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COURS EPIDEMIOLOGIE ANALYTIQUE L2 ENATSE ANNEE ACADEMIQUE 2021-2022 Dr HOUEHANO

COURS EPIDEMIOLOGIE ANALYTIQUE L2 ENATSE ANNEE ACADEMIQUE 2021-2022 Dr HOUEHANOU CORINE PARTIE I 2 SOMMAIRE Introduction ....................................................................................................................................... 3 1. Généralités ................................................................................................................................. 4 1.1. Définitions de concepts .................................................................................................... 4 1.2. Objectif analytique ........................................................................................................... 5 1.3. Mesure de l’évènement et de l’exposition ........................................................................ 5 1.4. Distinction entre études expérimentales et non expérimentales ....................................... 6 1.5. Principales études d’observation en épidémiologie analytique ........................................ 7 1.6. Principes de l’analyse brute et de l’analyse stratifiée ....................................................... 7 1.7. Précision ........................................................................................................................... 7 2. Etudes de cohortes ..................................................................................................................... 8 2.1. Principe ............................................................................................................................ 8 2.2. Schémas d’étude ............................................................................................................... 8 2.3. Sélection des groupes comparés ......................................................................................10 2.4. Calcul du nombre de sujets nécessaire ............................................................................10 2.5. Mesure de l’évènement dans les groupes exposé/non exposé .........................................11 2.6. Analyse des données .......................................................................................................11 2.6.1. Analyse brute ..............................................................................................................11 2.6.1.1. Tableau de contingence ..........................................................................................11 2.6.1.2. Estimation des mesures de fréquence de l’événement dans chaque groupe ...........12 2.6.1.3. Estimation de la mesure d’association ....................................................................13 2.6.1.4. Précision de la mesure d’association ......................................................................14 2.6.1.5. Stabilité de l'association .........................................................................................15 2.6.1.6. Présentation des résultats ........................................................................................15 2.6.2. Analyse stratifiée ........................................................................................................16 2.6.2.1. Recherche de la modification d’effet ou interaction ...............................................17 2.6.2.2. Recherche de la confusion ......................................................................................18 2.6.3. Mesures d’impact ........................................................................................................18 2.6.3.1. Différence de risque (DR) ou risque attribuable .....................................................19 2.6.3.2. Fraction (de risque) attribuable et fraction étiologique...........................................19 2.6.3.3. Nombre de cas attribuable ......................................................................................20 2.6.3.4. Synthèse .................................................................................................................20 3 Objectifs pédagogiques de l’UE Ce cours est destiné aux étudiants de la deuxième année de licence en santé publique à l’ENATSE ayant comme prérequis : Notions de base en bio-statistique Notions en épidémiologie descriptive Notions d’exposition et d’évènement L’objectif général est : utiliser les principes d’épidémiologie pour identifier les facteurs de risque (versus facteurs protecteurs) de problèmes de santé d’une communauté. A la fin du cours, l’étudiant doit être capable de : - Reconnaitre un objectif d’étude épidémiologique analytique - Distinguer les schémas des études d’observation analytique - Reconnaître les mesures d’association appropriées aux études d’observation analytiques - Calculer les mesure(s) d’association appropriée(s) aux études d’observation analytiques et les interpréter - Comprendre les notions de validité interne, validité externe et biais lors d’une étude d’observation analytique - Etablir la relation de cause à effet en épidémiologie analytique 4 Introduction L’épidémiologie analytique (encore appelée épidémiologie étiologique) permet d’identifier les facteurs qui influencent la survenue des problèmes de santé d’une communauté. - Voici quelques exemples de questions dans le champ de l’épidémiologie analytique : L’utilisation de pesticides est-elle liée à la survenue de la maladie de diabète chez les agriculteurs de coton dans la commune de Banikoara au Bénin ? - La survenue d’accident vasculaire cérébral est-elle favorisée par la consommation de tabac, en tenant compte des autres facteurs de risque connus tels que l’hypertension artérielle, le diabète sucré et l’âge ? - L’utilisation de contraceptifs oraux augmente-t-elle le risque de thrombose veineuse des membres inférieurs ? Pour y répondre, plusieurs schémas d'étude peuvent être proposés. Chaque schéma d'étude présente des avantages et des inconvénients. Chacun expose éventuellement à des biais différents (ou erreurs différentes). Enfin, l'analyse des données est différente selon le schéma d'étude. Néanmoins, quelques principes s’appliquent quel que soit le type d’étude. Dans ce cours, nous aborderons des notions générales à l’épidémiologie analytique puis approfondirons les principaux schémas d’étude d’observation en épidémiologie analytique. Tous les schémas d’étude utilisés en épidémiologie analytique reposent sur la comparaison de deux groupes (au moins). Par exemple, si on recherche le lien entre le tabagisme et le cancer broncho-pulmonaire, il est nécessaire de comparer l’incidence du cancer broncho-pulmonaire entre les fumeurs et les non- fumeurs. S’il est plus bas que chez les fumeurs de façon significative, alors on peut affirmer qu’il y a une association statistique entre le tabagisme et la survenue du cancer du poumon. 1. Généralités 1.1. Définitions de concepts Evènement : c’est le phénomène étudié lors d’une étude épidémiologique ; il peut s’agir de la maladie, du décès, d’un problème de santé, d’un comportement en rapport avec la santé. 5 Exposition : c’est un facteur ou une caractéristique qui influence la survenue d’un évènement. Il peut s’agir d’agent infectieux, de facteur environnemental, de comportement…etc. Facteur de risque : c’est un facteur qui augmente le risque de survenue d’une maladie ou de façon plus générale d’un problème de santé Facteur protecteur : c’est un facteur qui diminue le risque de survenue d’une maladie c’est un facteur qui augmente le risque de survenue d’une maladie ou de façon plus générale d’un problème de santé 1.2. Objectif analytique Lorsque nous recherchons les causes d’un problème de santé, le lien entre une exposition et un évènement, les facteurs qui influencent la survie ou la mortalité nous visons des objectifs analytiques ou étiologiques. Voici quelques exemples d’objectifs analytiques : - Identifier les facteurs de risque de pré-éclampsie chez les gestantes de l’hôpital X au Bénin - Etudier la relation entre l’utilisation de produits cosmétiques à base de corticoïdes et le cancer de la peau. - Etudier le lien entre la consommation de tisanes et l’insuffisance rénale chronique 1.3. Mesure de l’évènement et de l’exposition L’évènement, l’exposition ou les expositions doivent être clairement définis. Les moyens de mesure (questionnaires, mesures physiques, prélèvements…) doivent être présentés. Le choix de l’exposition ou des expositions doit être objectif, basé sur les mécanismes physiopathologiques ou de données d’études antérieures. En fonction de l'événement étudié, sa mesure (ou méthode diagnostique) fera appel à des entretiens, des données cliniques, biologiques, d'imagerie, des résultats d'autopsie…etc Le choix de l'événement mesuré est guidé par la question posée, mais la manière de le mesurer doit tenir compte d'autres paramètres. Il faut que cette mesure soit reproductible, sensible et spécifique. La définition et les moyens de mesure concernant l'exposition et l'événement doivent être identiques pour tous les sujets d'une étude donnée. On parle de définition et de mesures standardisées. 6 Les moyens mis en œuvre pour mesurer l'exposition et l'événement doivent être acceptables par les sujets participant à l’étude, et éthiquement recevables pour la communauté. Par ailleurs, il faut également tenir compte des contraintes pratiques et financières dans le choix de l’exposition et de l’évènement. 1.4. Distinction entre études expérimentales et non expérimentales Toutes les études épidémiologiques peuvent être classées selon qu'il s'agit d'une expérimentation ou non. - Etudes expérimentales : il s’agit des études dans lesquelles l'équipe réalisant la recherche maîtrise les conditions d'exposition des sujets (qui sera exposé, à quoi, comment, quand, où). On parle aussi d’essai clinique. L’affectation d'un sujet dans l'un ou l'autre des groupes comparés est tirée au sort (« étude randomisée »). Lorsqu'elles sont bien conduites, ces études représentent le schéma idéal pour étudier la relation entre une exposition à une caractéristique et la survenue d'un événement, puisque les groupes comparés ne diffèrent que par un seul caractère : l'exposition. Néanmoins, cette approche n'est pas toujours possible, souvent pour des raisons d'ordre éthique si l'exposition à laquelle un des groupes de sujets devrait être soumis est potentiellement dangereuse. Par exemple, comment proposer à des sujets de commencer à fumer pour étudier s'il existe une association entre le tabagisme et le cancer broncho-pulmonaire, en comparaison avec un groupe ne fumant pas ? - Etudes non expérimentales : l'équipe réalisant la recherche « observe » sans intervenir sur les conditions d'exposition des sujets étudiés. Ces études sont aussi appelées études d'observation. - Etudes quasi expérimentales : l'équipe réalisant la recherche ne maitrise pas entièrement les conditions d'exposition des sujets étudiés. La randomisation n’est pas possible. Exemple : évaluation de l’effet d’une campagne de sensibilisation contre la COVID-19 menée sur une radio locale dans une communauté. 7 1.5. Principales études d’observation en épidémiologie analytique Dans le cadre de l'épidémiologie analytique, les études de cohorte et les études cas-témoins sont les deux schémas classiquement utilisés, mais on recourt souvent également aux études transversales. 1.6. Principes de l’analyse brute et de l’analyse stratifiée La recherche des facteurs de risque/facteurs protecteurs des événements repose sur l'étude de l'existence d'une association entre l'exposition et l’événement. La première étape consiste à estimer des mesures de fréquence. Elles concernent soit l’exposition, soit l’événement selon le schéma d’étude. Puis, l’analyse se poursuit par l’estimation de mesures d’association, entre la/les expositions et le/les événements, les associations étant étudiées pour chaque couple {exposition, événement} s’il en existe plusieurs. On parle d’analyse brute. Pour mener à bien cette analyse, il est nécessaire de construire un tableau de contingence, correspondant à la répartition croisée des variables exposition et événement si celles-ci sont catégorielles. L’analyse stratifiée consiste à créer des strates à partir des catégories (classes) d’un facteur externe (tiers facteur) à la relation exposition évènement. Pour chacune de ces strates, il est nécessaire de construire un tableau de contingence et d’estimer la mesure d’association entre l’exposition et l’événement. 1.7. Précision Comme pour les moyennes, les proportions, ou encore les mesures de fréquence, les valeurs des mesures d’association obtenues à partir de tous les échantillons varient autour de la vraie valeur de cette mesure, selon un certain écart et une loi de probabilité connue. Détaillons à présent ce que cela implique pour une mesure d’association par exemple : La mesure d’association dans un échantillon représentatif de cette population, du seul fait uploads/Sante/ epi-anal21-l2-cours-i 1 .pdf