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Devoir de méthodologie scientifique Infos sur l’article Titre : Impact et effic

Devoir de méthodologie scientifique Infos sur l’article Titre : Impact et efficacité du vaccin à ARNm BNT162b2 contre les infections par le SRAS-CoV-2 et les cas, hospitalisations et décès liés à la COVID-19 à la suite d’une campagne de vaccination nationale en Israël Historique de publication Date de publication : 05 mai 2021 Identification DoI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)00947-8 Copyright © 2021 Elsevier Ltd. Tous droits réservés. ScienceDirect Accéder à cet article sur ScienceDirect Introduction D’après plusieurs études , on montre que la transmission et l’infection du covid19 diminue de manière significative grâce a la vaccination . Une étude menée sur Israël et publiée dans la revue THE LANCET menée sur les quatre premiers de la campagne de vaccination explique que l’importance et l’efficacité du vaccin contre l’infection insinue que le vaccin réduit la transmission. Nous avons choisi cet article parce que les données proviennent ministère de la santé israélien et cet article a été publié sur THE LANCET qui est une prestigieuse revue scientifique médicale britannique et un des plus respecté au monde . Analyse de l’article Dans le cadre de cet article , la grande question du domaine de recherche est la suivante : la transmission et l’infection du covid 19 diminue t’elle grâce à la vaccination ? Apres analyse du document on voit très bien que la méthodologie apparait . dans ce cas présent nous avons une structure standard (participant , collecte de données , analyses des données ). - Les participants : 6,5 millions de population israélienne âgées de 16 ans et plus - Collecte des données : les données de surveillance nationale fourni par le ministère de la santé israélien - Analyses des données : aux vues des résultats obtenues et les graphes établie on voit bien que les données collectées ont été analysés. Au travers les graphes et les pourcentages assez claire et très facile à lire nous pouvons dire que le model statistique est très bien représenté . Cet article a une structure bien établit et assez visible . il comporte 15 parties ce qui rend cet article assez facile à lire et à comprendre Résumé Ici les auteurs nous donnent le contexte dans lequel a été réalisé cette étude «Suite à l’autorisation d’utilisation d’urgence du vaccin à ARNm BNT162b2 (dénomination commune internationale tozinameran) de Pfizer-BioNTech en Israël, le ministère de la Santé (MoH) a lancé une campagne pour vacciner les 6,5 millions de résidents d’Israël âgés de 16 ans et plus. Nous avons estimé l’efficacité réelle de deux doses de BNT162b2 par rapport à une gamme de résultats du SRAS-CoV-2 et pour évaluer l’impact national sur la santé publique après l’introduction généralisée du vaccin. » 1- Introduction Ici ils nous parlent de manière générale du bilan de décès du covid dans le monde et plus précisément en Israël puis le contexte de cette étude et comment elle va être réaliser 2- Méthode Ici les auteurs nous décrivent clairement la manière dont les études ont été réalisées. Dans cette étude observationnelle, ils ont analysé les données de surveillance nationales du 24 janvier au 3 avril 2021 afin d’évaluer l’efficacité du vaccin BNT162b2 contre divers critères de jugement du SRAS-CoV-2. La population étudiée était composée de résidents d’Israël (c’est-à-dire la population du recensement) âgés de 16 ans et plus. Le début de la période d’étude correspondait à 14 jours après que les premiers individus aient reçu leur deuxième dose de BNT162b2. La surveillance de la COVID-19 et l’adoption de vaccins font partie de la réponse nationale à la pandémie et sont collectées en vertu de l’ordonnance sur la santé publique numéro 40. Seules des données agrégées, sans identificateurs personnels, ont été utilisées dans cette analyse. Le ministère de la Santé surveille les infections par le SRAS-CoV-2 confirmées en laboratoire, avec la déclaration quotidienne obligatoire des résultats de la PCR par tous les laboratoires de diagnostic. Une enquête épidémiologique, y compris une entrevue sur les symptômes de la COVID- 19, est effectuée pour chaque infection par le SRAS-CoV-2, habituellement dans les 2 jours suivant le diagnostic. Le ministère de la Santé surveille également les hospitalisations associées à la COVID-19. Des mises à jour quotidiennes sont reçues de tous les hôpitaux et reliées à la base de données nationale à l’aide des numéros d’identification des patients. Les hospitalisations sont classées comme sévères (si un patient a une fréquence respiratoire au repos de >30 respirations par minute, une saturation en oxygène de l’air ambiant de <94% ou un ratio de PaO2 à FiO2 de <300) ou critique (en cas de ventilation mécanique, de choc ou d’insuffisance cardiaque, hépatique ou rénale). Conformément aux directives nationales, les prestataires de soins de santé ont attribué à la COVID-19 toutes les hospitalisations et décès chez les personnes atteintes d’une infection par le SARS-CoV-2 confirmée en laboratoire. Analyse statistique des données : Les individus ont été définis comme non vaccinés s’ils n’avaient reçu aucune dose de BNT162b2, et comme complètement vaccinés si au moins 7 jours s’étaient écoulés depuis la réception de la deuxième dose de BNT162b2. Les taux d’incidence ont été calculés pour les personnes non vaccinées et complètement vaccinées âgées de 16 ans et plus pour chaque critère de jugement du SRAS-CoV-2 après avoir exclu les personnes ayant déjà été infectées par le SRAS-CoV-2 confirmées en laboratoire. Les données ont été stratifiées par groupe d’âge (16-24, 25- 34, 35-44, 45-54, 55-64, 65-74, 75-84 et ≥85 ans, selon les données du recensement de 2020), sexe et semaine civile. Dans l’analyse primaire, les cas ont été classés comme vaccinés si la date de confirmation de l’infection en laboratoire est survenue au moins 7 jours après la deuxième dose de BNT162b2. Les cas ont été exclus de l’analyse s’ils n’avaient reçu qu’une seule dose ou s’ils avaient reçu deux doses de BNT162b2 et moins de 7 jours s’étaient écoulés depuis la deuxième dose. Les jours-personnes pour le groupe entièrement vacciné ont été déterminés chaque jour en multipliant la proportion de personnes qui ont été complètement vaccinées avec deux doses de BNT162b2 par les estimations du recensement pour chaque tranche d’âge. Les jours-personnes pour le groupe non vacciné ont été déterminés chaque jour en soustrayant le nombre de jours-personnes cotisés par ceux qui ont été vaccinés de la population totale du recensement pour chaque tranche d’âge; ce processus a été répété, additionné et agrégé pour chaque jour de la période d’étude. Les personnes ayant déjà été infectées par le SRAS-CoV- 2 ont été exclues des estimations par jour-personne. En utilisant STATA (version 15), un modèle de régression binomiale négative (commande nbreg), qui est mieux adapté à la sur-dispersion de la variance que la méthode traditionnelle de régression de Poisson,20 a été utilisé pour calculer les ratios de taux d’incidence (TRI) avec des IC à 95 % pour chaque critère de jugement ajusté en fonction du groupe d’âge, du sexe et de la semaine civile. La commande d’exposition a été utilisée pour tenir compte de la variation des jours-patients d’une strate à l’autre.21 Les estimations de l’efficacité vaccinale ont été calculées comme (1 – TRI) × 100. Dans les analyses de sensibilité, les estimations de l’efficacité vaccinale ont également été calculées avec la même méthode pour les personnes qui avaient reçu deux doses de BNT162b2 et pour lesquelles au moins 14 jours s’étaient écoulés après la deuxième dose, ainsi que pour celles qui avaient reçu une dose et pour lesquelles 14 à 21 jours s’étaient écoulés après la première dose. 3- Résultat Du 24 janvier au 3 avril 2021 (la période d’étude), il y a eu 232 268 infections par le SRAS-CoV-2. 213 919 (92,1 %) des personnes infectées ont été interrogées et 186 109 (87,1 %) ont répondu aux questions sur la présence ou l’absence de symptômes. Les personnes âgées de 16 ans ou plus représentaient 154 648 (66,6%) infections, dont 31 548 (20,4%) dans le secteur arabe, 24 280 (15,7%) dans le secteur ultra-orthodoxe et 98 220 (63,9%) dans le secteur juif général (non ultra-orthodoxe). Au cours de la période d’étude, 7694 hospitalisations liées à la COVID-19, 4481 hospitalisations graves ou critiques liées à la COVID-19 et 1113 décès liés à la COVID-19 sont survenus chez des personnes âgées de 16 ans ou plus. 8472 (60%) des tests PCR Leumit ont utilisé TaqPath au cours de la période d’étude, dont 8006 avaient un SGTF, ce qui donne une prévalence estimée à 94,5% pour la variante B.1.1.7. Au 3 avril 2021, BNT162b2 était le seul vaccin contre la COVID-19 disponible en Israël, et plus de 10,0 millions de doses ont été administrées à plus de 5,2 millions de personnes. Dans l’ensemble, 4 714 932 (72,1 %) des 6 538 911 personnes âgées de 16 ans ou plus et 1 015 620 (90,0 %) de 1 127 965 personnes âgées de 65 ans ou plus ont été complètement vaccinés avec deux doses (tableau 1). Par secteur, parmi les personnes âgées de 16 ans et plus, 669 542 (54,6 %) de 1 226 788 dans la population arabe, 228 479 (42,8 %) de 534 146 dans la population ultra-orthodoxe uploads/Sante/ devoir-de-methodologie-scientifique.pdf