BIOCHIMIE L’ESSENTIEL EN FICHES MÉMO VISUEL DE  Xavier Coumoul Professeur à l’

BIOCHIMIE L’ESSENTIEL EN FICHES MÉMO VISUEL DE  Xavier Coumoul Professeur à l’université Paris Descartes  Frédéric Dardel Professeur et président de l’université Paris Descartes  Étienne Blanc Maître de conférences à l’université Paris Descartes © Dunod, 2016 5 rue Laromiguière, 75005 Paris www.dunod.com ISBN 978-2-10-074226-4 Photographies de couverture : En haut à droite : Émulsion d’huile dans de l’eau © Cobalt – Fotolia.com En haut à gauche : Tubes à essais © i-stock/luchschen En bas à gauche : Coenzyme Q 10 ou ubiquinone (ici sous forme de cristaux) ©Biosphoto/Alfred Pasieka/Science Photo Library En bas à droite : Répresseur de l’opéron lactose fixé au sité opérateur © Frédéric Dardel Uniformisation des illustrations : Bernadette Coléno © Dunod, 2014 5 rue Laromiguière, 75005 Paris www.dunod.com ISBN 978-2-10-070528-9 © Dunod, 2014 5 rue Laromiguière, 75005 Paris www.dunod.com ISBN 978-2-10-070528-9 III Table des matières Comment utiliser cet ouvrage X Préface XI Abréviations XIII Chapitre 1 – La cellule et ses constituants L’eau et les ions Fiche 1 L’eau et le vivant 2 Fiche 2 Les ions et le vivant 3 Fiche 3 La structure des glucides 4 Les glucides Fiche 4 Les aldoses 5 Fiche 5 Les cétoses 6 Fiche 6 Les dérivés d’oses 7 Fiche 7 Les dérivés d’oses 8 Fiche 8 Les dérivés d’oses 9 Fiche 9 Les oligosaccharides 10 Fiche 10 Les homopolysaccharides 11 Fiche 11 Les homopolysaccharides 12 Fiche 12 Les glycoprotéines 13 Fiche 13 Les protéoglycanes 14 Les acides aminés et protéines Fiche 14 Les acides aminés 15 Fiche 15 Les acides aminés 16 Fiche 16 La liaison peptidique 17 Fiche 17 Le diagramme de Ramachandran 18 Fiche 18 La structure primaire des protéines 19 Fiche 19 La structure secondaire des protéines 20 Fiche 20 La structure tertiaire des protéines 21 Les lipides Fiche 21 Les acides gras – convention 22 Fiche 22 Les acides gras 23 Fiche 23 Les lipides membranaires 24 Les acides nucléiques et dérivés de nucléotides Fiche 24 La structure des nucléotides 25 Fiche 25 La structure des polynucléotides 26 Fiche 26 L’ATP 27 IV Table des matières Fiche 27 La structure de l’ARN 28 Fiche 28 Les coenzymes principaux d’oxydoréduction 29 Fiche 29 Les coenzymes principaux de transfert 30 L’organisation de la cellule Fiche 30 L’organisation de la cellule 31 Fiche 31 Les membranes plasmiques 32 Fiche 32 Les transports membranaires (passif et diffusif) 33 Fiche 33 Les transports membranaires (actif) 34 Fiche 34 Le pore nucléaire 35 Fiche 35 Les transports nucléocytoplasmiques 36 Fiche 36 La taille des génomes 37 Fiche 37 La taille des objets biologiques 38 Fiche 38 La classification des organismes 39 Chapitre 2 – Les enzymes, des catalyseurs biologiques Les grandes classes d’enzymes et les principes de la catalyse Fiche 39 La classification des enzymes 42 Fiche 40 La catalyse enzymatique 43 Fiche 41 Site actif et état de transition 44 Les enzymes michaeliennes Fiche 42 Le modèle de Michaelis-Menten 45 Fiche 43 L’inhibition compétive 46 Fiche 44 L’inhibition non compétive 47 Fiche 45 L’inhibition suicide 48 Les enzymes allostériques Fiche 46 Allostérie et coopérativité 49 Fiche 47 Les systèmes K 50 Fiche 48 Systèmes K et représentation de Hill 51 Fiche 49 Les systèmes V 52 Chapitre 3 – Le métabolisme cellulaire Les grands principes des régulations métaboliques Fiche 50 Le bilan métabolique 54 Fiche 51 Les effets des substrats et des produits 55 Fiche 52 La chaîne linéaire métabolique 56 V Table des matières Fiche 53 La chaîne ramifiée métabolique 57 Fiche 54 La régulation par des protéines de contrôle 58 Fiche 55 La régulation par modification covalente 59 Fiche 56 La régulation par protéolyse 60 Le métabolisme glucidique Fiche 57 La glycolyse : phase de préparation 61 Fiche 58 La glycolyse : phase de restitution 62 Fiche 59 La régulation de la glycolyse 63 Fiche 60 Les points clés de la glycolyse 64 Fiche 61 La néoglucogenèse 65 Fiche 62 La régulation de la néoglucogenèse 66 Fiche 63 Structure et fonction du glycogène 67 Fiche 64 La synthèse du glycogène 68 Fiche 65 La dégradation du glycogène 69 Fiche 66 La voie des pentoses : phase oxydative 70 Fiche 67 La voie des pentoses : phase non oxydative 71 Le métabolisme respiratoire Fiche 68 Le carrefour du pyruvate 72 Fiche 69 La mitochondrie 73 Fiche 70 La structure de la pyruvate déshydrogénase (PDH) 74 Fiche 71 La régulation de la pyruvate déshydrogénase (PDH) 75 Fiche 72 Le cycle de Krebs – réactions 76 Fiche 73 La régulation du cycle de Krebs 77 Fiche 74 L’ATP synthase : moteur de la cellule 78 Fiche 75 La chaîne respiratoire : couplage avec le cycle de Krebs 79 Fiche 76 La chaîne respiratoire : aspects énergétiques 80 Fiche 77 Cataplérose et anaplérose 81 Fiche 78 Les navettes mitochondriales 82 Le métabolisme lipidique Fiche 79 Le catabolisme des acides gras : activation et transport mitochondrial 83 Fiche 80 Le catabolisme des acides gras : la bêta-oxydation 84 Fiche 81 Le catabolisme des acides gras à C impair ou insaturés 85 Fiche 82 La régulation du métabolisme des acides gras 86 Fiche 83 L’anabolisme des acides gras : du citrate au malonyl-CoA 87 Fiche 84 L’acide gras synthase 88 Fiche 85 L’acide gras synthase 89 Fiche 86 Le métabolisme des triglycérides 90 Fiche 87 Le métabolisme des triglycérides 91 Fiche 88 Le métabolisme du cholestérol 92 Fiche 89 Le métabolisme du cholestérol 93 Fiche 90 Le métabolisme des phospholipides 94 VI Table des matières Fiche 91 Le métabolisme des stéroïdes 95 Fiche 92 La glycéronéogenèse 96 Fiche 93 La cétogenèse 97 Fiche 94 La cétolyse 98 Le métabolisme azoté Fiche 95 Introduction au métabolisme azoté 99 Fiche 96 Les transaminations 100 Fiche 97 Le cycle de l’urée 101 Fiche 98 L’anabolisme des acides aminés 102 Fiche 99 Le catabolisme des acides aminés 103 Quelques métabolismes particuliers Fiche 100 Le métabolisme des purines 104 Fiche 101 Le métabolisme des pyrimidines 105 Fiche 102 Folates et métabolisme 106 Fiche 103 L’autophagie 107 Particularités du métabolisme énergétique végétal Fiche 104 La photophosphorylation 108 Fiche 105 Le cycle de Calvin 109 Fiche 106 Le métabolisme C4 110 Fiche 107 Le métabolisme CAM 111 Chapitre 4 – Réplication de l’ADN et division cellulaire Structure des acides nucléiques et de la chromatine Fiche 108 La chromatine 114 Fiche 109 La topologie de l’ADN 115 L’organisation des gènes Fiche 110 Les topoisomérases 116 Fiche 111 L’organisation du génome 117 Fiche 112 Le contenu du génome 118 La réplication de l’adn Fiche 113 Les ADN polymérases 119 Fiche 114 La réplication 120 Fiche 115 La relecture 121 Les mécanismes de combinaison et de réparation Fiche 116 La recombinaison 122 Fiche 117 La recombinaison 123 Fiche 118 Les lésions de l’ADN 124 Fiche 119 Les lésions de l’ADN 125 VII Table des matières Fiche 120 Les mécanismes de réparation de l’ADN 126 Fiche 121 La réparation directe 127 Fiche 122 La réparation des mésappariements 128 Fiche 123 La réparation par excision de nucléotides 129 Fiche 124 La réparation par excision de base 130 Fiche 125 La réparation par recombinaison 131 Le cycle cellulaire Fiche 126 Les phases du cycle cellulaire 132 Fiche 127 Le contrôle du cycle cellulaire 133 Fiche 128 L’apoptose 134 Chapitre 5 – L’expression des gènes La synthèse des arn Fiche 129 Les ARN polymérases 136 Fiche 130 Les promoteurs 137 Fiche 131 La transcription 138 La maturation des arn messagers Fiche 132 Maturation : la coiffe 139 Fiche 133 Maturation : la queue poly (A) 140 Fiche 134 Épissage des ARN 141 Fiche 135 Épissage des ARN 142 Fiche 136 Épissage des ARN 143 Fiche 137 La régulation de l’expression génétique 144 Fiche 138 La régulation de l’expression génétique 145 Transcription inverse et rétrovirus Fiche 139 La transcription inverse 146 Fiche 140 Les rétrovirus 147 L’expression des protéines Fiche 141 Le code génétique 148 Fiche 142 L’ARN de transfert 149 Fiche 143 La traduction des protéines 150 Fiche 144 La traduction des protéines 151 Fiche 145 La traduction des protéines 152 Fiche 146 La traduction des protéines 153 Fiche 147 Peptide signal et excrétion 154 Fiche 148 Le protéasome 155 Le contrôle d’expression épigénétique Fiche 149 Épigénétique : méthylation de l’ADN 156 VIII Table des matières Fiche 150 Épigénétique : code des histones 157 Fiche 151 Épigénétique : les miARN 158 Chapitre 6 – La signalisation cellulaire Fiche 152 Introduction à la signalisation cellulaire 160 Fiche 153 La signalisation AMPc 161 Fiche 154 La signalisation calcique 162 Fiche 155 La signalisation NO 163 Fiche 156 La signalisation Notch 164 Fiche 157 La signalisation β-caténine 165 Fiche 158 La signalisation RTK 166 Fiche 159 La signalisation STAT 167 Fiche 160 La signalisation des intégrines 168 Fiche 161 La signalisation TGFβ 169 Fiche 162 La signalisation des récepteurs nucléaires 170 Fiche 163 La signalisation NFκB 171 Fiche 164 La signalisation des xénobiotiques 172 Chapitre 7 – Les techniques d’étude biochimique Principes généraux Fiche 165 Le couplage des techniques 174 Fiche 166 Les détergents 175 Fiche 167 La spectrophotométrie 176 Fiche 168 Les radioisotopes 177 Fiche 169 Électrophorèse uploads/Ingenierie_Lourd/ memo-visuel-de-biochimie.pdf

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Ingénierie fiche métabolisme acides signalisation structure
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