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Cours de Phytopathologie sp ciale é Maitre de Conférences, Chef de l’Unité de R

Cours de Phytopathologie sp ciale é Maitre de Conférences, Chef de l’Unité de Recherche de Phytopathologie et Zoologie Agricole, Département de Protection des Végétaux, FASA, Université de Dschang jdjeugapfovo@yahoo.fr Tel. 651 008 706 Pr DJEUGAP FOVO Joseph Code UE: ITAG622, Charge horaire : 30 h (CM : 22h, TD/TP : 8h) 2 Rappel : Voir cours de phytopathologie générale (PV3) - Notion de plante-hôte, saprobe, parasite, agents pathogènes et insectes vecteurs - Concept de maladies végétales (maladies biotiques, abiotiques, dépérissement), maladies vasculaires (trachéomycose, trachéobactériose), maladies épidémiologiques, airborne diseases, seedborne diseases, soilborne diseases, post-harvest diseases, mycotoxicoses, quarantaine végétale, etc. - Notion de pathogénèse, écosystème, agrosystème, pathosystème, agroterrorisme - Caractéristiques de quelques agents phytopathogenes et parasites chlorophylliens des végétaux, hémiparasite. - Rappel : Les postulats de koch (1882) 3 Rappels: Voir cours de phytopathologie générale Robert Koch (1843 – 1910), était un médecin et bactériologiste. Il fut le premier de montrer en 1876 que l’anthrax qui attaque les moutons, certains animaux y compris l’homme était cause par une bactérie, Bacillus anthracis. C’est également lui qui mit également en évidence l’agent pathogène de la tuberculose (1882) et le cholera (1883). Selon Koch, 4 conditions/étapes doivent être remplies afin d’affirmer qu’un microorganisme isole d’un organisme malade soit considéré comme responsable de la maladie observée : 4 1. Le microorganisme présumé pathogène doit être présent sur chaque organisme (i.e. plante) malade. i.e. être constamment associe à la maladie. 2. Le présumé agent pathogène doit être isole de l’organisme malade et purifie sur milieu de culture 3. La culture pure du présumé agent pathogène lorsqu’elle est inoculée chez une plante saine susceptible, cette dernière doit développer la maladie initialement observée sur l’organisme (plante) 4. Le présumé agent pathogène doit être ré-isole à partir de cette plante qui a développé la maladie à l’ étape 2. Limites de ces postulats : - Tous les agents pathogènes ne sont pas cultivables et purifiables in vitro sur milieux de culture (ex. certains virus, phytoplasmes, bactéries et les champignons parasites obligatoires : charbon, rouille, oidium, mildiou poudreux etc ) 5 6 Notion de triangle de la maladie Pour qu'une plante développe une maladie, certaines conditions doivent être réunies, tel qu'expliqué dans le diagramme ci-dessous . Ce diagramme démontre que trois conditions doivent coexister pour qu'une maladie apparaisse, soit : un agent , un hôte potentiellement à risque et des conditions environnementales favorables. 7 Introduction générale/Rappels hytopathologie (mycologie, bactériologie, virologie, diagnostic, ecteur des maladies, épidémiologie, lutte) hytopathologie spéciale (cultures annuelles et pérennes, forestières: mences, plantules, arbres et bois), Maladie abiotique et maladie biotique, Mycose, bactériose, virose, nématodes, plantes parasites épérissement, carie/pourridié, utte (culturale, génétique, immunisation, biologique, physique, hirurgie végétale, récolte sanitaire, chimique, intégrée, avertissement), tte préventive et curative, bio pesticides, bio fertilisants, etc. iologie moléculaire et phytopathologie moderne 8 Introduction générale Partie I : Les principales maladies des cultures 1) Les maladies hébergées par les semences / seedborne diseases 2) Les maladies hébergées par le sol / soilborne diseases 3) Les principales maladies des cultures stimulantes (cacao, café, thé, tabac) 4) Les principales maladies des cultures fruitières (banane, agrumes, ananas, papaye) 5) Les principales maladies des cultures céréalières (maïs, riz, sorgho) Eléments de contenu du Cours 9 6) Les principales maladies des légumineuses (arachides, haricot) 7) Les principales maladies des racines et tubercules (pomme de terre, manioc, igname, macabo et taro) 8) Les principales maladies des cultures légumières (tomate, choux, céleri, aubergine) 9) Les principales maladies des plantes oléagineuses (palmier à huile et cocotier) 10) Les principales maladies des plantes de caoutchouc (hévéa) 11) Les principales maladies des plantes textiles (coton) 12) Les principales maladies de post-récolte / post-harvest diseases 10 Partie II : Les principales maladies forestières 13) Les principales maladies des semences et des plantules forestières 14) Les principales maladies du bois et des arbres forestiers 15) Les principales maladies de quelques PFNL (Biter cola, Monodora myristica, Afrostyrax lepidophyllus, Aframomum melegueta, Gnetum africanum/eru, cola, njanssang, poivre, aiélé) Conclusion et perspectives de recherche 11 CHAPITRE 1: LES PRINCIPALES MALADIES DES SEMENCES La semence est une graine ou par extension tout organe de reproduction végétative (boutures, bulbes, tubercules, etc.) choisie pour être semée ou plantée. La graine est formée de l’extérieur vers l’intérieur par une enveloppe protectrice nommée tégument, entourant un tissu de réserves nutritives (albumen/cotylédons) et l’embryon. L’embryon quant à lui peut être minuscule et est constitué de quelques cellules, à savoir, gemmule développée en tigelle et radicule développée en racine 12 1) Les fontes de semis Agent causal : Différents champignons sont à l’origine de la maladie en fonction des régions, du sol et du type de plantes. Ce sont : Fusarium, Rhizoctonia, Pythium et Phytophtora. Symptômes : La base de la tige s’affine et prend une couleur rouge ou brune. Les plantes se dessèchent et s’affaissent avant de se nécroser. Toutes les plantes semées peuvent être touchées notamment carotte, chou, 13 Importance économique : La fonte de semis cause des sévères pertes en pépinières et en effet réduit le rendement. Epidémiologie: Les températures faibles et l’humidité favorisent le développement de champignons. La fonte de semis se propage très rapidement et peut affecter la totalité des semis. Méthodes de lutte: Utiliser un terrain sain ; Désinfecter l’outillage et le matériel de semis et de bouturage, ainsi que les graines ; Limiter l’arrosage ;  Traiter les semences en les trempant dans une solution a base de chaux, sel ou cendres de bois ; Planter en sol bien drainé et aéré pour un développement plus rapide des plants. 14 2) L’anthracnose Agent causal: Colletotrichum lindemuthianum Importance économique Les pertes de rendement sont attribuables aux feuilles qui vieillissent, aux plantes qui meurent prématurément, aux semences rabougries et à une teneur plus élevée en graine. Symptômes Apparition des lésions rondes ou angulaires sur les feuilles, les tiges et les graines. Ces lésions laissent paraitre un anneau noir distinct sur le pourtour. 15 2) L’anthracnose Epidémiologie Le champignon survit chaque année sous forme de spores ou lésions sur les semences. Le temps pluvieux est propice à la propagation de la maladie en raison du transport par le vent ou les eaux de ruissellement des éclaboussures d'eau chargées de spores qui proviennent des zones infectées. À la suite de périodes prolongées de temps pluvieux, les infections peuvent prendre des proportions épidémiques Méthodes de lutte Utiliser des semences exemptes de la maladie ; Traiter les semences avec des fongiques. 16 3) Les caries ou charbon Agent causal : Symptômes: Coloration brunâtre à noir la surface externe du grain. Odeur de poisson pourri. Méthodes de lutte Bruler les récoltes contaminées et détruire les pieds touchés ; Appliquer de façon homogène sur toute la surface des semences une quantité précise du fongique approprié ;  Nettoyer le matériel après la récolte. 17 3) Les bactérioses Xanthomonas translucens pv. translucens 4) Les viroses Virus Nom français Transmission AMV Virus de la mosaïque de la Luzerne Graine CMV Virus de la mosaïque du concombre Graine PVX et PVY Virus X et Y de la pomme de terre Graine TBRV Virus des anneaux noirs de la tomate Graine TRSV Virus des taches annulaires du tabac Graine 03/08/2021 18 CHAPITRE 2. LES PRINCIPALES MALADIES HÉBERGÉES PAR LE SOL / SOILBORNE DISEASES En productions végétales, le sol constitue le support de toute activité. En phytopathologie, un sol «conducteur ou favorable» est un sol qui hébergé les agents pathogènes susceptibles de causer les maladies aux cultures qui s’y trouvent. Sol suppressif? Les maladies transmises par le sol sont considérées comme une limitation majeure de la production agricole. Elles peuvent entraîner des pertes de rendement de 50 à 75% pour de nombreuses cultures. Agents pathogènes - Champignons : Fusarium oxysporum (agent de la fusariose vasculaire), (agent des nécroses racinaires), Thielaviopsis basicola (agent du pourridié noir du tabac), Phytophthora cinnamomi (agent de la pourriture des racines), Phytophthora infestans (agent du mildiou de la pomme de terre), Pythium myriotylum (agents de la pourriture des racines), Pythium ultimum (agent de fonte des semis), Rhizoctonia solani (agent du rhizoctone noir et de la pourriture du collet). 03/08/2021 19 Agents pathogènes - Bactéries : Streptomyces scabies (agent de la gale commune), Plasmodiophora brassicae (agent de la hernie des crucifères), Ralstonia solanacearum (agent du flétrissement bactérien) - Nématodes : Heterodera avenae (nématode à kystes des céréales), Heterodera schachtii (anguillule à kyste de la betterave), Radopholus simili (agent foreurs des racines du bananier plantain), Meloidogyne spp. (nématodes à galles), Criconemella xenoplax (nématode annelé). 03/08/2021 20 Astuces pour transformer des sols conducteurs en sols suppressifs : - rotation des cultures, - solarisation du sol et la désinfestation anaérobie des sols, - stérilisation à la vapeur du sol et les biofumigants, - utiliser les cultivars / variétés résistantes ou les plantes greffées Méthodes de lutte . Mesures préventives: l’hygiène agricole ( choix judicieux de la parcelle, rotation, jachère ordinaire, jachère améliorée, nettoyage des machines, enfouissement des résidus de récolte, attention aux engins agricoles et déplacement anarchique des animaux sauvages, etc.) . Fertilisation azotée modérée, ajuster le pH du sol . Lutte intégrée La distribution des agents pathogènes présents dans le sol est horizontale uploads/Sante/ cours-de-phytopathologie-speciale.pdf