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VETAGRO SUP CAMPUS VETERINAIRE DE LYON Année 2020 - Thèse n°019 ÉVALUATION DES

VETAGRO SUP CAMPUS VETERINAIRE DE LYON Année 2020 - Thèse n°019 ÉVALUATION DES ALTERNATIVES À LA GESTION MÉDICAMENTEUSE DU PARASITISME DIGESTIF CHEZ LES BOVINS : ESSAI D’UN BOLUS À BASE DE PLANTES, DE MINÉRAUX ET DE VITAMINES CHEZ DES GÉNISSES LAITIÈRES EN PREMIÈRE SAISON DE PÂTURAGE THESE Présentée à l’UNIVERSITE CLAUDE-BERNARD - LYON I (Médecine - Pharmacie) et soutenue publiquement le 11 septembre 2020 pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire par JOLIVET Line Née le 8 septembre 1994 à Roussillon (38) VETAGRO SUP CAMPUS VETERINAIRE DE LYON Année 2020 - Thèse n°019 ÉVALUATION DES ALTERNATIVES À LA GESTION MÉDICAMENTEUSE DU PARASITISME DIGESTIF CHEZ LES BOVINS : ESSAI D’UN BOLUS À BASE DE PLANTES, DE MINÉRAUX ET DE VITAMINES CHEZ DES GÉNISSES LAITIÈRES EN PREMIÈRE SAISON DE PÂTURAGE THESE Présentée à l’UNIVERSITE CLAUDE-BERNARD - LYON I (Médecine - Pharmacie) et soutenue publiquement le 11 septembre 2020 pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire par JOLIVET Line Née le 8 septembre 1994 à Roussillon (38) Attribution - Pas d'Utilisation Commerciale - Pas de Modification CC BY-NC-ND 3 ABITBOL Marie DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur ALVES-DE-OLIVEIRA Laurent DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences ARCANGIOLI Marie-Anne DEPT-ELEVAGE-SPV Professeur AYRAL Florence DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences BECKER Claire DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences BELLUCO Sara DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences BENAMOU-SMITH Agnès DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences BENOIT Etienne DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur BERNY Philippe DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur BONNET-GARIN Jeanne-Marie DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur BOULOCHER Caroline DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences BOURDOISEAU Gilles DEPT-ELEVAGE-SPV Professeur BOURGOIN Gilles DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences BRUYERE Pierre DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences BUFF Samuel DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences BURONFOSSE Thierry DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur CACHON Thibaut DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences CADORÉ Jean-Luc DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur CALLAIT-CARDINAL Marie-Pierre DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences CAROZZO Claude DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences CHABANNE Luc DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur CHALVET-MONFRAY Karine DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur DE BOYER DES ROCHES Alice DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences DELIGNETTE-MULLER Marie-Laure DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur DJELOUADJI Zorée DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences ESCRIOU Catherine DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences FRIKHA Mohamed-Ridha DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences GALIA Wessam DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences GILOT-FROMONT Emmanuelle DEPT-ELEVAGE-SPV Professeur GONTHIER Alain DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences GRANCHER Denis DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences GREZEL Delphine DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences HUGONNARD Marine DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences JANKOWIAK Bernard DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences JOSSON-SCHRAMME Anne DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences JUNOT Stéphane DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences KODJO Angeli DEPT-ELEVAGE-SPV Professeur KRAFFT Emilie DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences LAABERKI Maria-Halima DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences LAMBERT Véronique DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences LE GRAND Dominique DEPT-ELEVAGE-SPV Professeur LEBLOND Agnès DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur LEDOUX Dorothée DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences LEFEBVRE Sébastien DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences LEFRANC-POHL Anne-Cécile DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences LEGROS Vincent DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences LEPAGE Olivier DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur LOUZIER Vanessa DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur MARCHAL Thierry DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur MOISSONNIER Pierre DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur MOUNIER Luc DEPT-ELEVAGE-SPV Professeur PEPIN Michel DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur PIN Didier DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur PONCE Frédérique DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur PORTIER Karine DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur POUZOT-NEVORET Céline DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences PROUILLAC Caroline DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences REMY Denise DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur RENE MARTELLET Magalie DEPT-ELEVAGE-SPV Maître de conférences ROGER Thierry DEPT-BASIC-SCIENCES Professeur SABATIER Philippe DEPT-ELEVAGE-SPV Professeur SAWAYA Serge DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences SCHRAMME Michael DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur SERGENTET Delphine DEPT-ELEVAGE-SPV Professeur THIEBAULT Jean-Jacques DEPT-BASIC-SCIENCES Maître de conférences THOMAS-CANCIAN Aurélie DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences TORTEREAU Antonin DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences VIGUIER Eric DEPT-AC-LOISIR-SPORT Professeur VIRIEUX-WATRELOT Dorothée DEPT-AC-LOISIR-SPORT Maître de conférences ZENNER Lionel DEPT-ELEVAGE-SPV Professeur Liste des Enseignants du Campus Vétérinaire de Lyon (01-09-2019) 4 5 À Monsieur le Professeur Bruno SALLE, Professeur de l’Université Claude Bernard Lyon 1, Faculté de médecine de Lyon, Pour m’avoir fait l’honneur de présider ce jury de thèse, Sincères remerciements. À Monsieur le Docteur Gilles BOURGOIN, Docteur de VetAgro Sup, Campus vétérinaire de Lyon, Pour avoir encadré ce projet avec implication, Pour avoir été bienveillant, disponible et enthousiaste, Toute ma gratitude et mes sincères remerciements. À Madame la Docteure Claire BECKER, Docteure de VetAgro Sup, Campus vétérinaire de Lyon, Pour avoir accepté d’être membre de ce jury de thèse, Sincères remerciements. 6 7 Au laboratoire Nutral, et tout particulièrement au Docteur vétérinaire Yves VAN VAECK et à Loïc CHALONY, Pour votre aide, votre enthousiasme et votre disponibilité pour ce projet. Sincères remerciements. Aux éleveurs ayant participé à l’étude, Pour votre disponibilité et votre investissement dans ce projet, sincères remerciements. Tout particulièrement, merci à Manu, François et leurs familles, pour votre enthousiasme, et pour m’avoir donné l’envie de travailler avec les vaches il y a 5 ans déjà. À toute l’équipe du laboratoire Eurofins Cœur de France, Pour votre accueil chaleureux et votre travail. Sincères remerciements. Au Docteur vétérinaire Thibault LURIER, Pour ton soutien régulier et efficace tout au long de mes expériences de thèse, et tout particulièrement pour ton aide précieuse lors du traitement statistique des données. Je ne te remercierai jamais assez pour avoir passé des heures à réfléchir à nos modèles ! Au Docteur vétérinaire Germain RIVES, Pour m’avoir lancée sur ce projet, et pour votre aide afin de le mettre en place. Sincères remerciements. Au Docteur Caroline PROUILLAC, Pour votre relecture attentive. Sincères remerciements. À mes parents, Pour votre amour sincère. Je vous dois beaucoup, nos réussites sont en grande partie grâce à vous. Papa, pour ton investissement dans nos études, ton soutien, et tout ce que tu fais pour nous. Merci pour tes relectures de qualité et tes photos. Maman, pour ta finesse d’analyse, ta douceur, ton oreille attentive et tes propos rassurants. Ton accompagnement m’est indispensable. Je vous aime. À mes sœurs, À Lucie, mon modèle, ma presque sœur jumelle que je n’ai jamais réussi à rattraper. Tu m’as guidée depuis toute petite, et si j’en suis là aujourd’hui c’est aussi grâce à toi. À Cécile, la grande qui a tracé notre chemin. Merci d’être celle que tu es. À ma famille, et tout particulièrement à Annie et Laurent. À ma grand-mère. À ma lignée, Étienne, Morgane, Corentin et Charlotte, vous êtes des amis formidables. À mes copines de toujours, Solène, Déborah, Louise, Sandra, Aurélie et Marjorie. À mes amis de lycée, de prépa et de véto, Lise, Quentin, Édouard, Sarah, Doris, Adèle, Mioche, Béber, Baptiste et tous les autres. À Valentin, Pour ta gentillesse, ta douceur et ton enthousiasme. Merci de faire partie de ma vie et de la rendre si belle. À tous nos projets… 8 9 Table des matières Table des annexes ................................................................................................................. 13 Table des figures .................................................................................................................. 15 Table des tableaux ................................................................................................................ 19 Liste des abréviations ........................................................................................................... 21 Introduction .......................................................................................................................... 23 Premier chapitre : La gestion du parasitisme digestif des bovins : état des lieux et alternatives aux molécules chimiques ................................................................................... 25 I. État des lieux du parasitisme digestif chez les bovins ..................................................... 27 A. Les principaux parasites digestifs rencontrés chez les bovins ................................ 27 1) Les Nématodes..................................................................................................... 27 i) Définition et caractéristiques générales des strongles digestifs .............................. 29 ii) Cycle évolutif des strongles digestifs .................................................................... 30 iii) Caractéristiques morphologiques des œufs de strongles digestifs .......................... 32 iv) Informations générales sur les trichures ................................................................ 33 2) Les Trématodes .................................................................................................... 33 i) Définition, taxonomie et caractéristiques générales des Trématodes ...................... 33 ii) Cycle évolutif des trois principaux trématodes digestifs ........................................ 34 iii) Caractéristiques morphologiques des œufs ............................................................ 36 3) Les Cestodes......................................................................................................... 37 i) Définition, taxonomie et caractéristiques générales des Cestodes .......................... 37 ii) Cycle évolutif de Moniezia ................................................................................... 38 iii) Caractéristiques morphologiques des œufs ............................................................ 39 4) Les Protozoaires ................................................................................................... 40 i) Définition, taxonomie et caractéristiques générales des Protozoaires..................... 40 ii) Cycle évolutif des coccidies .................................................................................. 40 iii) Caractéristiques morphologiques des principaux Protozoaires digestifs des bovins ................................................................................................................... 42 5) Conclusion sur les parasites digestifs des bovins ................................................... 43 B. Les grandes méthodes de lutte les plus couramment utilisées ................................ 44 1) Les objectifs : protéger les bovins de la pression parasitaire .................................. 44 2) Les molécules allopathiques couramment utilisées ................................................ 44 i) Benzimidazoles et probenzimidazoles ................................................................... 44 ii) Imidazothiazoles et Tétrahydropyrimidines........................................................... 45 iii) Lactones macrocycliques ...................................................................................... 45 iv) Salicylanilides ...................................................................................................... 46 v) Sulfamides ............................................................................................................ 46 vi) Triazines ............................................................................................................... 47 vii) Conclusion sur les molécules allopathiques de la pharmacie antiparasitaire digestive des ruminants......................................................................................................... 47 10 C. L’apparition de chimiorésistances............................................................................. 47 1) La définition de la chimiorésistance ...................................................................... 47 2) Les mécanismes de résistance ............................................................................... 48 i) Benzimidazoles .................................................................................................... 48 ii) Lévamisole ........................................................................................................... 49 iii) Ivermectine........................................................................................................... 49 iv) Closantel .............................................................................................................. 49 3) Les techniques de mise en évidence des résistances .............................................. 50 i) Fecal Egg Count Reduction Test ........................................................................... 50 ii) Test d’inhibition d’éclosion des œufs .................................................................... 51 4) Les erreurs souvent rencontrées menant au développement de chimiorésistances .................................................................................................. 52 i) Facteurs en lien avec le parasite ............................................................................ 53 ii) Facteurs en lien avec l’antiparasitaire et son protocole d‘utilisation ...................... 54 iii) Facteurs en lien avec la conduite d‘élevage ........................................................... 55 D. La problématique environnementale face aux protocoles antiparasitaires .............. 55 1) Antiparasitaires et menace de la biodiversité coprophage pastorale ....................... 55 2) Menace d’autres espèces pastorales et critique sociétale........................................ 58 3) Changements climatiques et nécessité d’adaptation des protocoles antiparasitaires ...................................................................................................... 59 4) Conclusion sur la problématique environnementale face aux protocoles antiparasitaires ...................................................................................................... 59 II. Une ouverture vers de nouvelles alternatives.................................................................. 61 A. Les objectifs : développer l’immunité des bovins .................................................. 61 1) Mécanismes immunitaires lors de la primo-infestation .......................................... 61 2) Mécanismes immunitaires uploads/Science et Technologie/ phytotherapie-digestive-bovin.pdf