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ÉCOLE NATIONALE VÉTÉRINAIRE D’ALFORT Année 2016 ANALYSE DES COÛTS SANITAIRES EN

ÉCOLE NATIONALE VÉTÉRINAIRE D’ALFORT Année 2016 ANALYSE DES COÛTS SANITAIRES EN ÉLEVAGE BOVIN LAITIER : ÉTUDE DANS LE DÉPARTEMENT DES VOSGES THÈSE Pour le DOCTORAT VÉTÉRINAIRE Présentée et soutenue publiquement devant LA FACULTÉ DE MÉDECINE DE CRÉTEIL Le 13 octobre 2016 par Pauline VILLARD Née le 22 Avril 1991 à Oullins (Rhône) JURY Président : Pr. Professeur à la Faculté de Médecine de CRÉTEIL Membres Directeur : Mr Yves MILLEMANN Professeur à l’École Nationale Vétérinaire d’Alfort Assesseur : Mme Barbara DUFOUR Professeur à l’École Nationale Vétérinaire d’Alfort Invité : Mr Vincent POTAUFEUX Directeur du GDS des Vosges (88) REMY ! ! ! ! Liste des membres du corps enseignant Directeur : M. le Professeur Gogny Marc Directeurs honoraires : MM. les Professeurs : Cotard Jean-Pierre, Mialot Jean-Paul, Moraillon Robert, Parodi André-Laurent, Pilet Charles, Toma Bernard. Professeurs émérites : Mme et MM. : Bénet Jean-Jacques, Chermette René, Combrisson Hélène, Courreau Jean-François, Deputte Bertrand, Niebauer Gert, Paragon Bernard, Pouchelon Jean-Louis. Département d’élevage et de pathologie des Équidés et des Carnivores (DEPEC) Chef du département : Pr Grandjean Dominique - Adjoint : Pr Blot Stéphane Unité pédagogique de cardiologie - Pr Chetboul Valérie* - Dr Gkouni Vassiliki, Praticien hospitalier - Dr Séchi-Tréhiou Emilie, Praticien hospitalier Unité pédagogique de clinique équine - Pr Audigé Fabrice - Dr Bertoni Lélia, Maître de conférences - Dr Bourzac Céline, Maître de conférences contractuel - Dr Coudry Virginie, Praticien hospitalier - Pr Denoix Jean-Marie - Dr Giraudet Aude, Praticien hospitalier * - Dr Jacquet Sandrine, Praticien hospitalier - Dr Mespoulhès-Rivière Céline, Praticien hospitalier Unité pédagogique de médecine interne - Dr Benchekroun Ghita, Maître de conférences - Pr Blot Stéphane* - Dr Campos Miguel, Maître de conférences associé - Dr Freiche-Legros Valérie, Praticien hospitalier - Dr Maurey-Guénec Christelle, Maître de conférences Discipline : imagerie médicale - Dr Stambouli Fouzia, Praticien hospitalier Unité pédagogique de médecine de l’élevage et du sport - Dr Cléro Delphine, Maître de conférences - Dr Fontbonne Alain, Maître de conférences - Pr Grandjean Dominique* - Dr Maenhoudt Cindy, Praticien hospitalier - Dr Nudelmann Nicolas, Maître de conférences Unité pédagogique de pathologie chirurgicale - Pr Fayolle Pascal - Dr Mailhac Jean-Marie, Maître de conférences - Dr Manassero Mathieu, Maître de conférences - Pr Moissonnier Pierre - Pr Viateau-Duval Véronique* - Dr Zilberstein Luca, Maître de conférences Discipline : ophtalmologie - Dr Chahory Sabine, Maître de conférences Discipline : Urgences - soins intensifs - Dr Steblaj Barbara, Praticien Hospitalier Discipline : nouveaux animaux de compagnie - Dr Pignon Charly, Praticien hospitalier Département des Productions Animales et de la Santé Publique (DPASP) Chef du département : Pr Millemann Yves - Adjoint : Pr Dufour Barbara Unité pédagogique d’hygiène, qualité et sécurité des aliments - Pr Augustin Jean-Christophe - Dr Bolnot François, Maître de conférences * - Pr Carlier Vincent Unité pédagogique de maladies règlementées, zoonoses et épidémiologie - Pr Dufour Barbara* - Pr Haddad/Hoang-Xuan Nadia - Dr Praud Anne, Maître de conférences - Dr Rivière Julie, Maître de conférences contractuel Unité pédagogique de pathologie des animaux de production - Pr Adjou Karim* - Dr Belbis Guillaume, Maître de conférences - Pr Millemann Yves - Dr Ravary-Plumioën Bérangère, Maître de conférences - Dr Troistsky Karine, Praticien hospitalier Unité pédagogique de reproduction animale - Dr Constant Fabienne, Maître de conférences* - Dr Desbois Christophe, Maître de conférences (rattaché au DEPEC) - Dr El Bay Sarah, Praticien hospitalier - Dr Mauffré Vincent, Assistant d’enseignement et de recherche contractuel - Dr Ribeiro Dos Santos Natalia, Maître de conférences contractuel Unité pédagogique de zootechnie, économie rurale - Dr Arné Pascal, Maître de conférences - Pr Bossé Philippe* - Dr De Paula Reis Alline, Maître de conférences - Pr Grimard-Ballif Bénédicte - Dr Leroy-Barassin Isabelle, Maître de conférences - Pr Ponter Andrew - Dr Wolgust Valérie, Praticien hospitalier Département des sciences biologiques et pharmaceutiques (DSBP) Chef du département : Pr Chateau Henry - Adjoint : Dr Pilot-Storck Fanny * responsable d’unité pédagogique Unité pédagogique d’anatomie des animaux domestiques - Pr Chateau Henry - Pr Crevier-Denoix Nathalie - Pr Degueurce Christophe - Pr Robert Céline* Unité pédagogique de bactériologie, immunologie, virologie - Pr Boulouis Henri-Jean* - Dr Le Poder Sophie, Maître de conférences - Dr Le Roux Delphine, Maître de conférences - Pr Quintin-Colonna Françoise Unité pédagogique de biochimie - Pr Bellier Sylvain* - Dr Lagrange Isabelle, Praticien hospitalier - Dr Michaux Jean-Michel, Maître de conférences Discipline : éducation physique et sportive - M. Philips Pascal, Professeur certifié Unité pédagogique d’histologie, anatomie pathologique - Dr Cordonnier-Lefort Nathalie, Maître de conférences - Pr Fontaine Jean-Jacques* - Dr Laloy Eve, Maître de conférences - Dr Reyes-Gomez Edouard, Maître de conférences Unité pédagogique de management, communication, outils scientifiques - Mme Conan Muriel, Professeur certifié (Anglais) - Dr Desquilbet Loïc, Maître de conférences (Biostatistique, Epidémiologie) * - Dr Fournel Christelle, Maître de conférences contractuelle (Gestion et management) Unité de parasitologie, maladies parasitaires, dermatologie - Dr Blaga Radu, Maître de conférences (rattaché au DPASP) - Dr Cochet-Faivre Noëlle, Praticien hospitalier (rattachée au DEPEC) - Dr Darmon Céline, Maître de conférences contractuel (rattachée au DEPEC) - Pr Guillot Jacques* - Dr Polack Bruno, Maître de conférences - Dr Risco-Castillo Véronica, Maître de conférences Unité pédagogique de pharmacie et toxicologie - Pr Enriquez Brigitte, - Dr Perrot Sébastien, Maître de conférences * - Pr Tissier Renaud Unité pédagogique de physiologie, éthologie, génétique - Dr Chevallier Lucie, Maître de conférences contractuel (Génétique) - Dr Crépeaux Guillemette, Maître de conférences (Physiologie, Pharmacologie) - Dr Gilbert Caroline, Maître de conférences (Ethologie) - Pr Panthier Jean-Jacques, (Génétique) - Dr Pilot-Storck Fanny, Maître de conférences (Physiologie, Pharmacologie) - Pr Tiret Laurent, (Physiologie, Pharmacologie) * ! ! ! ! REMERCIEMENTS Au professeur de la faculté de Médecine de Créteil, Qui nous fait l’honneur de présider le jury de cette thèse, Hommages respectueux. À Monsieur Yves Millemann, Professeur à l’École Nationale Vétérinaire d’Alfort, Qui m’a fait l’honneur de diriger cette thèse, pour vos conseils avisés et votre engagement, Sincères remerciements. À Madame Barbara Dufour, Professeur à l’École Nationale Vétérinaire d’Alfort, Pour m’avoir fait l’honneur d’accepter l’assessorat de ma thèse, pour votre disponibilité et votre gentillesse, Sincères remerciements. À Monsieur Vincent Potaufeux, Directeur du GDS des Vosges, Pour m’avoir fait confiance en me proposant cette étude, pour vos nombreux conseils et votre implication, Sincères remerciements. Aux vétérinaires ayant consenti et pris part à l’étude. Aux éleveurs ayant accepté et pris le temps de participer à l’enquête. ! ! ! ! À ma mère, pour sa confiance, son soutien et ses encouragements à chaque étape. À mes grands-parents maternels, pour leur accompagnement tout au long de ma vie. Aux autres membres de ma famille, pour leur présence. À Sam, récemment rencontré mais déjà si important, pour ces derniers mois avec toi. À Anne-Sophie, pour ces trois années de colocation mémorables, ces sorties chiens inoubliables, ces longues gardes. À Cindy, pour tous les bons moments passés avec toi, les soirées, les promenades aux bois de Vincennes. A notre stage au Pays de Galle. À Sixtine, pour ta bonne humeur et tes snapchats! À Océane, pour être restée depuis la terminale, à nos instants partagés dans Lyon puis à Paris. À mes deux poulottes, Hélène et Camille, pour votre bonne humeur tout au long de l’accueil et encore par la suite. Au reste du groupe 19, pour tous les bons moments en TD, en TP, en clinique. À tous ceux qui ont accompagné ces cinq années Alforiennes, À ma promotion, la promotion 2016, les Gnolasses, pour être ce qu’elle est. Aux copains de classe préparatoire, Adrien, Alex, Coline, Valentin, Yoann, pour avoir rendu vivable ces deux folles années. ! ! ! ! 1! TABLE DES MATIÈRES Table&des&annexes&:&.........................................................................................................................& 4! Tables&des&figures&:& ..........................................................................................................................& 5! Table&des&tableaux&..........................................................................................................................& 9! Liste&des&Abréviations& .................................................................................................................&11! Introduction&...................................................................................................................................&13! Première&partie&:&Etude&bibliographique&.............................................................................&15! 1.&Présentation&du&département&des&Vosges&..................................................................................& 15! 1.1!Le!département! ................................................................................................................................................!15! 1.2.!Les!élevages!......................................................................................................................................................!16! 1.3.!Les!prophylaxies! .............................................................................................................................................!16! 2.&Définition&des&charges&et&coûts&en&élevage&laitier&...................................................................& 18! 2.1.!Présentation!des!différentes!charges!....................................................................................................!18! 2.1.1.!Les!charges!courantes!............................................................................................................................................! 18! 2.1.2.!Les!amortissements! .................................................................................................................................................! 18! 2.1.3.!Les!charges!supplétives.!........................................................................................................................................! 18! 2.2.!Répartition!comptable!des!différents!postes!de!charges!courantes! ........................................!19! 2.2.1.!Approvisionnement!des!animaux!–!alimentation! .......................................................................................! 19! 2.2.2.!Approvisionnement!des!surfaces!......................................................................................................................! 19! 2.2.3.!Frais!d’élevage!...........................................................................................................................................................! 19! 2.2.4.!Mécanisation! ...............................................................................................................................................................! 20! 2.2.5.!Bâtiments!.....................................................................................................................................................................! 20! 2.2.6.!Frais!divers!de!gestion! ............................................................................................................................................! 20! 2.2.7.!Foncier!et!capital! .......................................................................................................................................................! 20! 2.2.8.!Rémunérations!et!charges!sur!salaires!...........................................................................................................! 21! 2.2.9.!Part!des!frais!vétérinaires!dans!les!différentes!charges!..........................................................................! 22! 3.&Les&charges&sanitaires&dues&aux&maladies&..................................................................................& 23! 3.1.!Préventif! .............................................................................................................................................................!27! 3.1.1.!Les!vaccins!...................................................................................................................................................................! 28! 3.1.2.!Les!prophylaxies!.......................................................................................................................................................! 28! 3.1.3.!Le!déparasitage! ..........................................................................................................................................................! 28! 3.1.4.!Les!traitements!mammaires!au!tarissement!................................................................................................! 29! 3.2.!Curatif! ..................................................................................................................................................................!30! 3.2.1.!Rappel!sur!les!principales!maladies!présentes!en!élevage!laitier!.......................................................! 30! 3.2.1.1.!Chez!les!veaux!...................................................................................................................................................! 30! 3.2.1.2.!Chez!les!génisses!..............................................................................................................................................! 33! 3.2.1.2.1.!Les!affections!parasitaires!..................................................................................................................! 33! 3.2.1.2.2.!La!reproduction!chez!les!génisses! ...................................................................................................! 34! 3.2.1.3.!Chez!les!adultes!................................................................................................................................................! 34! 3.2.2.!Coût!des!principales!maladies! .............................................................................................................................! 47! 3.2.2.1.!Chez!les!veaux!...................................................................................................................................................! 47! 3.2.2.1.1.!Les!diarrhées!néonatales!....................................................................................................................! 47! 3.2.2.1.2.!Les!affections!des!voies!respiratoires! ............................................................................................! 48! 3.2.2.1.3.!Les!affections!ombilicales!...................................................................................................................! 48! 3.2.2.2.!Chez!les!génisses!..............................................................................................................................................! 49! 3.2.2.2.1.!Les!affections!parasitaires!..................................................................................................................! 49! ! ! 2! 3.2.2.2.2.!La!reproduction!chez!les!génisses! ...................................................................................................! 50! 3.2.2.3.!Chez!les!adultes!................................................................................................................................................! 50! 3.2.2.3.1.!Les!mammites!..........................................................................................................................................! 52! 3.2.2.3.2.!Les!troubles!de!la!reproduction!.......................................................................................................! 55! 3.2.2.3.2.1.!La!mortalité!embryonnaire!.......................................................................................................! 56! 3.2.2.3.2.2.!Les!avortement!...............................................................................................................................! 57! 3.2.2.3.2.3.!Les!dystocies! ....................................................................................................................................! 58! 3.2.2.3.2.4.!Les!fièvres!vitulaires!....................................................................................................................! 58! 3.2.2.3.2.5.!Les!rétentions!placentaires!.......................................................................................................! 58! 3.2.2.3.2.6.!Les!infections!utérines!................................................................................................................! 58! 3.2.2.3.2.6.1.!Les!métrites!............................................................................................................................! 59! 3.2.2.3.2.6.2.!Les!endométrites!..................................................................................................................! 60! 3.2.2.3.2.7.!Les!anœstrus!...................................................................................................................................! 60! 3.2.2.3.2.7.1.!L’anœstrus!vrai! ......................................................................................................................! 60! 3.2.2.3.2.7.2.!Le!subœstrus!..........................................................................................................................! 61! 3.2.2.3.3.!Les!boiteries! ..............................................................................................................................................! 61! 3.2.2.3.4.!Les!troubles!métaboliques!.................................................................................................................! 63! 3.2.2.3.4.1.!La!cétose!subclinique! ...................................................................................................................! 64! 3.2.2.3.4.2.!L’acidose!subclinique! ...................................................................................................................! 64! 3.2.2.3.4.3.!Les!déplacements!de!caillette!..................................................................................................! 64! 4.&Charges&sanitaires&pour&l’entretien&et&l’hygiène&des&installations&.....................................& 65! 4.1.!Hygiène!de!la!traite!.......................................................................................................................................!65! 4.2.!Nettoyants!et!désinfectants!machines!à!traire! ..................................................................................!65! 4.3.!Nettoyants!et!désinfectants!bâtiments!.................................................................................................!65! Deuxième&partie&:&enquête&sur&les&pratiques&sanitaires&en&élevage&laitier&..............&69! 1.&Matériel&et&méthode&...........................................................................................................................& 69! 1.1.!Choix!des!élevages!.........................................................................................................................................!69! 1.2.!Réalisation!de!l’enquête!..............................................................................................................................!71! 1.2.1.!Recrutement!des!élevages!....................................................................................................................................! 71! 1.2.2.!Présentation!des!élevages! .....................................................................................................................................! 73! 1.3.!Tri!des!factures!vétérinaires,!du!centre!d’insémination!artificielle!et!autres!fournisseurs! de!produits!sanitaires!...........................................................................................................................................!74! 1.4.!Réalisation!du!questionnaire!aux!éleveurs! .........................................................................................!75! 1.5.!Questionnaire!aux!vétérinaires! ................................................................................................................!76! 1.6.!Comparaison!statistique!des!dépenses!et!des!performances!.....................................................!76! 1.7.!Comparaison!statistique!des!recommandations!vétérinaires!et!des!performances.!.......!76! 2.&Résultats& .................................................................................................................................................& 77! 2.1.!Analyse!des!dépenses!sanitaires!des!élevages!..................................................................................!77! 2.1.1.!Dépenses!en!préventif!............................................................................................................................................! 77! 2.1.1.1.!Les!vaccins!..........................................................................................................................................................! 77! 2.1.1.2.!Le!déparasitage! .................................................................................................................................................! 80! 2.1.1.3.!Les!traitements!mammaires!au!tarissement!.......................................................................................! 81! 2.1.1.4.!Suivi!de!reproduction!et!échographie!ponctuelle!.............................................................................! 83! 2.1.1.5.!Parage!et!pédiluve!...........................................................................................................................................! 84! 2.1.2.!Dépenses!en!curatif! ..................................................................................................................................................! 88! 2.1.2.1.!Visites! ....................................................................................................................................................................! 88! 2.1.2.2.!Chirurgie! ..............................................................................................................................................................! 88! 2.1.2.3.!Prélèvements!et!analyses! .............................................................................................................................! 89! 2.1.2.4.!Les!traitements!intramammaires!en!lactation! ....................................................................................! 89! ! ! 3! 2.1.2.5.!Antibiotiques!.....................................................................................................................................................! 90! 2.1.2.6.!Anti]inflammatoires!.......................................................................................................................................! 91! 2.1.2.7.!Hormones!de!la!reproduction!....................................................................................................................! 92! 2.1.2.8.!Traitements!pour!le!tube!digestif!.............................................................................................................! 93! 2.1.2.9.!Anesthésie/sédation!......................................................................................................................................! 94! 2.1.2.10.!Antiseptiques!..................................................................................................................................................! 95! 2.1.2.11.!Compléments!minéraux!et!vitamines!..................................................................................................! 95! 2.1.2.12.!Compléments!métaboliques! .....................................................................................................................! 96! 2.1.3.!Parts!relatives!du!préventif!et!du!curatif!dans!les!dépenses!..............................................................!100! 2.1.3.1.!Préventif!et!curatif!calculé!........................................................................................................................!100! 2.1.3.2.!Comparaison!entre!les!pourcentages!calculés!et!les!pourcentages!estimés!pour!le! préventif!et!le!curatif!..................................................................................................................................................!103! 2.1.4.!Dépenses!en!entretien!et!hygiène!..................................................................................................................!104! 2.1.4.1.!Hygiène!de!la!mamelle!...............................................................................................................................!104! 2.1.4.2.!Hygiène!de!la!salle!de!traite!.....................................................................................................................!105! 2.1.4.3.!Hygiène!du!bâtiment!...................................................................................................................................!106! 2.2.!Bilan!des!dépenses!dans!les!22!élevages!...........................................................................................! 108! 2.3.!Analyse!des!performances!techniques!des!élevages!....................................................................! 113! 2.3.1.!Analyse!des!données!OMAR!..............................................................................................................................!113! 2.3.2.!Analyse!des!bilans!de!reproduction!..............................................................................................................!114! 2.3.3.!Analyse!des!données!laiterie!............................................................................................................................!116! 2.3.4.!Analyse!des!données!du!contrôle!laitier! uploads/Sante/ 2178.pdf