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الجمهورية الجزائرية الديمقراطية الشعبية وزارة التعليم العالي و البحث العلمي Rép

الجمهورية الجزائرية الديمقراطية الشعبية وزارة التعليم العالي و البحث العلمي République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique جامعة محمد الصديق بن يحي-جيجل Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie Département de Microbiologie Appliquée et des Sciences Alimentaires كلية علوم الطبيعة و الحياة قسم الميكروبيولوجيا التطبيقي ة و علوم التغذية Mémoire de Master Filière : Sciences Biologiques Option : Microbiologie Appliquée Thème Inhibition de l’adhésion de Staphylococcus aureus par le surnageant de cultures de bactéries lactiques dans l’industrie agroalimentaire Membres de jury Présidente : Dr Moussaoui S. Examinatrice : Dr Bekka F. Encadreur : Dr Ait meddour A. Présenté par Melle : Amel Boumedjirek Mme : Nada Boukraa Année universitaire : 2019-2020 Numéro d’ordre (bibliothèque)…………… Remerciements Nous remercions tout d’abord DIEU pour la force qui nous a donné pour élaborer ce travail malgré toutes les circonstances. Nous tenons à exprimer notre reconnaissance à notre encadreur le Dr Ait meddour A, pour son rôle, son expertise scientifique son aide et la confiance qu’elle accorde en ses étudiants. Nos sincères remerciements vont également aux membres de jury Le Dr Moussaoui S et le Dr Bekka F d’avoir évalué notre travail. Nous remercions tous les enseignants du Département de Microbiologie Appliquée et des Sciences Alimentaires de l’université de Jijel En fin, nous tenons à exprimer nos reconnaissances et nos remerciements à tous ceux qui ont contribué de près ou de loin pour la réalisation de ce modeste travail. Dédicaces ***Je dédie ce travail : *** A mes chers parents Youcef et Razika et mes deux frères Badis et Ismail qui n’ont pas cessé de m’encourager durant toutes ces années, c’est avec émotion que je leurs exprime tout mon amour et mon respect. ***Je dédie ce travail aussi :*** À mon cher mari Houseyn Qui n’a cessé de m’apporter ses encouragements et son soutien. À mes beaux-parents Mohamed et Malika. À mes beaux-frères KAMEL, Islam et Hacene et leurs femmes Narimene et Dounia. À mes belles sœurs Wissam, Sadjia et Bouchra pour leur compréhension et leurs encouragements, sans oublier les petits Louey Abdsamad et Hanaa. À mon binôme Amel, Je la remercie pour le courage qu’elle m’a donné et tous les moments qu’on a passé ensemble. À toutes mes amies, mes camarades de classe, Mes cousins et cousines, mes grands-parents Mani et Baba que DIEU les garde, Mémé que DIEU la repose et la mette au paradis et toute la famille Boukraa et Djenoub. NADA Dédicaces Grace à Allah Je dédie ce travail : **A Mes très chers parents : Salah et Hadjira Vous avez fait beaucoup d’efforts pour nous, pour nous donner une meilleure éducation, vous avez créé en nous l’amour du travail, vous nous avez guidé avec rigueur mais aussi avec amour, vous avez été toujours là quand nous avions besoin de vous et sans vous nous ne serions pas devenus ce que nous sommes aujourd’hui. Que Dieu vous procure du bonheur, de la santé et vous accord une belle longue vie, si je suis arrivée là c’est grâce à vous. **A mes chers frères : Ahmed et Ramzi **A mes cheres sœurs : Soumia, Meriem et Nozha ** A mes adorables nièces et neveux : Hibat-el rahman, Sadja et Haitem que j’aime plus que tout, merci pour le charme que vous avez ajouté à ma vie. **A toute la famille : Boumedjirek **A mon cher binôme Nada AMEL Glossaire Eczéma atopique : ou dermatite atopique, maladie allergique de la peau, non contagieuse mais très récidivante. Endocardite : infection de l’endocarde (couche interne du cœur), des valves cardiaques ou de l’aorte (gros vaisseau qui sort du cœur), causée par une bactérie. Follicutes : inflammation des follicules pilo-sébacés appelé aussi sycosis en particulier au niveau de la barbe. La forme grave est le sycosis staphylococcique. Elle est d'origine bactérienne, plus rarement mycosique. Furoncle : inflammation et infection de la peau caractérisée par la formation de pus et la destruction du follicule pilo-sébacé, provoquée généralement par un S. aureus. Impétigo : infection très contagieuse de la peau due à staphylocoque doré ou streptocoque, très fréquente chez l'enfant, se manifeste par l'apparition de lésions en forme de bulles remplies de liquide. Infection suppurative : infection caractérisée par l’écoulement de pus, implique la prolifération bactérienne, l’invasion puis la destruction des tissus de l’hôte, la réponse inflammatoire locale et systémique. Intoxication alimentaire : trouble digestif survenant lorsqu'une personne absorbe un aliment contaminé par une bactérie, un virus, un champignon… ou une toxine produite par une bactérie. Mammite : inflammation de la mamelle d’origine infectieuse (due à des bactéries qui pénètrent par le trayon) qui entraîne une réduction et une perturbation de la sécrétion lactée. Ostéomyélite : infection de l’os causé le plus souvent par des bactéries (staphylocoque doré) peut être aigue ou chronique. Otite : inflammation aiguë ou chronique de l'oreille, qui est le plus souvent d'origine infectieuse. Septicémie : infection survenant lorsqu’une infection initiale n’est pas traitée, ou mal traitée. L’agent pathogène à l’origine de l’infection se propage alors au reste de l’organisme par voie sanguine. Sinusite : infection causée par un virus ou une bactérie qui se propage dans les sinus. Cette propagation d’un agent infectieux irrite et enfle la muqueuse des sinus, qui se trouvent obstrués. Toxi-infection alimentaire : infection causée par la consommation d’un aliment contaminé par certains agents infectieux (bactéries, virus ou parasites) ou par leurs toxines. Toxi-infection alimentaire collective : apparition chez au moins deux cas groupés, d’une symptomatologie similaire, le plus souvent de type gastro-intestinal dont on peut rapporter la cause à une même origine alimentaire. Liste des abréviations ADN : Acide désoxyribonucléique ADP-ribosylantes : Adénosine diphosphate ribosilantes BHI : Brain heart infusion DO : Densité optique EPS : Extracellular polymeric substance G+C : Guanine + Cytozine GRAS : Generally recognized as safe ica : Intercellular adhesion KDa : Kilodalton LPV : Leucocidine de Panton Valentine MRS : Man Rogosa Sharpe PFTs : Pore-forming toxins pKa : Constante d'acidité SARM : Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline SEs : Staphylococcal entérotoxins SEA : Staphylococcal enterotoxin type A SEE : Staphylococcal enterotoxin type E SEA à SEE : Staphylococcal enterotoxin type A à E (SEA, SEB, SEC, SED, SEE) SEG : Staphylococcal enterotoxin type G SEI : Staphylococcal enterotoxin type I SEG à SEI : Staphylococcal enterotoxin type G à I (SEG, SHE, SEI) SER : Staphylococcal enterotoxin type R SET : Staphylococcal enterotoxin type T SER à SET : Staphylococcal enterotoxin type R à T (SER, SES, SET) SFP : Staphyloccocal food poisoning TIAC : Toxi-infection alimentaire collective TNase : Désoxyribonucléase thermostable TSB : Tryptic Soy Broth UFC : unité formant colonie Liste des figures Figure 1. Biofilm de S. aureus……………………..…………………………………………..…6 Figure 2. Etapes de formation de biofilms sur les surfaces en contact avec les aliments…….....8 Figure 3. Arbre phylogénétique des bactéries lactiques et genres apparentés………..……….15 Figure 4. Principales étapes pour la formation/détection de biofilms sur support en acier inoxydable………………………………………….…………………………………………23 Figure 5. Image d’une microplaque de 96 puits en polystyrène……………………………..24 Figure 6. Valeurs des DO enregistrées par les cultures de staphylocoques………………........25 Figure 7. Taux de réduction enregistrés par les différentes concentrations du surnageant de cultures ……………………………………………………………………………………….27 Liste des tableaux Tableau I. Facteurs influençant la formation de biofilms……………………..………………..7 Tableau II. Familles et principaux genres des bactéries lactiques………………...…………15 Glossaire Liste des abréviations Liste des figures Liste des tableaux Sommaire Introduction………………………………………………………………………….………..1 Chapitre I. Staphylococcus aureus et le biofilm négatif 1. Staphylococcus aureus .………………………………………………………………...…...3 1.1. Caractéristiques générales …………….…………………………………..………………3 1.2. Pouvoir pathogène ……………...………………………………………………….……...3 1.2.1. Facteurs de virulence………………………….………….………………….….……...3 1.2.1.1. Peptidoglycane ………………………………………………………………..………4 1.2.1.2. Exo-enzymes…………………………………………………………………………..4 1.2.1.3. Composés toxiques …………………………………………………………………...4 1.2.1.4. Formation de biofilms……..………….………………………………………………5 2. Biofilms de S.aureus dans l’industrie agroalimentaire…………………………………….10 2.1. Impact de biofilms de S. aureus sur les équipements …………..….................................10 2.2. Impact de biofilms de S. aureus en santé humaine……..……..........................................11 Chapitre II. Bactéries lactiques 1. Définition et caractères généraux …………….……...………………………...…..............14 2. Activité antimicrobienne……..………………....……………………………...…………..16 2.1. Compétition nutritionnelle……………………………...…………………….………….16 2.2. Substances antibactériennes…….…………………………………………………......... 16 3. Intérêt des bactéries lactiques……………………………………………………….……..18 4. Utilisation de bactéries lactiques comme stratégie pour la lutte contre les biofilms de S. aureus dans l’industrie agroalimentaire……………………………...….……………….…20 Chapitre III. Quelques études sur l’inhibition de l’adhésion de Staphylococcus aureus par le surnageant de culture de bactéries lactiques 1. Etude de Kmet…………………………………………….…………...……..……....…...23 1.1. Origine des souches et préparation du surnageant de culture ………….……….…….…23 1.2. Formation de biofilm et effet inhibiteur du surnageant en utilisant des supports en acier inoxydable………………………………………………………………………………...23 1.3. Formation de biofilm et effet inhibiteur du surnageant en utilisant des microplaques de 96 puits…...……………………………………………….………………………………….24 2. Etude de Koohestani et ses collaborateurs ...……………………………………….…….25 2.1. Formation de biofilm de S. aureus ………………………………………...……...…..…26 2.2. Effet inhibiteur du surnageant en utilisant microplaques de 24 puits………………...….26 Conclusion……….…………………………….……………………………………….…….28 Références bibliographiques Résumé Introduction Introduction 1 La bio-contamination des surfaces est de plus en plus identifiée comme une source de problèmes industriels sévères dans des domaines très divers. Les surfaces contaminées permettent la propagation de microorganismes pathogènes et d’altération aux aliments dans les usines de production et de transformation de ces derniers (Jerônimo et al., 2012). Si la contamination n'est pas complètement éliminée, les futures productions pourraient être affectées (Kunigk et Almeida, 2001). De plus, ce phénomène est à l’origine uploads/Geographie/ m-mb-04-20.pdf