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2022 - 2023 1 Double cursus Ecole Santé-Sciences - Livret des enseignements et

2022 - 2023 1 Double cursus Ecole Santé-Sciences - Livret des enseignements et de stage 2 Table des matières 1/ Contacts (page 3) 2/ Présentation (page 4 à 5) Présentation du cursus, schéma des études 3/ Descriptif de la formation de première année et modules (page 6 à 10) Modules: mathématiques, physique, chimie, biologie 4/ Descriptif de la formation de deuxième année et modules (page 11 à 15) Modules: cœur et vaisseaux, neurosciences, immunologie, sciences et humanité 4/ Modalités de Contrôles de Connaissances et Compétences- M3C (page 16 à 18) Première année, deuxième année, validation UER, équivalences 4/ Stage de recherche de l’école Santé-Sciences Objectif, formats des stages, choix du laboratoire d’accueil , conventions de stage, évaluation et validation du stage (première année) , évaluation et validation du stage (deuxième année) 3 Contacts Coordination M-E. Lafon : marie-edith.lafon@u-bordeaux.fr I. Dupin : isabelle.dupin@u-bordeaux.fr T. Bienvenu : tcmbienvenu@gmail.com Comité pédagogique, enseignants - Médecine: C. James : chloe.james@u-bordeaux.fr - Pharmacie : P. Dufourcq : pascale.dufourcq@u-bordeaux.fr - Odontologie : R. Devillard raphaeldevillard@me.com Comité pédagogique, membres juniors - E. Martinez Contact pédagogique - C. Luijten : corinne.luijten@u-bordeaux.fr Contact administratif Service de gestion des cursus étudiants LMD Santé scolarite.lmd.sante@u-bordeaux.fr 4 Présentation (1) L’Ecole Santé Sciences est un nouveau double cursus sélectif ouvert aux étudiants en Médecine, Pharmacie et Odontologie. La formation initiale (socle) est dispensée en seconde et troisième années d’études de santé. Le master et le doctorat de science sont réalisés lors d'(une) interruption(s) du cursus santé. L’objectif de cette formation d’excellence est de proposer en parallèle des études de santé, un enseignement scientifique important, permettant l’accès aux masters puis à une thèse de science. La validation de l’enseignement initial (socle) permet l’obtention d’une attestation de validation de l’Ecole Santé Sciences, qui ouvre l’inscription en Master 2 dès la quatrième année d’études (interruption dans les études de santé). La description de ce double cursus est disponible sur le site du Collège des Sciences de la Santé, accès par le lien : http://sante.u-bordeaux.fr/Espace-etudiant/Tout-sur-vos-etudes/Parcours-recherche/Double-cursus-Ecole-Sante- Sciences Schématiquement, l’enseignement de formation initiale (socle) est réparti sur les 2 années et comprend : - 8 modules de 3 jours chacun avec des TP année 1 (2ème année de santé) 100h au total: mathématiques, physique, chimie, biologie année 2 (3ème année de santé) 100h au total : cœur et vaisseaux, neurosciences, immunologie, sciences et humanités contrôle des connaissances pour la validation de chaque module - 2 stages de recherche de 2 mois chacun - une UER Par la suite, les étudiants s’inscrivent aux enseignements de M2 et Doctorat en Sciences, selon le schéma ci-après. 5 Présentation (2) PASS /L.AS San té 2 San té 3 ann ée 2 Formation initiale Santé 2 Santé 3 + + Année 1 Année 2 M2 Doctor at scienc e Santé 4 Santé 5* Santé 6# 3ème cycle santé Doctorat en sciences Doctorat en santé 2 POSSIBILITÉS: M1 RECHERCHE Santé 4 Santé 5* Santé 6# Internat* EDN# 3ème cycle santé (1) ECOS# Doctorat en sciences Doctorat en santé Doctorat science 3ème cycle santé (2) Doctorat science *: Pharmacie, Odontologie: 4 années de santé # : Médecine: 5 années de santé Internat* EDN# ECOS# 6 Première année de formation Descriptif général - 4 modules d'enseignements fondamentaux avec TP : Mathématiques, Physique, Chimie, Biologie, dont les responsables sont listés ci-après dans chacun des programmes. - Stage de 8 semaines (Bordeaux) - Participation à des séminaires/congrès Attention : dans le cas des étudiants en Pharmacie, un stage officinal de 4 semaines doit être réalisé avant la fin de 3eme année : pour les étudiants candidatant à l’ESS, il est préférable de faire ces 4 semaines de stage l’été précédant la seconde année d’études en Pharmacie ! L’enseignement est réalisé par modules (UE) de 3-4 jours (25 heures), les grandes lignes des programmes sont présentées dans les pages suivantes. Ce programme est donné à titre indicatif, les enseignements peuvent comporter des variations par rapport aux intitulés ci-dessous. 7 Module « Mathématiques » (1ère année) Rodolphe THIEBAUT (PU-PH, directeur de l'équipe INSERM/INRIA SISTM: Statistics in Systems Biology and Translational Medicine, U1219) Marie-Gabrielle DUPERRON (junior- interne en santé publique et doctorante en neuroépidémiologie) Le programme de chaque demi-journée est le suivant : Introduction d'1 heure aux outils mathématiques nécessaires à la compréhension du cours suivant 2h de cours (les conférenciers présenteront leur parcours au début) avec discussion. 1) Modèles pour la description des phénomènes liés au vieillissement – Concepts: Modèles de régression, estimation des paramètres (maximum de vraisemblance) – Application: Vieillissement cérébral 2) Modélisation mécanistique cardiologie / cancérologie (INRIA) – Concepts: ODE, PDE, résolution numérique – Applications: Modélisation du signal électrique en cardiologie, modélisation de la croissance tumorale 3) Données de grande dimension / Genome Wide Association Studies – Concepts: Tests statistiques, multiplicité, réduction de dimension – Application: GWAS 4) Modélisation des alertes sanitaires : pharmacovigilance – Concepts: approches bayesiennes – Application: pharmaco-épidemiologie 5) Intégration des données de sources diverses pour la construction d'algorithme – Concepts: ontologies, sql/nosql – Application: informatique médicale 6) Modèles pour l'évaluation des innovations et pour la prédiction des événements de santé – Concepts: information, choix de modèle – Application: épidémiologie clinique 8 Module « Physique » (1ère année) Eric CORMIER (PR, UF Physique, Responsable du Groupe Optique et Lasers Femtosecondes au CELIA (UMR 5107) Josselin DUCHATEAU (junior- Chef de clinique en cardiologie et doctorant en rythmologie cardiaque) Chaque enseignement théorique sera appuyé par des TP et des exercices de modélisation 1) Optique et lasers Enseignements théoriques – Rappels des Notions d’optique géométrique – Lasers et amplificateurs – Propriétés des faisceaux lasers et manipulation – Impulsions courtes et optique non linéaire Modélisation – Concepts: approches bayesiennes – Simulation de systèmes optiques (lance de rayon et optique géometrique) : Zemax, Oslo – Propagation de faisceaux gaussiens (analytique) : ABCD, Rezonator, … – Gain laser : Python – Dynamique pulsée du laser : Python – Impulsions courtes : DiagnoZoo, Fiberdesk – Microscopie 2-photons : Python- TP 2) Mécanique des fluides Enseignements théoriques – Ecoulements dans les capillaires – Tension superficielle Modélisation TP 3) Biomécanique Enseignements théoriques – Mécanique du point – Résistance des matériaux – Biomécanique 4) Electrophysiologie Enseignements théoriques – Rappels d’électrostatique – Propagation dans les milieux biologiques – Traitement du signal Modélisation – Génération des signaux cardiaques/neuronaux – Analyse de signaux complexes TP : Montage d’émetteurs/propagateurs/détecteurs basse fréquence 5) Interaction laser-matière Enseignements théoriques – Processus linéaires et Processus non-linéaires – Interaction avec les milieux solides et biologiques Modélisation – Modèle d’ablation a 2 températures : Python – Propagation de faisceaux dans les milieux diffusants – Réfraction/diffraction sur des interfaces irrégulières TP 6) Domaines de recherches associés Laboratoires et activités – Présentation des thématiques scientifiques locales – Présentation des laboratoires et équipes de recherches (visites et rencontres) – Présentation des réseaux nationaux et internationaux 9 Module « Chimie » (1ère année) Guillaume COMPAIN (MCF, CBMN/IECB-UMR5248) Isabelle BERQUE-BESTEL (PR, UMR CNRS 5248) Camille BERGES (junior) COMPETENCES CIBLES: – Maîtriser les grands concepts de chimie- physique et leurs implications biologiques – Connaitre la chimie inorganique et ses applications thérapeutiques – Comprendre et transposer les réactions de chimie organique au domaine du vivant – Comprendre la réactivite chimique des bio- molécules telles les oligonucléotides ou les peptides – Comprendre l’intérêt de la chimie organique pour la vectorisation et le ciblage actif de (bio)molécules thérapeutiques – Savoir associer une sonde pour l’imagerie à une technique d’imagerie – Comprendre les principes de la chimie des polymères – S’initier à la modélisation moléculaire et comprendre l’intérêt de ces approches calculatoires en drug design et vectorisation PEDAGOGIE: – Préparation de podcasts à visualiser en amont de la formation – Cours integrés interactifs – Lecture et compréhension d’articles – ≪Conférences recherche ≫pédagogiques – Travaux pratiques in silico et/ou expérimentaux CONTENU: 1) Chimie-physique et Chimie bio-inorganique – Thermodynamique et cinétique des processus biologiques (1h Classe inversée - Discussion / 1h : Etude de cas par groupe/Wiki/Présentation) – Chimie bio-inorganique : les métaux en biologie (1h cours integré – 1h : analyse étude d’un extrait d’article scientifique) – Physicochimie des liaisons chimiques dans les biomolécules : outils d’analyse (FTIR, Raman). Exemples d’utilisation pour le suivi du métabolisme (1h15 : Cours integré / 2h TP: ateliers d’activités au laboratoire de recherche / 45 min – ≪Conférence recherche pédagogique ≫sur une technique innovante pour la détection de metabolites) 2) Chimie bio-organique (1 journée) – Base de Chimie Bioorganique (grandes classes de réaction chimiques dans un contexte biologique). Discussion à partir de supports informatiques – Cas pratique par groupe : stratégie de synthèse chimio-enzymatique d’un médicament – Réactivité chimique et Synthèse de peptides – Réactivité chimique et Synthèse d’oligonucléotides (morpholinos, miARN, aptameres...) – Podcasts/discussion à partir d’articles de recherche : oligonucléotides thérapeutiques – ≪Conférence recherche pédagogique ≫: Synthèse de peptidomimetiques et leurs Applications 3 ) Chimie appliquée à la vectorisation, à l’imagerie et au drug design (1 journée) – Bioconjugaison et vectorisation de biomolécules (1h : podcasts – discussion /1h : lecture d’une partie d’article scientifique et explication) – Synthèse de Polymères et leurs applications en vectorisation (1h15 : cours intégré – 45 min ≪conférence recherche pédagogique ≫sur les polymersomes) – Principes uploads/Sante/ dcess22-23-final.pdf