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Dr S.Nani.PES Médecine Communautaire. Laboratoire d’épidémiologie. FMPC. INVEST

Dr S.Nani.PES Médecine Communautaire. Laboratoire d’épidémiologie. FMPC. INVESTIGATION D’UNE ÉPIDÉMIE Objectifs Définir les termes: épidémie, endémie, pandémie Comprendre la justification de l’investigation d’une épidémie Décrire les étapes de la démarche d’investigation d’une épidémie Plan Introduction Préparation de l’investigation Etapes de la démarche d’une investigation Introduction Une épidémie est une urgence de santé publique Nécessite une explication rapide et l’instauration de mesures de contrôle efficaces. Nécessite le suivi d’une démarche scientifique Introduction Une épidémie est une urgence de santé publique Conséquences graves humaines, sociales et économiques. Nécessite le suivi d’une démarche scientifique Introduction Germes historiquement connus. Germes multi-résistants (SAMR,ERV,,,). Agents pathogènes émergents. Épidémie (epidemic/outbreak) Présence de plus de cas de malades que prévu ou observé habituellement, dans une région donnée ou au sein d'un groupe spécifique de personnes sur une période de temps donnée. Definitions Cluster (foyer épidémique) Concentration temporo-spatiale de cas perçue comme élevée Endémie Présence habituelle d’une maladie dans une région déterminée Pandémie Propagation d’une maladie à la population de tout un continent voire au monde entier Definitions AGENT ENVIRONNEMENT HOTETRANSMISSION 10 COVID19 Intérêt de l’investigation d’une épidémie • Maîtriser (contrôler) l'épidémie • Prévenir la survenue de nouveaux épisodes • Approfondir les connaissances sur les relations entre l’agent causal et l’environnement. • Tester la capacité de détection du système de surveillance épidémiologique en place. OBJECTIFS SPÉCIFIQUES • Identifier l’agent causal • Localiser la source • Déterminer le mode de transmission • Identifier la population à risque • Déterminer les facteurs de risque de la maladie Intérêt de l’investigation d’une épidémie • Trop de malades en un temps et lieu donnés • Notion d'urgence (perçue et/ou vraie) • Pression: média, politique, population ... • Responsabilité…….. ? • Intervenants multiples Démarche systématisée Pr S.Nani Wu Z, McGoogan JM. Characteristics of and Important Lessons From the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Outbreak in China: Summary of a Report of 72 314 Cases From the Chinese Center for Disease Control and Prevention. JAMA. Published online February 24, 2020 12/03/2020 WHO pandémie Keni R, Alexander A, Nayak PG, Mudgal J and Nandakumar K (2020) COVID-19: Emergence, Spread, Possible Treatments, and Global Burden. Front. Public Health 8:216 Préparation de l’investigation • Qui a alerté le service de santé • Qui doit être informé de l’épidémie • Quelle sont les motivations de la demande d’investigation • A-t-on les autorisations officielles • Quelle est la composition de l’équipe d’investigation et qui la dirigera • Qui est responsable de l’archivage, de l’utilisation et de la diffusion des résultats et des données • Qui va faire l’analyse • Y aura-t-il un rapport écrit, qui le signera comme premier auteur • S’est–on assuré de la collaboration de toutes les catégories professionnelles requises pour l’investigation ( en particulier les spécialistes du laboratoire) • Qui sera le porte parole de l’équipe de l’investigation C’est la phase qui conditionne la réalisation et l’analyse de l’enquête ainsi que l’utilisation des résultats La personne chargée de l’enquête doit répondre à plusieurs questions: Equipes de préparation COVID19 • Comité nationale de pilotage • Centre National d’Opérations d’Urgence en Santé Publique (CNOUSP) • Centres Régionaux d’Opérations d’Urgence en Santé Publique (CROUSP) • Equipes multidisciplinaires d’Intervention Rapide (EIR) • DELM • Ministères de l’intérieur, enseignement, équipement et transports, emplois……….. – Phase descriptive: • Confirmer l’existence de l’épidémie • Vérifier le diagnostic • Établir la définition des cas • Collecter les données • Décrire l’épidémie selon les caractéristiques: PLT – Phase des hypothèses: • Formuler les hypothèses – Phase analytique: • Tester les hypothèses • Proposer les mesures de contrôle • Préparer le rapport • Continuer la surveillance 03 phases, 10 étapes : Démarche de l’investigation d’un épisode épidémique LES ETAPES DE LA DEMARCHE DE L’INVESTIGATION 1. Confirmer l’existence de l’épidémie • La confirmation d’un épisode épidémique: L’augmentation du nombre de cas de maladie ou toute autre événement de santé par rapport aux valeurs habituellement attendues pour une période, un lieu et une population donnée. • Les données de la SE hebdomadaires ou mensuelles permettent souvent cette comparaison. • Mais! Artefact du système de surveillance( nouveaux système de diagnostic, nouvelle personne chargée de la surveillance) Confirmer l’existence d’une épidemie Endémie versus épidémie Épisode épidémique versus épidémie Par rapport à quelle situation initiale? - La surveillance des maladies - Les données provenant de sources locales - Comparaison avec les régions voisines ou des données nationales -Réels par rapport aux artefacts Observation d'un événement unique ou un ensemble d'événements par : • Le personnel médical (médecins et infirmièr(e)s) • Le personnel de laboratoire • Responsables de la surveillance épidémiologique • Travailleurs de la Communauté • Information fournie par un ou plusieurs patients • Activités de surveillance de routine • Médias……… Comment les foyers épidémiques sont générelement détécté ? 2. Confirmer le diagnostic • Il faut avoir recours aux moyens de laboratoire disponible pour: – confirmer le diagnostic – pour exclure les cas qui ont un syndrome similaire à la maladie considérée dans l’épidémie – EX: PCR en cas de covid19 Approche à 3 volets • Investigation Epidémiologique • Examen au Laboratoire • Evaluation Environmentale 3. Définir les cas(1) – Elle repose sur des éléments: • Cliniques : symptômes simples et précis • Biologiques : examens de certitude • Épidémiologique: critères de distribution; LPT – La définition ne doit pas être trop sensible(pour éviter d’inclure les faux cas) ni trop spécifique ( pour ne pas exclure les vrais cas) Étape fondamentale Base de l’investigation Catégories • Cas Confirmés – Évenements confirmés par le laboratoire • Cas Probables – Evenements compatibles par l’évaluation clinique • Cas Possibles – Peuvent être comptés comme cas s’ils sont investigués. • Lorsque on ne peut pas trancher sur la nature exacte de la maladie pour établir la définition précise il faut utiliser une définition qui donne une stratification des malades: – Cas Certains: confirmer par des examens de certitude – Cas Probables: ayant un argument cliniques et biologiques de présomption – Cas Possibles: pour les cas douteux 3. Définir les cas(2) SENSIBILITESPECIFICITE Plusieurs échantillons à tester Plusieurs faux positifs Définition de Cas sensible La majorité des cas sont détéctés, mais … Peu d’échantillons à tester Peu de faux positifs Définition de Cas Spécifique Cas ignorés, mais …SENSITIVITYSPECIFICITY • Effectuer une surveillance selon la définition de cas • La surveillance active (par exemple, examiner les dossiers médicaux) • Essayez d'identifier tous les cas • Recueillir des données sur les cas-patients • Création d'une base de données Recherche Systématique des Cas • Une fiche d’enquête doit être établie pour chaque malade comprenant les informations nécessaires: » Les données démographiques: » Les données cliniques, biologiques » Les données épidémiologiques 4. Collecte des données Identification Implantation des mesures de contrôle efficace Évaluation ultérieure 5. Caractériser l’épidémie Les données doivent être organiser de manière à pouvoir décrire l’épidémie selon les caractéristiques du temps, lieu et de personne – Caractéristiques TEMPS : La courbe épidémique représente la distribution des cas en fonction de début des symptômes. Elle permet de déterminer : • La période exacte de l’épidémie • La période probable de l’exposition • Le type d’épidémie: Source ponctuelle Source persistante Source commune qui revient COURBE EPIDEMIQUE Santé Publique France Mai 2016 5. Caractériser l’épidémie • Lieu: la description de la distribution géographique des cas ou des taux d’attaque permet d’identifier les zones à risque. Épidémie de choléra 1854 John Snow • Personnes: – Elles peuvent être catégorisées en terme de : • Leurs caractères innés ou acquis: âge, sexe, race, ethnie, état matrimonial…. • Leur activités : profession, loisirs… • Autres : coutumes, habitudes alimentaires…. – Les taux d’attaque spécifique de chaque catégories: identifier les personnes à haut risque Nb: l’âge est la variable la plus fréquemment liée au risque de contracter une maladie (ouvre souvent la voie pour formuler les hypothèses sur l’origine possible de l’épidémie). 5. Caractériser l’épidémie Pr S.Nani The Epidemiological Characteristics of an Outbreak of 2019 Novel Coronavirus Diseases (COVID-19) — China, 2020: CDC China Pr S.Nani The Epidemiological Characteristics of an Outbreak of 2019 Novel Coronavirus Diseases (COVID-19) — China, 2020: CDC China Classification des Cas • Cas Primaire – La personne qui a introduit la maladie dans la population. • Cas Index – Le premier cas à retenir l’attention des investigateurs. • Cas Secondaire – Les cas contacts, survenant après une période d'incubation suivant l'exposition. 6. Formuler des hypothèses • En se basant sur : – Les symptômes cliniques – L’aspect de la courbe épidémique +++ – La différence des taux d’attaque selon les caractéristiques PLT (les groupes à risque) • Une ou +eurs hypothèses seront émises sur la cause de l’épidémie: agent causal, source et mode de transmission 7. Tester l’hypothèse Deux types d’analyses: – Épidémiologique: Cas témoin Cohorte retrospective – Examens complémentaires 6. Tester les hypothèses • Approche cas- témoins –Elle repose sur la comparaison d’un groupe de cas et d’un groupe de témoins en ce qui concerne l’exposition à un facteur. –On calculera le pourcentage de cas exposé ( malades) et on le comparera au pourcentage de témoins(non malades) exposés au même FR Total témoins cas 68 20 48 Ont consommé 102 100 2 uploads/Sante/ investigation-d-x27-un-epidemie-2021-nov-2021-f.pdf