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Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Les différent

Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Les différents types d’enquêtes • Etudes descriptives et analytiques • Les enquêtes transversales • Les enquêtes cohortes • Les enquêtes cohortes • Les enquêtes cas/témoins • Compléments 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Études Descriptives Études Analytiques (‘explicatives’ / ‘explanatory’) • Enquêtes d’observation - Enquêtes transversales (‘Cross-sectional studies’) Les différents types d’études - Enquêtes transversales (‘Cross-sectional studies’) - Enquêtes cohortes ( exposés/non exposés) (‘Cohort studies’) - Enquêtes cas/témoins (‘Case-control studies’) - Enquêtes hybrides • Expérimentation - Essais de laboratoire - Essais randomisés 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 2 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Études Descriptives L’ objectif n’est pas la recherche de Facteurs de Risque mais la description de cas (monographies (‘case reports’), de séries de cas (‘case series’)) et surtout l’estimation de la fréquence et de la répartition d’évènements pathologiques par l’intermédiaire d’enquêtes. Les différents types d’études 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 3 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Objectif Etude de l’association entre des variables décrivant la conduite d’animaux ou de groupes d’animaux et une pathologie M. Epidémiologie Etiologique Recherche de Facteurs de Risque de la maladie M. Les études analytiques Recherche de Facteurs de Risque de la maladie M. Recherche de liens causaux… Possible dans le cadre de l’expérimentation (Essais randomisés) Dans le cadre observationnel, Accumulation de résultats cohérents présomption de causalité… 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 4 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes • Etat d’une population à un instant donné (« Flash instantané ») • Mesures de Prévalence • Représentativité de l’échantillon par rapport à la population-cible (si constitution de l’échantillon par tirage au sort …) Les enquêtes transversales (si constitution de l’échantillon par tirage au sort …) On ne contrôle a priori que la taille globale de l’échantillon. - Manque de puissance statistique (à taille globale d’échantillon fixée) - Difficulté de séparer les facteurs associés à la persistance de la maladie et ceux associés à l’apparition de celle-ci (nouveaux cas, mieux décrits par les incidences…) - Raisonnement causal difficile à cause de la non connaissance de l’ordre dans lequel apparaissent les périodes d’exposition et la survenue de la maladie. 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 5 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes • Enquêtes prospectives principalement • Mesures de taux d’incidence ‘Rate-Based Analysis’ (populations ouvertes) ou mesures de risque ‘Risk-Based Analysis’ (populations fermées) • S’il existe un facteur de risque privilégié, contrôle a priori de la répartition de Les enquêtes cohorte • S’il existe un facteur de risque privilégié, contrôle a priori de la répartition de l’exposition à ce facteur (p% Exposés / 1-p% Non Exposés). • Comparaison des taux d’incidence ou des mesures de risque dans les populations ‘Exposés’ et ‘Non exposés’. 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 6 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes • Représentativité des échantillons conditionnellement à l’exposition ‘E / NE’ (toujours sous l’hypothèse de constitution par tirage au sort des groupes exposés et non exposés…) Les estimations de l’occurrence de maladie conditionnelles aux niveaux des facteurs de risque sont non biaisées. Les estimations globales (non Les enquêtes cohorte facteurs de risque sont non biaisées. Les estimations globales (non conditionnelles) de l’occurrence de maladie et de la fréquence d’exposition sont biaisées. Sans conséquence par rapport aux objectifs de l’étude. • Contrôle des biais de confusion: - A priori : Restriction de la population-cible (race, sexe, âge…) - A priori : Stratification, appariement sur facteurs de confusion - A posteriori : Ajustements dans modèles statistiques 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 7 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes + Le contrôle de la répartition des ‘Exposés / Non Exposés’ permet d’avoir des dispositifs plus puissants (cas optimal 50% E / 50% NE). - Dispositif plus coûteux et durée de l’étude plus longue (étude cohorte prospective) Les enquêtes cohorte 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 8 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Etude sur les blessures musculosquelettiques des pur-sangs lors des courses (Cohen et al., 1999). Population Chevaux ayant participés à des courses dans 4 hippodromes du Kentucky entre le 1/01/1996 et le 25/10/1997. Un exemple d’enquêtes cohorte rétrospective 1/01/1996 et le 25/10/1997. Avant chaque course Examen de chaque cheval par une commission formée de vétérinaires et établissement d’un score indicatif d’un accroissement du risque de blessure. 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 9 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Traitement des données Dichotomisation du score en deux classes : risque élevé (O/N) Constitution d’un groupe formé par tous les chevaux ayant eu un risque élevé pendant la période étudiée (groupe ‘Exposé’) et constitution par tirage au sort d’un second groupe d’animaux non à risque (groupe ‘Non Exposé’). Un exemple d’enquêtes cohorte rétrospective groupe d’animaux non à risque (groupe ‘Non Exposé’). Remarque : le statut ‘Exposé / Non Exposé’ peut changer pour un cheval d’une course à l’autre (exposition non permanente) mais les animaux sont suivis pendant toute la durée de l’étude (pas de perdus de vue). La population est fermée. Analyse sur le risque de blessure (‘Risk-Based Analysis’) 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 10 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes • Enquêtes rétrospectives principalement • Contrôle a priori de la répartition de la maladie : (1 : n) (cas : témoins) Le plus souvent (1 : 1) • Comparaison des proportions d’exposés à des présupposés facteurs de risque Les enquêtes cas - témoins • Comparaison des proportions d’exposés à des présupposés facteurs de risque entre les groupes cas et témoins • Représentativité des échantillons chez les cas et les témoins (sous l’hypothèse de constitution par tirage au sort des groupes cas et témoins…) Estimations de l’occurrence de maladie impossible 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 11 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes • Contrôle des biais de confusion : mêmes méthodes que pour les enquêtes cohortes. Nécessité de méthodes d’analyses particulières dans le cas d’appariements (modèles conditionnels) Les enquêtes cas - témoins 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 12 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Avantages / Inconvénients + Particulièrement adaptée à l’étude de maladies rares pour lesquelles le délai d’exposition est long + Prise en compte de plusieurs facteurs de risque + En population générale elles reflètent les caractéristiques des expositions en moyenne (intensité et fréquence), bonne connaissance de la part des différents facteurs dans l’étiologie de la maladie étudiée. Les enquêtes cas - témoins l’étiologie de la maladie étudiée. + Enquêtes généralement moins coûteuses et moins longues (études rétrospectives) - Risques de biais plus importants que dans les enquêtes cohorte - Définition des témoins souvent difficile témoins = animaux exempts de maladie à la fin de la période à risque (nécessité que la période à risque soit terminée avant la phase de sélection des individus) Refus de participer problème de biais de sélection… 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 13 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Etudes Cas-témoins « Grands nombres » ’ : Problèmes d’acidification fromages fermiers’ … / … Exemple d’une enquête cas – témoins prospective 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 14 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Remarque sur la notion de ‘maladie’ Elle est « sûre » et irréversible (pendant la durée de l’étude). Une fois qu’un individu (animal, lots d’animaux, troupeaux) est caractérisé somme ‘malade’ il l’est définitivement. C’est un statut définitif contrairement au statut d’exposition qui peut être variable L’utilisation des enquêtes cas – témoins dans des domaines non strictement épidémiologiques C’est un statut définitif contrairement au statut d’exposition qui peut être variable pendant la période d’étude. On n’est pas toujours dans ce cadre pour certaines études menées à l’Institut. Par exemple les élevages producteurs de fromages fermiers qui ont des problèmes de d’acidification de leur fromage sont ‘cas’ vis-à-vis de ce problème. Mais ce statut peut changer l’année suivante… 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 15 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Etude des facteurs déterminant la qualité de réalisation d’un « process » de fabrication. L’événement étudié n’est pas strictement une pathologie. Cet événement peut ne pas être pérenne… L’utilisation des enquêtes cas – témoins dans des domaines non strictement épidémiologiques Cet événement peut ne pas être pérenne… Exemple des accidents de fabrication Conséquence : difficulté à définir correctement ce que l’on appelle un « cas » et un « témoin »… 28-30/09/2011 Service Biométrie (CL) 16 Protocole n°001117004 Séminaire d’Epidémiologie Animale Les différents types d’enquêtes Les études « Hybrides » (cf. VER [Ch. 10]) • Les dispositifs « cas – cohortes » (‘case – cohort ‘ design). • Les dispositifs « cas – crossover » (‘case – crossover’ design) • Les dispositifs ‘case – only study design’) Compléments Les essais randomisés , ‘controlled trials’, terme synonyme ‘clinical trial’… Etude du rôle de facteurs de risque considérés comme des « facteurs d’interventions » Réalisation in situ sans modification du milieu (si possible…) Comparaison de groupes d’animaux (d’élevages…) sur des conduites (programmes de santé animale) avec constitution des groupes par tirage au sort. Eligibilité des uploads/Science et Technologie/ pdf-1-4-les-differents-types-d-enquetes 1 .pdf