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COURS EPIDEMIOLOGIE ANALYTIQUE L2 ENATSE ANNEE ACADEMIQUE 2021-2022 Dr HOUEHANO

COURS EPIDEMIOLOGIE ANALYTIQUE L2 ENATSE ANNEE ACADEMIQUE 2021-2022 Dr HOUEHANOU CORINE PARTIE II 2 SOMMAIRE 3. Etudes cas-témoins ........................................................................................................................................................ 3 3.1. Principe................................................................................................................................................................. 3 3.2. Schémas d’étude ................................................................................................................................................... 3 3.3. Sélection des groupes comparés ........................................................................................................................... 4 3.3.1. Sélection des cas .............................................................................................................................................. 4 3.3.2. Sources d’information pour identifier les cas................................................................................................... 4 3.3.1. Sélection des témoins ....................................................................................................................................... 4 3.3.2. Sources d’information pour identifier les témoins ........................................................................................... 5 3.4. Calcul du nombre de sujets nécessaire ................................................................................................................. 5 3.5. Mesure de l’évènement......................................................................................................................................... 6 3.6. Analyse des données ............................................................................................................................................ 6 3.6.1. Analyse brute ................................................................................................................................................... 6 3.6.1.1. Présentation des résultats ............................................................................................................................. 6 3.6.1.2. Estimation des mesures de fréquence de l’exposition dans chaque groupe ................................................. 7 3.6.1.3. Estimation des mesures d’association .......................................................................................................... 8 3.6.1.4. Précision de la mesure d’association ........................................................................................................... 8 3.6.1.5. Stabilité de l'association ............................................................................................................................... 8 3.6.1.6. Stabilité de l’association .............................................................................................................................. 8 3.6.2. Analyse stratifiée.............................................................................................................................................. 9 3.6.3. Mesures d’impact ........................................................................................................................................... 11 4. Etude transversale ........................................................................................................................................................ 11 4.1. Principe............................................................................................................................................................... 11 4.2. Analyse des données .......................................................................................................................................... 11 4.2.1. Mesure de fréquence ...................................................................................................................................... 11 4.2.2. Mesure d’association, précision, stabilité ...................................................................................................... 12 RÉFÉRENCES .................................................................................................................................................................... 15 ANNEXES ........................................................................................................................................................................... 16 3 3. Etudes cas-témoins 3.1. Principe Il s'agit de comparer deux groupes, constitués en fonction de leur statut vis-à-vis de l’événement, en ce qui concerne la fréquence de l’exposition antérieure à une ou plusieurs caractéristiques données. Ici, deux groupes sont étudiés : d'une part, des sujets présentant l'événement (les « cas ») et, d'autre part, des sujets ne présentant pas l'événement (les « témoins »). Ces deux groupes sont comparés pour leur exposition antérieure à une caractéristique donnée (Figure 4). Attention à ne pas confondre les études cas-témoins (nombre de cas et de témoins fixés par l’équipe réalisant la recherche) et les études de cohorte historique (cohorte reconstituée a priori, et nombre de sujets présentant ou pas l’événement « découvert » à ce moment-là). Figure 6. Schéma général d’une étude cas-témoins. Par exemple, on cherche à étudier le lien entre thrombose veineuse des membres pelviens (TVP) et utilisation de contraceptifs oraux chez les femmes. On compare deux groupes de femmes : un groupe souffrant de TVP et l’autre n’en ayant pas, et on recherche dans leurs antécédents l’utilisation de contraceptifs oraux. 3.2. Schémas d’étude - Le plus souvent, les études cas-témoins sont mises en place spécifiquement, en dehors de toute autre étude. - Mais parfois, il est possible de planifier une étude cas-témoins au sein d'une cohorte : on parle alors d'étude cas-témoins « nichée » dans une cohorte. Les cas sont alors l’ensemble des sujets de la cohorte ayant présenté l'événement ou un échantillon de ces sujets, et les sujets témoins un échantillon des sujets de la cohorte n'ayant pas présenté l'événement. 4 3.3. Sélection des groupes comparés Dans les études cas-témoins, les groupes comparés sont sélectionnés pour un événement donné. On ne peut donc étudier qu'un seul événement à la fois. 3.3.1. Sélection des cas - Il peut s'agir de cas prévalents (c’est-à-dire présentant l’événement depuis déjà un certain temps). Par exemple on inclut dans l'étude tous les cas diagnostiqués dans les années précédant le début de l'étude dans un service clinique. Dans le cas d'événements rares, l'inclusion de cas existants, même anciens, peut devenir incontournable. - Il peut s’agir de cas incidents (c’est-à-dire présentant l’événement depuis peu de temps), si l'on inclut tous les cas au fur et à mesure de leur diagnostic. Dans une étude cas- témoins nichée dans une cohorte, les cas sont incidents. 3.3.2. Sources d’information pour identifier les cas La situation idéale est de disposer d'un recensement exhaustif des cas d'un événement donné dans une population donnée ; elle se rencontre notamment lorsqu'il existe des registres de population pour cet événement, mais ce n’est pas le cas le plus fréquent. Par exemple, afin d’étudier le risque de cancer de peau associé à une exposition aux dermocorticoïdes dans le cadre d’une enquête cas-témoins, une équipe a identifié les cas recensés dans le registre des tumeurs de Cotonou, et dont la maladie a été diagnostiquée entre 2015-2020, soit 100 cas de cancer de peau. Le plus souvent, les cas seront identifiés dans les services cliniques, dans les consultations médicales... Par exemple, dans le cadre d’une étude cas-témoins sur l’association entre démence et tabagisme, les cas ont été recrutés à partir des services de neurologie des centres hospitaliers et des cliniques privées de Cotonou. 3.3.1. Sélection des témoins Le groupe des témoins doit être en tout point comparable au groupe des cas, en dehors de la maladie étudiée. Le choix de ce groupe de référence peut être difficile. Il doit s’agir de sujets : - ne présentant pas la maladie étudiée, 5 - ayant les mêmes caractéristiques que les cas (représentatifs de la population dont est issu le groupe de cas), - pouvant être identifiés comme des cas s’ils développaient la maladie, - ayant la même probabilité d’exposition que les cas, - ayant la même probabilité de contracter la maladie étudiée que les cas. 3.3.2. Sources d’information pour identifier les témoins Il peut s'agir : - d'un échantillon de la population générale, sélectionné à partir de listes électorales, de listes de numéros de téléphone, … Cette approche est la meilleure si les cas ont été identifiés à partir d'un registre de population, ou si les caractéristiques de la population dont est issu le groupe de cas sont connues. Une autre condition est nécessaire : la fréquence de l'événement étudié doit être faible de manière à ce que le nombre de sujets présentant l'événement dans l'échantillon de la population générale soit minime. Elle présente l'avantage de se rapprocher a priori d'une population idéale de sujets ne présentant pas l'événement. En revanche, le recueil des informations peut être long et coûteux, et le nombre de refus peut s'avérer important. - de sujets vus dans les services cliniques. Les principaux intérêts sont qu'il s'agit de sujets qui peuvent être identifiés et contactés aisément et que les refus de participer à une étude sont moins nombreux que dans la population générale. Néanmoins, ces sujets ne sont pas représentatifs de la population générale en ce qui concerne des facteurs de risque tels que le tabagisme ou la consommation élevée d'alcool. - de groupes spécifiques. Il peut s'agir de parents, d'amis, de voisins ou encore de collègues de travail du cas. Les avantages sont nombreux : ces sujets sont plus faciles à identifier et à contacter, ils sont en général plus motivés et refusent moins souvent de participer à une étude. Enfin, ils sont en moyenne assez représentatifs de la population dont est issu le groupe de cas. 3.4. Calcul du nombre de sujets nécessaire Dans le cadre d’une étude cas-témoins, le nombre de sujets, n, à inclure dans chacun des deux groupes, cas et témoins, dépend : 1. de la fréquence de l’exposition chez les témoins (estimant celle dans la population générale PE) (cette hypothèse peut provenir d’une étude antérieure), 6 2. du rapport de cotes attendu (cette hypothèse peut provenir d’une étude antérieure) ; la taille de l’échantillon est d’autant plus importante que l’association recherchée est faible (rapport de cotes attendu proche de 1), 3. du risque α : classiquement, il est choisi égal à 5 %, 4. du risque β : le plus souvent, on choisira β = 20 %, soit une puissance (1 - β) de 80 %, 5. du rapport entre le nombre de cas et de témoins, c’est-à-dire du nombre souhaité de témoins par cas. Souvent, l’effectif des cas disponibles pour l’étude est limité et faible ; on pourra augmenter la puissance de l’étude en augmentant le nombre de témoins par cas. On considère néanmoins qu’au-delà de quatre témoins par cas, le gain en termes de puissance est faible. On peut calculer cette taille avec le logiciel epi info module STATCALC. Par exemple, on souhaite étudier les facteurs de risque génétiques de survenue d’une artériopathie périphérique chez des sujets de moins de 40 ans en comparant des cas à des témoins de même âge ne présentant pas cette pathologie. Si on fait l’hypothèse que la prévalence du facteur génétique étudié est de 15 % chez les témoins et que le rapport de cotes attendu est d’au moins 3, pour α = 5 % et β = 20 %, il faut inclure 85 patients dans chaque groupe si l’on inclut 1 témoin par cas ou 61 cas et 122 témoins si l’on inclut 2 témoins par cas. 3.5. Mesure de l’évènement La mesure de l'exposition est par définition rétrospective. Cette approche expose à de nombreuses erreurs possibles mais présente un avantage important : l'exposition à différentes caractéristiques peut être potentiellement étudiée. 3.6. Analyse des données Rappelons que les formules présentées ici pour estimer les mesures d’association ne s’appliquent qu’à la comparaison de groupes indépendants). Il existe des formules spécifiques pour estimer le RC dans le cas d’études appariées. 3.6.1. Analyse brute 3.6.1.1. Présentation des résultats Les résultats sont résumés dans un tableau de contingence (Tableau 9). 7 Tableau 9. Tableau de contingence dans une étude cas-témoins. Cas Témoins Total Exposés a b E1 Non exposés c d E0 Total M1 uploads/Geographie/ epi-anal21-l2-cours-ii.pdf