Youcef Majda Chargée de cours-université de Tlemcen Examinateur Année universitaire 2008-2009 Caractérisation Anthropogénétique de la population de Honaïne dans l’Ouest Algérien. Analyse comparative du polymorphisme des groupes sanguins (ABO, Rh, MNSs, Duffy) et des dermatoglyphes à l’échelle de la Méditerranée. Problématique………………………………………………………………………..……………. 1 Introduction générale………………………………………………………………………….….. 2 Première partie : Synthèse bibliographique Chapitre 1 : Etude anthropo-socioculturelle 1-Présentation générale de la région …………………………………………………………….. 4 1-1- Aspect démographique ………………………………………………………………….. 7 1-2- Les caractérisations géographiques …………………………………………………….. 8 1-2-1-Géomorphologie………………………………………………………………………... 8 1-2-2- Hydrologie……………………………………………………………………………… 9 1-2-3- Le climat ……………………………………………………………………………….. 10 1-3- Activités économiques……………………………………………………………………. 10 1-3-1- Agriculture et élevage………………………………………………………………… 10 1-3-2- Pêche ………………………………………………………………………………… 11 2- Cadre historique …………………………………………………………………………………. 11 2-1- Honaïne dans l’antiquité ……………………………………………………….………… 11 2-2- Honaïne dans le médiéval ……………………………………………………………….. 12 2-3- Honaïne dans le contemporain ………………………………………………………….. 13 3- Anthropologie humaine de la région de Honaïne ……………………………………………. 14 3-1- L’homme préhistorique de la région………………………………..……………………. 14 3-2- Les tribus ayants occupé la région durant l’antiquité…………………………………... 14 3-3- Les tribus de la région durant la période médiévale …………………………………... 16 3-4- Hiérarchie social et généalogie des Trara …………………………………………….. 18 Chapitre 2 : Etude anthropo-physique 1- Les marqueurs génétiques sélectionnés ………………………………………………………. 20 1-1- Le polymorphisme génétique des groupes sanguins …………………………………. 20 1-1-1- La notion de groupe sanguin chez l’homme ………………………………………. 20 1-1-2- Systèmes des antigènes des groupes sanguins ………………………………….. 22 a- Système ABO……………………………………………………………………….. 24 b- Système Rhésus …………………………………………………………………… 27 c- Système MNS ……………………………………………………………………….. 31 d- Système Duffy ………………………………………………………………………. 32 1-2- Empreintes digitales (Dermatoglyphes)…………………………………………………. 34 1-2-1- Généralités ……………………………………………………………………………. 34 1-2-2- Histoire et intérêt anthropologique des dermatoglyphes …………………………. 35 1-2-3- Génétique………………………………………………………………………………. 35 1-2-4-Les principales classes des dermatoglyphes des doigts et leurs caractéristiques …………………………………………………………………………………….. 36 a-Caractéristiques de l’empreinte digitale ……………………………….……..…… 36 b-Classification des empreintes digitales …………………………………………… 37 1-3- Consanguinité……………………………………………………………………………… 39 1-3-1- Effet de la consanguinité sur la morbidité………………………………………….. 40 1-3-2- Effet de la consanguinité sur la fécondité et la mortalité …………………………. 40 Deuxième partie : Matériel et Méthodes 1- Echantillonnage …………………………………………………………………………………... 42 2- Groupage sanguin ………………………………………………………………………………. 43 2-1- Préparation de la solution érythrocytaire………………………………………………… 43 2-2- Groupage ABO ……………………………………………………………………………. 43 2-2-1- Détermination des sous-groupes A ………………………………………………… 43 2-3- Groupage Rhésus ………………………………………………………………………… 43 2-4- Groupage MN (à froid)…………………………………………………………………….. 43 2-5- Groupage Ss et Groupage Duffy (à chaud) ……………………………………………. 44 3- Dermatoglyphes …………………………………………………………………………………. 44 3-1- Obtention de l’empreinte …………………………………………………………………. 44 3-2- Caractères qualitatifs analysés ………………………………………………………….. 44 4- Consanguinité …………………………………………………………………………………….. 45 5- Analyses statistiques ……………………………………………………………………………. 45 5-1- Groupes sanguins ……………………………………………………………………….. 45 5-1-1- Fréquences alléliques et haplotypiques ……………………………………………. 45 5-1-2- L’hétérozygotie ……………………………………………………………………….. 45 5-1-3-Comparaisons et relations inter populationnelles…………………………………... 46 a- Comparaisons inter populationnelles des fréquences alléliques et haplotypique …………………………………………………………………………………………. 46 b- Diversité Génétique………………………………………………………………….. 46 c- Distances Génétiques……………………………………………………………….. 46 5-1- 4- Arbres phylogénétique ………………………………………………………………. 46 5-1-5- Analyse en composantes principales (ACP) ………………………………………. 46 5-2- Dermatoglyphes …………………………………………………………………………… 47 5-3- Consanguinité …………………………………………………………………………….. 47 6- Questionnaire Socio-anthropologique …………………………………………………………. 47 Troisième partie : Résultats et interprétations 1- Résultats du polymorphisme érythrocytaire …………………………………………………… 48 1-1- Fréquences phénotypiques et alléliques……………………………………………….. 48 1-2- Comparaisons inter populationnelles …………………………………………………… 50 1-2-1- Système ABO………………………………………………………………………….. 50 1-2-2- Le système Rhésus …………………………………………………………………... 54 1-2-3- Le système MNS ……………………………………………………………………… 57 1-2-4- Le système Duffy ……………………………………………………………………… 60 1-3- La diversité génétique ……………………………………………………………………. 64 1-3-1- Diversité intra-région …………………………………………………………………. 64 1-3-2 Diversité Totale (FPT) ………………………………………………………………….. 65 a- Système ABO ………………………………………………………………………. 66 b- Système Rhésus……………………………………………………………………. 66 c- Système MNS………………………………………………………………………. 66 d- Système Duffy ……………………………………………………………………… 66 1-4-Affinités inter populationnelles ……………………………………………………………. 66 1-4-1- Analyse en composantes principales ……….……………………………………… 66 1-4-2- Arbre phylogénétique ………………………………………………………………… 68 2- Résultats du polymorphisme des dermatoglyphes …………………………………………… 72 2-1- Figures digitales……………………………………………………………………………. 72 2-1-1- Fréquences ……………………………………………………………………………. 72 2-1-2- Comparaison bimanuelles …………………………………………………………… 75 2-1-3- Comparaisons sexuelles …………………………………………………………….. 75 2-1-4- Comparaisons inter populationnelles ………………………………………………. 78 2-2- Analyse en composante principale………………………………………………………. 83 2-2 -1- Analyse comparative en composante principal sexe féminin ………………… 83 2-2-2- Analyse comparative en composante principal sexe masculin……………….. 85 3- Consanguinité …………………………………………………………………………………… 87 3-1- Fréquence de la consanguinité ………………………………………………………….. 87 3-2- Conséquence de la consanguinité sur la descendance ………………………………. 89 3-2-1- Effet de la consanguinité sur la mortalité ………………………………………….. 89 3-2-2- Effet de la consanguinité sur les avortements …………………………………….. 89 3-2-3- Morbidité ………………………………………………………………………………. 90 4- Discussion…………………………………………………………………………………………. 91 5- Résultats du questionnaire Socio-anthropologique ………………………………………….. 92 5-1- Habitat, famille……………………………………………………………………………… 92 5-2- Origine de la population et de la langue parlée ……………………………………….. 93 5-3- Traditions culinaires et vestimentaires ………………………………………………….. 93 5-4- Pratique de la consanguinité …………………………………………………………….. 94 5-5- La médecine traditionnelle ………………………………………………………………. 95 5-6- Les marabouts..…………………………………………………………………………… 95 5-7- L’artisanat …………..……………………………………………………………………… 95 Discussion générale………………………………………………………………………………. 97 Conclusion générale………………………………………………………………………………. 99 Références bibliographiques…………………………………………………………………….. 100 Annexes …………………………………………………………………………………………….. 114 Tableau N° 01 : Evolution de la population de Honaïne de 1984 à 2005………………………………. 7 Tableau N° 02 : Structure de la population communale selon l’âge…………………………………….. 7 Tableau N° 03: Répartition de la surface agricole utile…………………………………………………… 10 Tableau N° 04 : Répartition de la surface agricole utile…………………………………………………... 11 Tableau N° 05 : Les polymorphismes génétiques………………………………………………………… 21 Tableau N° 06 : Principaux polymorphismes érythrocytaires humains…………………………………. 23 Tableau N° 07 : Sérologie et génétique du système ABO……………………………………………….. 25 Tableau N° 08 : Mutations ponctuelles différentiant entre les séquences des allèles du système ABO…………………………………………………………………………………………………………….. 26 Tableau N° 09 : Nomenclatures de Wiener et Fisher…………………………………………………….. 28 Tableau N° 10 : Phénotypes et génotypes MNS………………………………………………………….. 31 Tableau N° 11 : Phénotypes, anticorps et génotypes su système Duffy……………………………….. 33 Tableau N° 12 : Répartition de l’échantillon……………………………………………………………….. 42 Tableau N° 13: Comparaisons de la distribution des fréquences alléliques du système ABO de la population de Honaïne avec celles des populations du bassin Méditerranéen et du Moyen Orient … 51 Tableau N° 14 : Comparaison de la distribution des fréquences haplotypiques du système Rhésus de la population de Honaïne avec celles des populations du bassin Méditerranéen et du Moyen Orient…………………………………………………………………………………………………………… 55 Tableau N° 15 : Comparaisons de la distribution des fréquences haplotypiques du système MNS de la population de Honaïne avec celles des populations du bassin Méditerranéen et du Moyen Orient…………………………………………………………………………………………………………… 58 Tableau N° 16 : Comparaisons de la distribution des fréquences alléliques du système Duffy de la population de Honaïne avec celles des populations du bassin Méditerranéen et du Moyen Orient…. 62 Tableau N° 17 : Comparaisons de la distribution des fréquences alléliques du système Duffy de la population de Honaïne avec celles des populations du bassin Méditerranéen et du Moyen Orient…. 63 Tableau N° 18 : Diversité génétique intra région (Fst) pour les groupes sanguins et seuil de signification…………………………………………………………………………………………………….. 64 Tableau N° 19 : Diversité génétique intra-inter région et total par allèle ou haplotype et par système des marqueurs des groupes sanguins dans le bassin Méditerranéen…………………………………... 65 Tableau N° 20 : Distances génétiques (x10-4) en fonction des groupes sanguins à l’échelle de la Méditerranée……………………………………………………………………………………………………. 69 Tableau N° 21: Distance génétiques (x10-4) par ordre décroissant à l’échelle de la méditerranée….. 70 Tableau N° 22 : Fréquences relatives des figures digitales chez la population de Honaïne………….. 73 Tableau N° 23: Fréquences des figures digitales par doigts et par sexe chez la population de Honaïne…………………………………………………………………………………………………………. 74 Tableau N° 24: Comparaison bimanuelles (Droite-Gauche) de la fréquence des figures digitales par doigts et par main chez la population de Honaïne…………………………………………………….. 76 Tableau N° 25 : Différences sexuelles (Hommes-Femmes) de la fréquence des figures digitales par doigts et par main chez la population de Honaïne…………………………………………………………. 77 Tableau N° 26: Variation des fréquences des figures digitales dans la population Méditerranéenne.. 79 Tableau N° 27: Comparaison inter populationnelle des fréquences globales des figures digitales chez les hommes de Honaïne………………………………………………………………………………... 80 Tableau N° 28: Comparaison inter populationnelle des fréquences globales des figures digitales chez les femmes de Honaïne………………………………………………………………………………… 82 Tableau N° 29 : Répartition de la consanguinité dans la population de Honaïne……………………… 87 Tableau N° 30 : fréquence de la consanguinité dans la population de Honaïne comparée à celle d’autres pays…………………………………………………………………………………………………… 89 Tableau N° 31 : Taux de mortalité et lien de parenté des conjoints…………………………………….. 90 Tableau N° 32 : Taux d’avortement et lien de parenté des conjoints……………………………………. 91 Tableau N° 33 : Répartition du taux de morbidité en fonction du degré de consanguinité dans la population de Honaïne………………………………………………………………………………………… 91 Figure N° 01 : Diversité géographique de la Wilaya de Tlemcen………………………………………. 5 Figure N° 02 : Situation géographique de la région de Honaïne………………………………………… 6 Figure N° 03 : Répartition des tribus dans la région des monts des Traras (ANAT, 1987)………….. 17 Figure N° 04: Généalogie de la tribu de Béni Abed et Béni Khellad……………………………………. 19 Figure N° 05: Mécanismes évolutifs générant les différents haplotypes du système Rhésus……….. 29 Figure N° 06 : Une empreinte digitale « niveau 1 »………………………………………………………. 36 Figure N° 07: Les différents points caractéristiques d’une empreinte………………………………….. 37 Figure N° 08 : Classification des empreintes digitales……………………………………………………. 38 Figure N° 09 : Fréquences phénotypiques du système ABO (%)……………………………………….. 48 Figure N° 10 : Fréquences halotypiques du système uploads/Geographie/ caracterisation-anthropogenetique-de-la-population-de-honaine-dans-l-x27-ouest-algerien-analyse-comparative-du-polymorphisme.pdf