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Universite des Sciences des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB) Fa

Universite des Sciences des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB) Faculté : Faculté de Médecine et d’Odontostomatologie FMOS DER : Santé Publique Tel.: +223 20225277 Email : fmosmali@gmail.com Site web : Année universitaire : Enseignant responsable : Dr Oumar THIERO, MSc, MSPH, PhD. Professeur Maitre-Assistant : Spécialité : Biostatistiques/Bio-informatiques Bureau : DER Santé Publique 1er Etage Horaire 40H Tel : +223 66732592 E-mail : outhiero@yahoo.fr Biographie sommaire : Enseignant-chercheur depuis 1999 au DER de Santé Publique à la Faculté de Médecine, de Pharmacie et d’odontostomatologie, FMPOS, USTTB, Dr. Oumar THIERO est aussi activement impliqué dans de nombreux projets de recherche au sein de plusieurs universités nationales et internationales. Après un Master / DEA en Santé Publique : Option Biostatistique Epidémiologie en 2002, à l’école de Santé Publique et Médecine Tropicale à l'université de Tulane (School of Public Health and Tropical Medicine, SPHTM, Tulane University USA), nous avons été sélectionné en 2008 pour continuer au programme de PhD en Santé Publique, Option : Biostatistiques – Bio-informatiques. Totalement engagé sur le plan national dans l’enseignement des cours de Biostatistiques, de Bio-informatique, de l’épidémiologie et de la méthodologie de recherche au DER santé publique à la FMOS, l’USTTB, mais aussi sur le plan international en collaboration avec l’université de Tulane, SPHTM aux USA. Après notre participation active pour la mise en place des programmes de formation en santé publique (2010) et de bio-informatiques (2014) au DER de santé publique, nous agissons dans le volet formation continue dans l’encadrement des chercheurs, des internes et des étudiants en spécialisation (Master, PhD) dans l’évolution de leur protocole de recherche, de thèses ou de productions scientifiques. Notre collaboration de recherche multidiplinaire s’étend à plusieurs universités et centres de recherches nationaux et internationaux tels que : Malaria Research and Training Center, MRTC ; Centre Universitaire de Recherche Clinique, UCRC ; Centre international pour l'excellence de la recherche sur le paludisme, ICEMR ; Centre de recherche sur la médecine tropicale du Mali pour les maladies tropicales infectieuses négligées, TMRC ; Centre de recherche et d'étude pour la survie des enfants, CREDOS; Centre National des Maladies, CNAM, le département de de Chirurgie de l’école de Médecine de l’Université de Tulane, l’Université de Californie San Francisco, UCSF ; etc… . En fin, nous participons à plusieurs groupes indépendants de lecture « reviewers » de journaux de publication scientifiques internationaux. Dernière mise à jour : Avril 2020 Enseignant associe : ( Nom, Prénom et grade) ; Spécialité : Bureau Horaire : Tel : E-mail I) Identification de l’UE/EC Med 112 Domaine Sciences de la Santé Mention : Medecine Spécilaité : Santé Publique Niveau : Medecine1 Semestre Jour Horaire : : S1 L,M,V 180 UE (intitulé) : Mathématiques Informatique Code : Med 112 Crédit(s) : 8 Volume horaire global (VHG) 160 H A) Présentiel 100 H A1) VHG CM 60 H A2) VHG TD 20 H A3) VHG TP 20 H B) Travail personnel étudiant 60 H EC (intitulé) : Biostatistiques Code : 1/2Med112 Poids(s) : 2/3 Volume horaire global (VHG) 100 H A) Présentiel 60 H A1) VHG CM 40 H A2) VHG TD 20 H A3) VHG TP H B) Travail personnel étudiant 40 H Pré-requis : 1- Calculus I,II.III II) Objectif général/objectifs spécifiques ou compétences d’apprentissage A l’issue des enseignements, les étudiants devraient être capables de : OG : - Avoir les concepts de base biostatistique et épidémiologique pour mesurer et comparer les paramètres des caractères de données biologiques et/ou médicales. - Appliquer en utiliser l’approche biostatistique et épidémiologique pour l’évaluation critique les éléments rationnels (preuves) pour la prise de décision en santé publique. OS 1: - Définir, savoir calculer et représenter les différentes statistiques des caractères d’une série statistique, OS 2: - Déterminer et différentier les caractéristiques et l’usage des distributions de fréquences simples, cumulées, symétrique et asymétriques pour un ensemble de données biologiques et/ou médicales. OS 3 Déterminer la relation entre la probabilité conditionnelle et la notion de diagnostic et de dépistage OS 4: - Déterminer et interpréter les notions : d’Intervalle de confiance, de coefficient de corrélation, de pente de régression linéaire simple. OS 5: - De formuler correctement des hypothèses biostatistiques en fin de pouvoir effectuer les tests statistiques appropriés et l’interprétation des résultats. III) Description sommaire du cours Ce cours est une introduction à la Biostatistique et à l’epidemiologie descriptive et analytique. Il est reparti en deux parties de quatre chapitres chacune; une partie descriptive et une partie analytique. Les huit chapitres permettront à l’etudiant d’avoir les concepts de base biostatistique et épidémiologique pour mesurer et comparer les paramètres des caractères de données biologiques et/ou médicales. A la fin de chaque chapitre, des exercices d’applications et des travaux dirigés sont proposés en classe et en groupe restreint pour les étudiants. Les etudiants sont encouragés à traiter les exercices à domicile et/ou en groupe au fur et à mesure que le cours avance pour une mieilleur assimilation des concepts. Les trois premiers chapitres etaillent la généralité sur les séries statistiques avec les definitions de bases puis l’analyse combinatoire et les notions de calcul des probabilités. Le chapitres quatre develope les differents lois de probabilités sur les variables discretes et continues. Le reste du cours se focalise globalement sur l’inference statistique et analytique. Les tests d’hypotheses, l’analyse de variances, et l’introduction à la correlation et la regression lineaire simple composent cette partie. IV) Contenus des enseignements Intitulé du chapitre Objectifs spécifiques concernés Contenu indifcatif Méthodes/ matériels pédagogiques Activités de l’étudiant Chapitre I Partie Statistique descriptive OS1 OS2 OS3 Enseignements théoriques/travaux dirigés 1: Généralité sur les séries statistiques (4H) Copie magistrale du chapitre 48h à 24h à l’avance, Présentation/exposé en classe Questions /réponses suivi de synthèse Lecture de la copie magistrale avant le l’exposé du cours Travaux en groupe et individuel 2: Analyse Combinatoire (4H) Copie magistrale du chapitre 48h à 24h à l’avance, Présentation/exposé en classe Questions /réponses suivi de synthèse Lecture de la copie magistrale avant le l’exposé du cours Travaux en groupe et individuel 3: Notions de calcul des probabilités (4H) Copie magistrale du chapitre 48h à 24h à l’avance, Présentation/exposé en classe Questions /réponses suivi de synthèse Lecture de la copie magistrale avant le l’exposé du cours Travaux en groupe et individuel 4 : Lois/distributions de probabilités (8H) Copie magistrale du chapitre 48h à 24h à l’avance, Présentation/exposé en classe Questions /réponses suivi de synthèse Lecture de la copie magistrale avant le l’exposé du cours Travaux en groupe et individuel Travaux pratiques/projets/stages 1: Généralité sur les séries statistiques (2H) Devoirs par groupe de travail 2: Analyse Combinatoire (2H) Devoirs par groupe de travail 3: Notions de calcul des probabilités (2H) Devoirs par groupe de travail 4 : Lois ou distributions de probabilités (4H) Devoirs par groupe de travail Chapitre II Partie Statistique Analytique OS4 OS5 Enseignements théoriques/travaux dirigés 5: Estimation et distribution de paramètres d’échantillon (4H) Copie magistrale du chapitre 48h à 24h à l’avance, Présentation/exposé en classe Questions /réponses suivi de synthèse Lecture de la copie magistrale avant le l’exposé du cours Travaux en groupe et individuel 6: Comparaison de Variables : tests d’hypothèses (8H) Copie magistrale du chapitre 48h à 24h à l’avance, Présentation/exposé en classe Questions /réponses suivi de synthèse Lecture de la copie magistrale avant le l’exposé du cours Travaux en groupe et individuel 7 : Analyse de variances (4H) Présentation/exposé en classe Questions /réponses suivi de synthèse Lecture de la copie magistrale avant le l’exposé du cours Travaux en groupe et individuel 8 : Notion de Corrélation et de Régression linéaire (4H) Présentation/exposé en classe Questions /réponses suivi de synthèse Lecture de la copie magistrale avant le l’exposé du cours Travaux en groupe et individuel Travaux pratiques/projets/stages 5: Estimation et distribution de paramètres d’échantillon (2H) Devoirs par groupe de travail 6: Comparaison de Variables : tests d’hypothèses (4H) Devoirs par groupe de travail 7 : Analyse de variances (2H) Devoirs par groupe de travail 8 : Notion de Corrélation et de Régression linéaire (2H) Devoirs par groupe de travail Signatures ----01/09/2020----------------- ---------------Dr-Oumar THIERO-------------- Date Enseignant responsable du cours ---------------------- -------------Pr-Hamadoun Sangho------------ Date Chef de DER V) Matériel de cours 1. Video Projecteur, ordinateur portable, et pointer 2. Tableau blanc et Feuitre 3. Calculatrice programmable VI) Modalités d’évaluation Type d’évaluation Part contributive du type d’évaluation dans le calcul de la note finale Critères d’évaluation Matériels pédagogiques Questions d’évaluation Questions de cours, QCM, exercices, projets,… Travail individuel Contrôle continu Examen 100% Devoirs par groupe de travail et travail individuel Questions reponses et/ou QCM Examen de rattrape VI) Bibliographie, litterature recommendee 1 Syllabus du cours 2 3 Règles de fonctionnement du cours Cette partie décline les règles de fonctionnement de votre cours. Elle vous permet de communiquer sur ce que vous attendez des étudiants. Vous pouvez aborder certains points comme par exemple : • Le respect des délais de remise des travaux : Est-ce que les étudiants sont pénalisés en cas de retard dans la remise des travaux ? Quelle forme prend cette pénalité ? • L’absentéisme : La présence en cours est-elle obligatoire, contrôlée ? • L’engagement dans le cours uploads/Sante/ syllabus-biostatistiquesmed1-ot2020.pdf