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G U I D E DES MÉTHODES DE DIAGNOSTIC écologique des milieux naturels Applicatio

G U I D E DES MÉTHODES DE DIAGNOSTIC écologique des milieux naturels Application aux sites de carrière 3 Yves ADAM (UNPG) Christian BÉRANGER (UNPG) Olivier DELZONS (SPN/MNHN) Bernard FROCHOT (Président de Bourgogne-Nature) Johan GOURVIL (ENCEM) Patrick LECOMTE (UNPG) Marion PARISOT-LAPRUN (ANVL/Association des Naturalistes de la Vallée du Loing) avec le concours de Farid BENSETTITI (SPN/MNHN) Alain CANARD (Université de Rennes, SPN/MNHN) Xavier CUCHERAT (Picardie Nature) Jean-Christophe de MASSARY (SPN/MNHN) Olivier ESCUDER (SPN/MNHN) Olivier GARGOMINY (SPN/MNHN) Vincent GAUDILLAT (SPN/MNHN) Arnaud HORELLOU (SPN/MNHN) Jean-Christophe KOVACS (ÉCOSPHÈRE) Gérard LUQUET (SPN/MNHN) Pierre NOËL (SPN/MNHN) Vincent PRIÉ (BIOTOPE) Jean-Philippe SIBLET (SPN/MNHN) Olivier VERDIER (ENCEM) et la contribution particulière de l’Association Française Interprofessionnelle des Écologues (AFIE) Référence bibliographique du présent ouvrage Auteurs : Adam Y., Béranger C., Delzons O., Frochot B., Gourvil J., Lecomte P., Parisot-Laprun M. Année : 2015 Titre : « Guide des méthodes de diagnostic écologique des milieux naturels - Application aux sites de carrière » UNPG, 3 rue Alfred Roll 75849 - Paris Cedex 17 - environnement@unicem.fr Ont participé à la rédaction de ce document Maquette : Sonia LANDREAU Relecture et corrections : Ginette CHARRON Recherche iconographique : Marion LE GOFFIC SOMMAIRE PRÉAMBULES de l’UNPG, du MNHN, de l’AFIE 7 Partie 1 – CONTEXTE ET GÉNÉRALITÉS 11 A) POURQUOI CE GUIDE ? 13 B) DES MÉTHODES DE DIAGNOSTIC ÉCOLOGIQUE DES MILIEUX NATURELS : POUR QUELS USAGES ? 17 Les domaines d’application 18 1) Investigations préliminaires (ou pré-diagnostics) 20 2) Étude d’impact 21 3) Étude d’incidence Natura 2000 28 4) Étude d’incidence « loi sur l’eau » 32 5) Demande de dérogation sur des espèces protégées 35 6) Élaboration et suivi d’un plan de gestion d’espèces ou d’espaces 40 7) Élaboration et suivi d’un plan de surveillance de la qualité d’un espace 41 8) Programmes d’acquisition de données sur le patrimoine naturel 42 9) Approche environnementale dans le cadre de l’élaboration d’un schéma 42 d’aménagement C) CHOIX DES MÉTHODES DE DIAGNOSTIC ÉCOLOGIQUE DES MILIEUX NATURELS 45 C.1. Quelles approches et quel déroulement pour établir un diagnostic des milieux naturels ? 46 C.2. Choix des méthodes de diagnostic écologique 50 1) Choix des méthodes selon le type d’étude 50 2) Choix des méthodes selon l’objectif et les priorités de l’étude 51 3) Choix des méthodes selon l’échelle géographique 52 4) Choix des méthodes selon le type de carrière 53 D) QUELQUES PRINCIPES À RESPECTER : PÉRIODES DE PROSPECTION, RÉGLEMENTATION, PRÉCAUTIONS 55 E) EXEMPLE FICTIF 59 1) Présentation du site envisagé par le projet d’extraction 60 2) Investigations préliminaires 60 3) Redéfinition du projet 61 4) Définition du secteur d’étude 61 5) Diagnostic écologique 62 6) Étude d’impact 62 5 F) BIBLIOGRAPHIE 63 Partie 2 - FICHES MÉTHODOLOGIQUES 69 Les approches générales 73 1 – Méthodes - Généralités 75 2 – Transects 83 3 – Capture - marquage - recapture 87 4 – Enlèvements successifs 93 5 – Bio-indication 97 6 – Continuité écologique 105 Les outils concernant la flore et la végétation 111 7 – Flore et végétation 113 8 – Communautés végétales et habitats 125 Les outils concernant la faune 133 Invertébrés (hors insectes) 9 – Mollusques 135 10 – Araignées 143 11 – Écrevisses 151 12 – Macroinvertébrés aquatiques 157 Invertébrés/insectes 13 – Insectes/généralités 167 14 – Odonates (libellules) 179 15 – Orthoptères (criquets/sauterelles) 185 16 – Coléoptères carabidés 191 17 – Coléoptères saproxyliques 197 18 – Hyménoptères apoïdes (abeilles solitaires et bourdons) 205 19 – Fourmis rousses 209 20 – Syrphes 213 21 – Rhopalocères (papillons de jour) 219 22 – Hétérocères (papillons de nuit) 225 Vertébrés 23 – Inventaire qualitatif des poissons 229 24 – Quantification des poissons 233 25 – Inventaire qualitatif des amphibiens 241 26 – Quantification des amphibiens 249 27 – Reptiles 257 28 – Inventaire qualitatif des oiseaux 263 29 – Quantification des oiseaux 269 30 – Grands mammifères 283 31 – Chiroptères 289 32 – Micromammifères 297 SOMMAIRE Les indices 303 33 – Indice biologique global normalisé (IBGN) 305 34 – Indice biologique macrophytique en rivière (IBMR) et Indice biologique macrophytique en lac (IBML) 313 35 – Indice poissons rivière (IPR) 321 36 – Indice de biodiversité des étangs et des mares (IBEM) 327 37 – Indice mollusques (IMOL) 331 38 – Indice phytoplancton lacustre (IPLAC) 335 39 – Indice biologique diatomées (IBD) 341 40 – Indice oligochètes de bio-indication lacustre (IOBL) 347 41 – Indice oligochètes de bio-indication des sédiments (IOBS) 351 42 – Diagnostic de qualité de l’air (lichens) 357 ANNEXE A - Zonages et espèces d’intérêt écologique 365 ANNEXE B - Valeur patrimoniale 371 GLOSSAIRE 379 LISTE DES SIGLES ET ACRONYMES 387 préambule UNPG Face aux enjeux multiples liés à l’érosion de la biodiversité, avec la prise en compte de sa préservation dans les politiques publiques, en particulier avec les Trames Vertes et Bleues, ou encore le renforcement du contenu des études d’im pact, les expertises des milieux naturels doivent s’appuyer sur des méthodes rigoureusement reconnues. Ainsi l’UNPG a confié au Muséum National d’Histoire Naturelle et à l’Associa tion Française Interprofessionnelle des Écologues l’élaboration d’un guide sur les méthodes de diagnostic écologique des milieux naturels. Cet ouvrage s’attache à décrire précisément de nombreux protocoles selon les types de milieux, applicables pour les études d’impact comme pour les suivis écologiques d’exploitation, de réaménagements ou de mesures compen satoires. Il s’appuie sur des fiches méthodologiques selon les groupes (flore, insectes, reptiles, …) et en fonction des problématiques étudiées (valeur patri moniale, continuité écologique,…). Il est destiné à un grand nombre d’acteurs (acteurs économiques, bureaux d’études, gestionnaires d’espaces naturels, …) et permet de mener une exper tise écologique scientifique et proportionnée aux enjeux du projet dans son territoire. L’approche naissante des services écosystémiques et de leurs valeurs, la combi naison entre écologie et paysage ou encore, les relations entre la biodiversité et les dérèglements climatiques sont autant de nouveaux défis auxquels il fau dra répondre par des analyses pertinentes et partagées. Ce document vient compléter les travaux menés en collaboration étroite avec le monde scientifique depuis plus de 20 ans sur l’amélioration des connais sances relatives aux effets et potentialités des carrières. Il s’inscrit pleinement dans l’engagement de l’UNPG à la Stratégie Nationale pour la Biodiversité et répond aux ambitions nécessaires et légitimes de la Profession pour concilier les enjeux de la préservation de la biodiversité et du développement durable des activités économiques. Christian BÉRANGER Président de la Commission Environnement de l’UNPG 7 MNHN préambule L’importance de la biodiversité comme élément vital pour l’humanité semble aujourd’hui admise même si la transcription politique de ce paradigme reste encore trop soumise aux aléas économiques et qu’elle semble parfois une va riable d’ajustement dans les politiques publiques. Néanmoins la réglementation en matière de prise en compte des espèces et des habitats naturels n’a jamais cessé de se complexifier depuis la Loi fondatrice sur la protection de la nature de juillet 1976. Et les différents acteurs, au premier rang desquels figurent les entreprises, se trouvent confrontés à l’obligation d’appliquer des textes sans pouvoir toujours réellement comprendre leur portée et les modalités de leur ap plication. À l’identique, les services publics chargés des missions de police sont souvent démunis face au développement de méthodologies ésotériques, ou de dispositifs mal maîtrisés. Enfin, les bureaux d’études chargés de mettre en œuvre la réglementation pour le compte des donneurs d’ordre publics ou privés sont eux-mêmes confrontés à l’utilisation de nombreux « outils » dont ils ne mesurent pas toujours les limites de l’application au regard des moyens financiers alloués. Cela contribue à une réelle discrimination entre les propositions d’études faites par les experts auprès des commanditaires. L’ouvrage que vous avez entre les mains tente de tracer un chemin dans la jungle des procédés, des méthodes et des évaluations relatifs à l’étude de la faune, de la flore et des habitats. Il vise à permettre de mieux comprendre comment et pourquoi ces outils ont été conçus et surtout à quelles questions ils permettent de répondre. Il constitue un vade-mecum à l’usage des profession nels qui souhaitent optimiser leurs commandes ou leurs réponses. Soyons clairs, il ne s’agit pas ici d’essayer de renverser les rôles. Chacun doit être à sa place dans la fonction qu’il occupe. Mais le partage d’une culture de base commune ne peut que favoriser les échanges et la compréhension mutuelle, ferment d’une meilleure application des textes réglementaires et d’une plus grande appropria tion des problématiques. Ce guide se veut avant tout pratique. Mais il ne revendique pas d’être d’une utilisation facile. Il nécessitera du lecteur un effort minimal pour entrer dans la logique de sa conception. Mais l’effort sera sans nul doute récompensé pour celui qui s’en donnera la peine. Il faut remercier ici tous ceux qui, de près ou de loin, ont permis à cet ouvrage d’exister : auteurs, relecteurs, metteurs en page, financeurs. Ce document constitue un des ouvrages les plus aboutis sur ces questions complexes. J’espère qu’au fur et à mesure de son usage, vous parta gerez ce constat. Merci à l’UNPG et à l’AFIE de cette collaboration fructueuse ! Jean-Philippe SIBLET Directeur du Service du Patrimoine uploads/Sante/ diagnostic-milieu-naturel-unpg.pdf